主要结果：
1. 大多数质粒缺乏可识别的转移起始位点
研究表明，在38,057个细菌质粒中，仅25%的质粒具有可识别的转移起始位点（oriT），且这些oriT主要集中于少数常见家族。质粒被分类为接合性质粒、退化的接合性质粒、编码松弛酶的质粒和缺乏松弛酶的质粒。已知oriT在接合性质粒中的发现率不到45%，在其他类型质粒中的分布率更低。缺乏oriT的质粒往往更大，可能来自接合机制尚未被完全表征的分类群。即便在接合机制已被识别的分类群中，仍有大量质粒中的oriT无法被识别。这些结果表明，我们对大多数oriT的了解仍然有限。
2. 已知转移起始位点的共同特征
已知oriT多位于质粒的基因间区域，这些区域通常较大，且含有与oriT相关的nic位点和蛋白结合域。oriT与特定的MOB类型相关联，通常位于松弛酶基因的上游，距离较短。尽管大多数oriT遵循这一规则，但少数oriT位置异常，可能是由于插入或测量误差所致。oriT与松弛酶之间的距离取决于MOB类型和基因组结构。这些特征可用于搜索先前未被识别的oriT，尽管我们对大多数oriT的了解仍然有限。系统表征oriT与松弛酶的位置关系，有助于发现新的oriT家族。
3. RAM介导的生物能抑制是可调的，不依赖于外排泵，并影响对多种抗生素的耐受性
基于oriT位于松弛酶基因上游的推测，从大肠杆菌、肺炎克雷伯菌和鲍曼不动杆菌的质粒中提取非编码序列，并进行聚类分析。在1,133个序列中，220个序列被归为21个最有可能的候选oriT区域。这些候选oriT区域与pCONJ或pMOB特异性关联，且位于各MOB类型松弛酶的预期位置。大肠杆菌和肺炎克雷伯菌的oriT可能共享相同质粒家族，而鲍曼不动杆菌的oriT则几乎总是物种特异性的。候选oriT区域具有与已知oriT相似的特征，如nic位点和DNA发夹结构，且相似松弛酶的质粒对往往具有相同类型的oriT。系统发育分析显示，新发现的oriT区域补充了先前已知区域的分布，覆盖了几乎所有的MOB多样性。
4. 候选的oriTs已被确认是功能性的
为验证候选oriT的功能性，研究将9个推定oriT区域插入非转移克隆载体，并转化到大肠杆菌中。结果显示，6个oriT区域成功回收接合子，包括来自大肠杆菌、鲍曼不动杆菌和肺炎克雷伯菌的oriT。部分质粒显示出较高的接合效率，其中来自鲍曼不动杆菌的三个oriT在接合实验中表现突出。值得注意的是，未观察到阴性对照的接合子。此外，添加推定的辅助基因到与MOBQ相关的oriT中，在某些情况下提高了接合率，但在其他情况下无改善。这些结果证实了候选oriT的功能性。
5. 接合动员大多数质粒
研究在38,057个质粒中搜索了21个未识别的oriT家族，发现2,975个质粒中包含3,072个推定oriT，其中98%之前未被识别。通过结合已知oriT，可在超过80%的目标复制子中鉴定出它们。在肺炎克雷伯菌和鲍曼不动杆菌中，包含推定oriT的质粒比例显著增加。一些包含oriT的质粒家族编码了许多抗生素耐药基因。然而，仍有部分质粒缺乏可识别的移动机制，其中一些可能是通过基因丢失由更大的质粒演化而来，一些非可转移质粒家族的存在也表明存在其他未知的移动性机制。
文中图表：
