抗菌药是对细菌、真菌等微生物具有抑制或杀灭作用，如抗细菌药、抗真菌药。大环内酯类抗菌药物（除阿奇霉素外）如克拉霉素、红霉素、泰利霉素通常对CYP3A4/5和P-gp具有较强的抑制作用；唑类抗真菌药物如酮康唑、氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑、泊沙康唑对CYP3A4/5、CYP2C9和P-gp均有不同程度的抑制作用。
上述药物与降糖药、降压药、降脂药、抗血小板药、抗痛风药、镇静催眠药等联用时会有相互作用，需注意。
大环内酯类药物
DPP-4抑制剂：降糖药沙格列汀主要通过CYP3A4/5代谢，与CYP3A4/5强抑制剂如克拉霉素、泰利霉素合用时，能显著升高前者血药浓度，合用时沙格列汀的日剂量不超过2.5mg。
CCB类降压药：该类药主要经肝脏CYP3A4代谢，CYP3A4强抑制剂如克拉霉素能够显著其代谢，而增强降压效果，可能致严重低血压。
他汀类降脂药：脂溶性他汀类药物（辛伐他汀、洛伐他汀和阿托伐他汀）在体内主要通过CYP3A4代谢，与CYP3A4强抑制剂如克拉霉素、红霉素、泰利霉素合用显著减慢前者的代谢，增加横纹肌溶解风险，需谨慎或避免联用。
抗血小板药：替格瑞洛主要经CYP3A4代谢，CYP3A4强抑制剂如克拉霉素能减慢其代谢，增强抗血小板活性。
镇静催眠药：苯二氮䓬类咪达唑仑、三唑仑、阿普唑仑经CYP3A4代谢，与CYP3A4强抑制剂如红霉素、克拉霉素合用显著减慢其代谢，加强镇静催眠作用。
抗痛风药：秋水仙碱是P-gp底物，与P-gp强抑制剂如克拉霉素合用会致秋水仙碱肠道的外排减少，显著提高其生物利用度而增加不良反应。
氟喹诺酮类药物
1.碳酸钙或其他钙补充剂中的钙离子能和氟喹诺酮类药物如莫西沙星发生络合，致药物吸收障碍而易造成抗感染治疗失败。
此外，氟喹诺酮类药物也会与其他高价金属阳离子如Fe2+、Al3+发生络合而影响其吸收，致其血药浓度降低而抗感染治疗失败。
2.环丙沙星、依诺沙星可抑制CYP1A2，能显著减慢茶碱、咖啡因经CYP1A2的代谢，可能造成茶碱中毒，需谨慎。
碳青霉烯类药物
该类药与丙戊酸存在严重的药物相互作用，可致丙戊酸的抗癫痫作用丧失，应禁止合用。
头孢菌素类药物
某些具有甲巯四氮唑（MTT）结构的头孢菌素（如希刻劳）与乙醇（或含有乙醇的药品如藿香正气水）合用可能发生“双硫仑样反应”，应避免合用。
噁唑烷酮类药物
利奈唑胺是非选择性单胺氧化酶抑制剂（MAOI），与单胺类药物、5-羟色胺能药物（麦角碱类、氟西汀、帕罗西汀等SSRI）合用可能致5-羟色胺综合征，严重者可危及生命，需注意。
唑类抗真菌药物
磺脲类降糖药：该类药在体内主要经CYP2C9代谢，合用CYP2C9抑制剂如氟康唑可能减慢其代谢，增加低血糖风险。
DPP-4抑制剂：降糖药沙格列汀主要通过CYP3A4/5代谢，与CYP3A4/5强抑制剂如酮康唑、伊曲康唑合用时，能显著升高前者血药浓度，合用时沙格列汀的日剂量不超过2.5mg。
CCB类降压药：此类药主要经肝脏CYP3A4代谢，CYP3A4强抑制剂如伊曲康唑、氟康唑能够显著减慢其代谢，从而增强降压效果，可能致严重低血压。
他汀类降脂药：脂溶性他汀类药物（辛伐他汀、洛伐他汀和阿托伐他汀）在体内主要通过CYP3A4代谢，与CYP3A4强抑制剂如伊曲康唑、酮康唑、泊沙康唑、伏立康唑合用可显著减慢前者代谢，增加横纹肌溶解风险。
抗血小板药：替格瑞洛主要经CYP3A4代谢，CYP3A4强抑制剂如伊曲康唑、酮康唑等能减慢其代谢，增强抗血小板活性。利伐沙班通过CYP3A4、非CYP依赖代谢，与CYP3A4和P-gp强抑制剂如酮康唑、伊曲康唑、伏立康唑、泊沙康唑等合用，可能增加出血风险，不建议合用。
达比加群酯是P-gp的底物，与P-gp抑制剂如伊曲康唑合用显著提高前者的生物利用度，禁止合用。
镇静催眠药：苯二氮䓬类咪达唑仑、三唑仑、阿普唑仑需经CYP3A4代谢，与CYP3A4强抑制剂如泊沙康唑、伏立康唑合用显著减慢其代谢，加强镇静催眠作用。
非苯二氮䓬类唑吡坦经CYP3A4、CYP1A2代谢，CYP3A4强抑制剂如伊曲康唑能显著升高其的血药浓度，增强镇静催眠作用。
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