大家好，欢迎观看《时空日报》第338期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
心脏、血液和肿瘤检查点心肌炎的免疫反应
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
Nature; IF: 50.500; DOI: 10.1038/s41586-024-08105-5
内容概要：
① 免疫检查点抑制剂作为一种广泛应用的抗癌疗法，虽然效果显著，但也可能引发一系列严重甚至致命的免疫相关不良事件，其中免疫相关性心肌炎（irMyocarditis）便是典型代表。关于这种心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫之间的具体联系，目前科学界尚缺乏深入了解。为了深入探究这一问题，研究团队开展了一项综合性分析。他们采集了28例免疫相关性心肌炎患者和41例未受影响个体的样本，并运用了单细胞RNA测序联合T细胞受体（TCR）测序、显微镜观察以及蛋白质组学分析等先进技术，对心脏、肿瘤和血液中的免疫反应进行了全面剖析。
② 在心脏组织样本的分析中，研究团队通过单细胞RNA测序结合多重显微镜技术，详细观察了84,576个心脏细胞。他们发现，与正常心脏组织相比，免疫相关性心肌炎患者的心脏组织中细胞毒性T细胞、常规树突状细胞和炎症成纤维细胞的频率显著增加，并且这些细胞在心脏组织内呈现出明显的共定位现象。这一发现揭示了心肌炎发病过程中特定免疫细胞的活跃状态和分布特征。
③ 此外，研究团队还对366,066个血细胞进行了深入分析。他们发现，在免疫相关性心肌炎患者的血液中，血浆细胞样树突状细胞、常规树突状细胞和B系细胞的频率明显降低，而其他单核吞噬细胞的频率则有所增加。同时，研究团队还对来自8名患者的52个心脏扩增TCR克隆进行了功能验证，结果显示这些克隆无法识别推定心脏自身抗原α-肌球蛋白、肌钙蛋白I或肌钙蛋白T。更重要的是，他们发现心脏组织中富集的TCR与配对肿瘤组织中富集的TCR在很大程度上不存在重叠。进一步分析发现，循环血液中CD8 T细胞群中存在的心脏扩增TCR与致命性免疫相关性心肌炎病例状态密切相关。综上所述，这些研究结果不仅揭示了驱动免疫相关性心肌炎的关键生物学机制，还为该疾病的诊断和治疗提供了潜在的生物标志物。
免疫相关性心肌炎中多种心脏内和血液细胞群的富集
疾病研究：持久性细胞，免疫检查点抑制剂，免疫相关性心肌炎，单细胞RNA测序，T细胞受体测序，心脏细胞分析，生物标志物，scRNA-seq; Blum SM, Zlotoff DA, Smith NP, et al.; Center for Immunology and Inflammatory Diseases, Department of Medicine, Massachusetts General Hospital, Boston, MA, USA.
耳蜗组织来源的小细胞外囊泡的分离与综合分析
Isolation and Comprehensive Analysis of Cochlear Tissue-Derived Small Extracellular Vesicles
Advanced Science; IF: 14.300; DOI: 10.1002/advs.202408964
内容概要：
① 小细胞外囊泡（sEVs）作为细胞间通讯的关键媒介，其重要性不言而喻。相较于体外环境下获取的sEVs，直接从组织中提取的sEVs（即组织源性sEVs）能更精确地映射出特定组织在体内释放的信号特征。以往关于sEVs在耳蜗功能研究中，多依赖于体外来源的sEVs作为研究对象。然而，本研究则另辟蹊径，对三种不同的耳蜗组织消化方法及耳蜗组织源性sEV（CDsEV）的分离技术进行了综合评估，并首次提出了采用胶原酶D与DNase І联合蔗糖密度梯度离心的新方法，作为分离CDsEVs的最优策略。
② 在此基础上，本研究还全面而深入地剖析了CDsEVs的组成成分及其潜在的细胞来源。通过运用小RNA测序和蛋白质组学分析技术，研究人员对CDsEVs中富含的microRNA（miRNA）和蛋白质进行了详尽的鉴定与分析。研究结果显示，这些miRNA和蛋白质在维持正常听觉功能方面发挥着至关重要的作用。尤为值得关注的是，CDsEVs中的成纤维细胞生长因子受体1（FGFR1）可能通过sEVs的介导，对耳蜗毛细胞的生存状态产生深远影响。
③ 此外，此研究还巧妙地结合了单个CDsEV测序与单细胞RNA测序的数据信息，对CDsEVs的细胞起源进行了更为精准的追溯。研究结果表明，不同类型的耳蜗细胞在分泌CDsEVs的数量上存在着显著差异，其中Kölliker氏器细胞和支持细胞分泌的CDsEVs数量尤为突出。这一发现不仅为深入理解耳蜗中CDsEVs的功能与特性提供了新的视角，也为未来的相关研究提供了宝贵的参考与启示。
CDsEV分离流程图
其他研究：FGFR1，耳蜗，毛细胞，miRNA，小细胞外囊泡，支持细胞，scRNA-seq ; Jiang P, Ma X, Wang X, et al.; State Key Laboratory of Digital Medical Engineering, Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, Zhongda Hospital, School of Life Sciences and Technology, Advanced Institute for Life and Health, Jiangsu Province High-Tech Key Laboratory for Bio-Medical Research, Southeast University, Nanjing, 210096, China.
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审校 | 赵芳
题图 | 彭卫
排版 | 小飞鱼
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