大家好，欢迎观看《时空日报》第343期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
皮肤T细胞淋巴瘤图谱揭示出，富含B细胞的肿瘤微环境支持着恶性TH2细胞的生长
Cutaneous T cell lymphoma atlas reveals malignant TH2 cells supported by a B cell-rich tumor microenvironment
Nat Immunol; IF: 27.700; DOI: 10.1038/s41590-024-02018-1
内容概要：
① 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）是一种极具威胁的T细胞克隆性恶性肿瘤，它主要侵袭人体的皮肤。CTCL中最为常见的一种形式是蕈样肉芽肿，然而其诊断过程颇具挑战性，经常会导致治疗的延误。为了深入探究这一疾病，科研人员对患者皮肤进行了详细的研究。
② 利用单细胞转录组学和空间转录组学的技术，对患者皮肤进行了分析，并与健康皮肤和炎症皮肤的人体皮肤细胞图谱数据集进行了综合比较。在研究中，科研人员发现恶性CTCL细胞共用了T辅助细胞2（TH2）的免疫基因程序，并构建了一个有利于其存活的肿瘤微环境。此外，他们还确定了MHC-II+ 成纤维细胞和树突状细胞在这一环境中扮演的重要角色，它们能够维持TH2样肿瘤细胞的生长。
③ 在空间分布上，科研人员观察到CTCL肿瘤细胞与B细胞在空间上紧密相连，形成了类似三级淋巴结构的聚集体。这一发现进一步揭示了CTCL的发病机制。最后，科研人员还在三个独立的患者队列中验证了B细胞在CTCL中的富集现象，并发现其与疾病的进展密切相关。这些研究成果为CTCL的诊断、疾病分期以及制定有效的治疗策略提供了重要的依据。
CTCL数据集概览及其与皮肤细胞图谱的比较
疾病研究：皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL），蕈样肉芽肿，scRNA-seq，空间转录组学，肿瘤微环境，树突状细胞; Li R, Strobl J, Poyner E, et al.; Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Hinxton, UK.
蟹类卵巢单细胞图谱为甲壳类动物卵母细胞发生提供新见解
A Single-Cell Atlas of Crab Ovary Provides New Insights Into Oogenesis in Crustaceans
Advanced Science; IF: 14.300; DOI: 10.1002/advs.202409688
内容概要：
① 在生物学的领域中，卵母细胞发生扮演着至关重要的角色，它为种群的延续提供了必要的物质基础。然而，尽管这一过程在甲壳类动物中同样关键，但关于其涉及的细胞类型、转变特性以及潜在调控机制，科学家们仍然知之甚少。
② 为了更深入地了解甲壳类动物的卵母细胞发生过程，研究人员采用了单细胞核RNA测序（snRNA-seq）技术，在泥蟹（Scylla paramamosain）中绘制了卵巢图谱。通过这一技术，他们成功鉴定出了五种细胞类型，包括生殖细胞、体细胞以及三种卵泡细胞类型。这些发现不仅为这些细胞提供了丰富的候选标志物，还有助于揭示细胞通讯在卵母细胞发生过程中的重要作用。研究人员通过分析不同细胞中配体-受体的特征谱，进一步证实了这一点。
③ 此外，研究人员还筛选出了从卵原细胞到卵母细胞发育轨迹中的数十种转录因子，以及与卵母细胞发生相关的体细胞和卵泡细胞中的关键分子/通路。这些分子/通路在进化上是保守的，但其潜在调控机制在不同生物类群中可能存在一定差异。为了验证这些发现，研究人员进一步验证了七个标志物的时空表达模式，并通过RNA干扰（RNAi）实验证实了piwi和VgR在卵母细胞发生中的关键作用。这些数据不仅有助于阐明无脊椎动物配子发生的机制，还为理解生殖策略的演化提供了新的视角。
泥蟹卵巢中snRNA-seq概述
生长发育：甲壳类;卵发生;snRNA-seq;转录因子 ; Lu L, Wang T, Liu A, Ye H. ; State Key Laboratory of Mariculture Breeding, Fisheries College of Jimei University, Xiamen, Fujian, 361021, China.
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审校 | 赵芳
题图 | 彭卫
排版 | 小飞鱼
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