数据分析 | 微生物宏基因组数据组装、分箱等高级分析如何可视化?

文摘   2024-10-22 09:02   瑞士  
什么是宏基因组?

宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,以特定生境中的整个微生物群落为研究对象,采用高通量测序技术,获得环境微生物基因组信息总和,以研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路等。

宏基因组测序技术是进行微生物资源开发利用、加速微生态科研深度研究的重要手段。随着高通量测序技术的普及,越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。为此组学大讲堂特制作了举办《微生物宏基因组分析实操》直播培训(10月28日-30日),手把手教你宏基因组原始数据的分析。

课程优势

优势1:内容丰富,从linux基础到测序数据处理,再到微生物宏基因组分析等主流分析内容一课尽揽。课程针对0基础学员设计,多年课程优化,尽量合并操作环节,分析代码已经封装好,整理好数据,复制粘贴即可分析自己的数据,既降低了分析难度也缩短了培训时间;
优势2:课程针对宿主的去除有详细的讲解。针对数据组装讲述了megahit,spades等软件。针对高级分析-分箱,我们的课程借助metawrap的优化模块,讲解了3种主流的分箱软件(metabat,maxbin,concoct),并讲解了如何通过GTDB数据库得到基因组物种注释和对应的进化树;
优势3:采用先进的docker虚拟机去教学(国内首创),无需担心安装生信软件、配置分析环境等难题,不同操作系统下分析步骤基本一致,真正的能学会,能用起来;
优势4:云服务器上教学,不用苦恼电脑配置不足、家庭版电脑系统不兼容问题,发送指令由服务器分析(非全部环节),自己电脑仍可正常办公;
优势5:建立了专门的生物信息知识问答社区,已经累计解决了数千个生信学习相关问题,结合学员QQ群持续为您学习提供技术支持;
优势6:为满足广大研究者对“颜值”的追求,我们紧追最新宏基因组分析文献中图表呈现的新趋势,不断尝试新的绘图R包和程序,生成了更炫并且信息量更多的图表,可以直接用于文章撰写。下图为本课程实际生成图片

本期课表如下:

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常见问题解答

1. 集中3天培训是否可以学完这么多内容?

答:多年课程制作经验,尽量合并操作环节,分析代码已经封装好,整理好数据,复制粘贴即可分析自己的数据,大大降低了分析难度,3天完全可以学完以上分析内容。

2. 培训后提供回放吗?

答:直播结束,不是学习的结束,课后可以获得回放视频,年内不限次观看,售后交流群结合问答社区提供答疑服务。分析所用软件、代码、课件、笔记均会提供,另外赠送组学大讲堂云服务器3个月的使用权限,学员课后仍可方便的进行练习。

3. 培训的时候是在云服务器上,如果换了设备,分析步骤还一样吗?

答:组学大讲堂培训采用先进的docker虚拟机,无论在什么设备上,凡是使用我们提供的镜像,均可保持一致的操作环境,真正的能学会,能用起来。

4. 能否提供发票?

答:由北京组学生物科技有限公司提供正规发票。

举办时间、费用、报名方式

1. 举办时间:2024年10月28日-10月30日(三天),每天授课7-8小时

2. 授课方式:线上直播

3. 培训费用:

原价2780元/人,限时优惠2680元/人

团报优惠:2人及以上减200元/人。

4. 优惠信息:

① 赠送价值700元组学大讲堂云服务器3个月使用权;

② 团报优惠:2人及以上减200元/人

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