免费量子化学软件ORCA使用教程

学术   科学   2024-09-22 20:53   北京  

ORCA是免费的量子化学软件,能够计算分子的多种性质,并且在新版的ORCA 5.0版本中还对DFT积分格点和COSX积分格点进行了优化,支持的新代码SHARK也提高了运算效率。接下来我们介绍一下ORCA软件的基本运行流程。

无论是在Linux系统还是在Windows系统下,提交ORCA认为的方法都是类似的,在命令行中输入ORCA路径+输入文件(此处命名为md.inp)>输出文件(此处命名为md.out)即可运行。ORCA的输入文件与输出文件可以使用多种可视化软件打开,一个比较好用的图形化软件是Avogadro,可以直接在官网上免费下载,这个软件可以打开ORCA的输入与输出文件,并可以生成输入文件。

ORCA的输入文件是纯文本文件,文件名后缀为.inp,其中包括了计算的参数与分子信息,如下图是一个丙烷分子的输入文件:

第一行的!后面是任务的关键词,此处是一个DFT的结构优化,空一行后两个**之间就是分子的信息,xyz说明后面给出的是分子的笛卡尔坐标,0是分子的总电荷,1是分子的自旋多重度,这里丙烷没有单电子,自旋多重度为2s+1=1。

ORCA在完成计算任务后会输出一系列文件,其中对结构优化最重要的是out文件和xyz文件,xyz文件包含了优化后的结构,如果需要进行进一步的其他任务的计算可以在输入文件中直接引用xyz文件进行计算。out文件可以用Avogadro软件打开,如果计算了分子轨道就可以用Avogadro软件进行分子轨道可视化。
进行分子轨道计算的关键词如下:
! B3LYP D3BJ def2-TZVP(-f) def2/J RIJCOSX opt%outputPrint[P_Basis]2Print[P_MOs] 1end
除了进行计算的关键词,还可以使用命令指定计算时采用的核数与每个核分配的内存。
%maxcore 2000%pal nprocs 10 end
这里指定的核数是10,每个核分配的内存是2000MB,一般而言对于结构优化来说2000MB的内存分配足够了,核数可以安排用于计算的机子的配置来设置。

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