吕建林说结石(47):黄嘌呤尿症

健康   2025-01-27 15:19   江苏  


黄嘌呤氧化还原酶(XOR)是一种酶,可在嘌呤代谢中催化从次黄嘌呤到黄嘌呤以及从黄嘌呤到尿酸的两步反应的酶。XOR通常携带脱氢酶活性(XDH),但在各种病理生理条件下转化为氧化酶(XO)。通过对哺乳动物XOR的诱变研究和XOR-抑制剂相互作用的结构分析,已经对XOR的复杂结构和酶促功能进行了很好的研究。目前,三种XOR抑制剂被用作高尿酸血症和痛风疗法,但也有望具有尿酸还原以外的潜在作用,例如抑制XO生成的活性氧。孤立的XOR缺乏症,I型黄黄嘌呤尿症,是XOR抑制剂代谢作用的良好模型。它的特征是低血症,尿酸排泄明显减少,血清和尿黄嘌呤浓度升高,但无临床明显症状。黄嘌呤尿症的发病机制以及突变与XOR活性之间的关系有助于阐明XOR的生物学作用以及XOR反应过程的细节。

     

   黄嘌呤氧化还原酶(XOR)催化次黄嘌呤转黄嘌呤和黄嘌呤转尿酸,后者为嘌呤代谢终产物。XOR有两形式:黄嘌呤脱氢酶(XDH)和黄嘌呤氧化酶(XO),分别产生NADH或活性氧(ROS)。人类因缺乏尿酸氧化酶易患高尿酸血症和痛风,XOR是治疗靶点,常用药物包括别嘌呤醇、非布索坦等。抑制剂还可能通过减少ROS产生额外降尿酸作用。

     XOR抑制剂的作用与孤立XOR缺陷(I型黄嘌呤尿症)相似,有助于研究其代谢影响。这是一种罕见的遗传病,表现为尿液中黄氨酸过多。通常无症状的患者因血清尿酸水平低(<1 mg/dl)而被诊断。尿酸生成抑制导致尿酸前体黄嘌呤(甲黄嘌呤和黄嘌呤)增加,但低量存在于血清中,因为它们是HPRT酶的底物。尿液中黄嘌呤排泄增加是因为鸟嘌呤被GDA酶代谢为黄氨酸。

     黄嘌呤溶解度低,易形成结石,但症状不严重。黄嘌呤尿症自1954年发现以来已有150多例。Ichida等在1997年鉴定出异黄素尿症患者的突变,黄原尿症也有多个突变报道。这些突变分析有助于理解XOR的生理作用。本文综述了XOR的反应机制、抑制剂、缺乏症及突变与酶活性的关系。


图1。

嘌呤代谢。

2. 异或的整体结构

     XOR 是一种 300 kDa 的大蛋白质,由约 1330 个氨基酸和 2 个约 150 kDa 的亚基组成。每个亚基由三个结构域组成:一个包含两个 [2Fe-2S] 簇 (20 kDa) 的 N 端结构域、一个包含 FAD (40 kDa) 的中间结构域和一个包含钼辅因子 (Moco) 的 C 端结构域( 85 kDa)(图2)。连接每个结构域的接头肽由大约 60 个氨基酸组成。XOR 在组织中以 XDH 形式存在,并使用 NAD+ 作为电子受体,但哺乳动物酶将其转化为 XO 并使用 O 2作为电子受体

图 2.

在新选项卡中打开

人类异或的分子结构。数据由蛋白质数据库(PDB,ID:2E1Q)生成。人类异或的同二聚体结构用一个亚基作为带状模型,另一个作为空间填充模型来说明。N 端(浅蓝色)、中间端(粉色)和 C 端(深蓝色)结构域分别包含两个 [2Fe-2S] 簇:FAD 和 Moco。显示了 Fe/S 结构域和 FAD 结构域(红色)之间的连接体、FAD 结构域和 Moco 结构域(浅绿色)之间的连接体以及 C 端肽(黄色)。域结构的示意图以相同的颜色显示在底部。辅因子排列如右图所示。

催化羟基化反应的关键位点是C端85 kDa结构域中的MOCO。MOCO含有一个钼原子,与两个硫原子结合。钼在氧化态多样,氧化型XOR中为MO(VI),酶还原时转变为MO(IV)。氧化态下,钼通过硫化物、氧和羟基进一步配位;还原态下,Mo = S被Mo sh取代。图3显示了MOCO和底物结合位点周围氨基酸残基的空间排列,这些残基(ARG881、GLU803、GLU1262)在不同物种中高度保守,参与反应机制。

