这次有活动参与——NC还是比较喜欢生信文章,不需小鼠实验,单细胞+免疫组化+RNAscope即可,常规验证思路

文摘   2024-11-09 07:00   北京  

  先介绍下活动内容,寻因生物和青椒医学联合创作的这本手册,还挺厚的,这可不是简单的教你怎么写国自然,恰恰相反,里面大篇幅的在讲解单细胞测序和空间组学的文献前沿,都是很新的文章,以及历年来组学的经典范文,讲解的很细致,包括方法介绍,主要解决的科学问题是啥?技术路线是啥?怎么解决的?很具有参考价值,读一本胜10本。他们给了我20本作宣传,大家在平论区自由讨论,到时候取点👍者最高的top20名,免💰送,截止至2024年11月14日晚上8点。

这不是我之前介绍的文献吗,这么新的他们也都录进去了

今日文献

根据最新发表在 Nature Communications 上的文章《癌症相关成纤维细胞亚型调控肿瘤-免疫微环境与皮肤癌恶性程度相关》,一项重要研究揭示了癌症相关成纤维细胞(CAF)在皮肤癌中的异质性及其在肿瘤微环境中的作用。这项研究由维也纳医科大学和卡罗林斯卡研究所的科学家联合开展,通过单细胞RNA测序技术和组织空间分析,深入探讨了CAF在基底细胞癌(BCC)、鳞状细胞癌(SCC)和黑色素瘤中的多样性及其功能。

研究背景

CAF长期以来被认为是癌症微环境中不可忽视的组成部分,其不仅在肿瘤进展中扮演重要角色,还会影响治疗效果。然而,CAF的多样性和功能尚未得到全面理解,尤其是在皮肤癌中的表现。本研究通过对多个皮肤癌样本的深入分析,首次揭示了CAF在不同皮肤癌中的亚型及其特异性功能。

样本和方法

研究团队从10例皮肤癌患者(包括4例SCC、3例BCC和3例黑色素瘤)和5名健康捐赠者的皮肤组织中采集活检样本,使用Smart-seq2单细胞RNA测序技术进行高分辨率基因表达分析。此外,通过荧光原位杂交(FISH)和免疫组织化学染色,研究人员进一步验证了CAF亚型在肿瘤组织中的分布。

研究发现

  1. CAF的三种主要亚型

  • 肌成纤维细胞样CAF(RGS5+ CAFs):主要负责形成肿瘤-基质边界的致密细胞外基质网络,可能阻碍T细胞的浸润。

  • 基质CAF(mCAFs):主要合成胶原蛋白等细胞外基质成分,在低级别肿瘤中形成物理屏障。

  • 免疫调节CAF(iCAFs):主要存在于晚期肿瘤中,高表达细胞因子和趋化因子,促进免疫细胞的募集和激活。

  • CAF亚型与肿瘤恶性程度的关联:随着肿瘤恶性程度的增加,CAF亚型的分布模式发生显著变化。mCAF在低级别BCC和SCC中较为丰富,而iCAF则在高度侵袭性的黑色素瘤和晚期SCC中更为显著。

    1. CAF在肿瘤-免疫相互作用中的作用:iCAF能够通过分泌多种免疫调节因子(如IL6和CXCL8)来调节免疫细胞的活化状态,而mCAF则通过合成大量细胞外基质,可能在肿瘤巢周围形成屏障,限制T细胞的浸润。

    2. 临床意义与未来方向:研究表明,靶向CAF亚型可能有助于提高免疫治疗的效果。尤其是iCAF在晚期肿瘤中的富集,提示其可能是潜在的治疗靶点。此外,mCAF通过构建细胞外基质屏障来限制免疫细胞进入肿瘤组织,这也为新的治疗策略提供了思路。

    结论

    该研究首次系统性地揭示了皮肤癌中CAF的异质性及其功能特征,进一步加深了我们对肿瘤微环境中CAF的理解。通过揭示CAF亚型在肿瘤进展和免疫调节中的独特作用,该研究为开发针对CAF的精准治疗策略提供了新思路。

    潜在应用

    这些发现为靶向CAF的免疫治疗提供了理论基础。例如,通过阻断iCAF的免疫调节功能,可能有助于提高T细胞对肿瘤的杀伤力。而对于那些通过mCAF形成物理屏障的肿瘤,联合使用基质降解酶或其他靶向基质的治疗方法,可能会增强现有免疫治疗的效果。

    Forsthuber, A., Aschenbrenner, B., Korosec, A. et al. Cancer-associated fibroblast subtypes modulate the tumor-immune microenvironment and are associated with skin cancer malignancyNat Commun 15, 9678 (2024). 

    生信钱同学
    北京大学在读博士生,记录自己的学习日常🌞分享生信知识:如单细胞和空间测序、多组学分析、宏基因组、病理组学、影像组学等生物信息学、机器学习和深度学习内容🌬
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