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图 1. 环境污染物的来源、聚类和代表性化合物。(A)环境污染物的来源和摘要。(B)半径 < 3 下的 1251 种环境污染物的聚类。(C)10 种污染物的代表性化合物。
图 2. 与 MMD2 结合的化合物及其结合模式。(A) 总共有 526 种化合物根据筛选标准和代表性化学物质与 MMD2 结合。(B) MMD2 结合口袋和与五种代表性化学物质的结合模式。
图 3. 与 10 个簇中的化合物结合的高结合蛋白的生物信息学分析。(A)与 10 个簇中的化合物结合的蛋白质数量。(B)与超过 5% 的化合物结合的蛋白质的 PCA 结果。(C)与超过 5% 的化合物结合的蛋白质的 KEGG 分析。
图 4. 通过 PCA 聚类的三组特异性蛋白质结合位点的结构分析。(A) 组特异性蛋白质结合位点中氨基酸组成的分类。(B) 组特异性蛋白质结合位点的二级结构组成。(C) PFAS 特异性蛋白质结合位点的结构聚类。(D) 从 PFAS 特异性蛋白质结合位点簇中鉴定出的代表性蛋白质。
主要发现
这项研究的创新点在于首次使用AlphaFold2预测整个人类蛋白质组的三维结构,并通过分子对接分析了1251种潜在内分泌干扰物质(EDCs)与蛋白质的相互作用。通过6600万次对接,发现约1.2%的结合结果具有强结合力。研究还发现,含有高比例带电氨基酸残基的蛋白质结合口袋更容易与PFAS等污染物结合,且PFAS比邻苯二甲酸酯类化合物与蛋白质的结合模式有显著差异。研究结果揭示了EDCs与蛋白质相互作用的潜在毒性机制,提出了这些化学物质对人类健康的长期风险。此外,基于该数据的KEGG通路分析进一步表明,这些高结合蛋白与化学物质可能对代谢、类固醇激素合成和神经传导等关键生理过程产生重要影响。
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