西湖大学胡奇/施一公等合作最新Science子刊

学术   2024-10-20 09:22   中国  


iNature

人类乙酰辅酶A(CoA)羧化酶(ACCs)催化乙酰辅酶A的羧化,这是脂肪酸合成的限速步骤。ACCs动态组织的分子机制在很大程度上是未知的。

2024年10月9日,西湖大学胡奇、施一公等Science Advances在线发表题为Filament structures unveil the dynamic organization of human acetyl-CoA carboxylase的研究论文,该研究确定了人 ACC1 在其非活性状态下的冷冻电子显微镜(EM)结构,它形成了独特的细丝结构并与乙酰辅酶A形成复合物。

该研究还确定了通过去磷酸化和柠檬酸盐处理激活的人ACC1的冷冻电镜结构,分辨率为2.55 Å。值得注意的是,当乙酰辅酶A缺失时,共价连接的生物素结合的位点距离乙酰辅酶A结合位点较远,这表明生物素结合和乙酰辅酶A结合之间存在潜在的协同作用。这些发现为人类ACCs的结构动力学和调控机制提供了见解。

生物非依赖性羧化酶(BDC)家族中的乙酰辅酶A(CoA)羧化酶(ACCs)催化乙酰辅酶A和碳酸氢盐之间的反应生成丙二酰辅酶A。该反应被称为乙酰辅酶A的羧化,是脂肪酸合成的第一步也是限速步骤,因此在脂质代谢中起着至关重要的作用。
ACC普遍存在于从原核生物到真核生物的生物体中。原核生物ACC是由生物素羧基载体蛋白(BCCP)、生物素羧化酶(BC)和羧基转移酶(CT)亚基组成的多亚基复合物。BCCP亚基首先在生物素-蛋白连接酶的催化下,在A/ VMKM基序的赖氨酸残基上被生物素化。然后,BCCP亚基与BC亚基结合。其中共价结合的生物素以碳酸氢盐作为羧基供体,以腺苷5'-三磷酸(ATP)作为能量源进行羧基化。最后,BCCP亚基重新定位到CT亚基,羧基化的生物素将其羧基转移到乙酰辅酶A上,完成整个催化过程。与原核ACCs不同,真核ACCs是单链蛋白,BC、BCCP和CT结构域依次排列。在每个真核ACC中,BC和BCCP结构域之间存在BC-CT相互作用域(BT),BCCP和CT结构域之间存在中心结构域(CD)。
人柠檬酸ACC和不含ACC的细丝的组装过程(图源自Science Advances 
磷酸化导致人类ACCs失活。柠檬酸盐是柠檬酸循环中的关键代谢物,通过与ACCs结合并调节酶内不同结构域的组织来激活人类ACCs。去磷酸化和柠檬酸盐结合在激活人类ACCs中具有叠加效应。在柠檬酸盐存在下,去磷酸化的ACC1形成细丝(ACC-柠檬酸细丝)。ACC-柠檬酸细丝的冷冻电镜(EM)结构,分辨率为5.4 Å,揭示了细丝(filaments)是由CD结构域介导的ACC1二聚体的组装形成的。ACC-柠檬酸丝中ACC1同型二聚体的结构与ScACC同型二聚体相似,表明真核ACCs具有保守的工作机制。
在这项研究中,作者从Expi 293F细胞中纯化了内源性表达的人ACC,并通过将纯化的ACC与底物孵育并测定其冷冻电镜结构,鉴定了一种以前未鉴定的ACC细丝(ACC-inact filaments,,其中“inact”指ACC的非活性状态)。在改进的分辨率下确定了ACC-柠檬酸细丝的冷冻电镜结构。结构分析表明,ACC1在ACC-完整丝中呈非活性构象。该研究表明人类ACC的组织是高度动态的,其动态受到各种调节剂的调节。


原文链接:
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ado4880#con6

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