图3。

在新选项卡中打开

尿酸与XOR的结合模式以及黄嘌呤与尿酸的羟基化机制。(ab)与XOR结合的晶体结构(PDB ID:3AMZ)。(C - F)黄氨酸对尿酸的羟基化方案。

      N末端20 kDa域含Fe/Si和Fe/S II两种[2FE-2S]聚类中心,分别与α-螺旋结构域的CYS-XAA2-CYS和N-Terminal-CYS-X-CYS-X-CYS序列结合。Fe/Si和Fe/S II在氧化还原电位和EPR信号上不同,后者电位更高。电子通过Fe/Si和Fe/S II传递至钼,孢子蛋白环参与电子转移。FE/SII与FAD靠近,Fe/Sii在酶更新中调节FAD反应性。中央40 kDa域含FAD和NAD结合位点,FAD位于深裂口中,NAD可访问FAD。Phe337与人序列中异咯嗪环平行,附近有Arg335、Trp336、Arg427、Phe550组成的簇,主要通过π-阳离子相互作用结合。Asp429比Arg426更接近黄素。这些区域参与XDH到XO的转化。

3. 尿酸生成的反应机理

       黄嘌呤羟基化机制需知XOR抑制剂与酶复合物晶体结构。黄嘌呤与氨基酸残基形成氢键,C8朝向钼。C2的C=O与Arg881作用,Glu803质子化,与N7的NH和C6的C=O形成氢键。Glu1262从Mo-OH获质子,与黄嘌呤N9形成氢键。N7和N9间氢键促进Mo-O-对黄嘌呤C8位亲核攻击,H−移至Mo=S变为Mo-SH。两电子转移至钼,Mo(VI)还原为Mo(IV)。形成反应中间体Mo(IV)-OC后被尿酸取代,Mo(IV)重新氧化为Mo(VI),电子经Moco、Fe/SI、Fe/SII和FAD快速转移,最终还原NAD+或O2产生NADH、O2-或H2O2。

4. 抑制剂的抑制机制

别嘌醇具有一种结构,其中低黄嘌呤的C8和N7互换(图4 A)。因为它具有嘌呤骨架,因此由XOR和醛氧化酶(AO,EC:1.2.3.1)羟基羟基羟基化,并被其他嘌呤代谢酶(例如HPRT和Purine核苷磷酸化酶(PNP,EC:2.4:2.4)代谢.2.1)[ 32 ]。别嘌呤醇作为酶的自杀底物,XOR抑制的机理如下所述。别嘌醇的C2是羟基化并转化为黄墨醇的。在反应过程中,瞬时生成的Oxypurinol的Mo(IV)和N8形成共价键(图4 A)[ 33,34]。在此过程中,奥昔嘌呤醇被认为通过在底物结合袋中旋转而有效地形成复合物。与黄嘌呤一样,氧嘌呤醇与 Glu803、Arg881 和 Glu1262(人)形成氢键(图 4 A)。

图 4.


与牛XOR结合的抑制剂的晶体结构。人序列显示在括号中。(a)别嘌醇和黄嘌呤醇的化学结构,以及黄墨啉醇与周围氨基酸残基的相互作用(PDB ID:3BDJ)。(b)Febosostat的化学结构以及Febosostat与周围氨基酸残基和空间填充模型的相互作用(PDB ID:1N5X)。(c)托托略替托特的化学结构以及托托洛克斯托特与周围氨基酸残基和空间填充模型的相互作用(PDB ID:1V97)。

非布索坦分子大于别嘌呤醇,无嘌呤骨架,临床优势在于不影响其他嘌呤代谢酶。其结构含噻唑环和苯环,适应酶结构。非布索坦与酶形成离子键、氢键、π-π相互作用及范德华相互作用,但不与钼共价结合。Febosostat中的CN组与ASN769形成氢键,远离活性中心。其抑制作用强,动力学模式为混合抑制。Topiroxostat为自杀底物抑制剂,其C原子与钼形成共价键,稳定结构,不易裂解。其CN组、氮原子与酶残基形成键合,三唑环与Phe915和Phe1010有π-π相互作用,是混合抑制剂,结合别嘌呤醇和非布索坦特性。

5. XOR 抑制剂的潜在影响

阿罗嘌呤醇和Febosostat的心血管安全性是国际关注的焦点。2018年CARES研究显示,Febosostat相较于别嘌呤醇有更高的全因死亡率和心血管死亡风险,引发FDA警告。但后续研究对此提出质疑,2020年快速审判研究认为非布索坦与别嘌呤醇心血管安全性相当。有观点认为XOR抑制剂可能减少心血管损伤和死亡。CARES试验中多数死亡发生在停药后。XOR抑制剂改善心血管疾病的报道基于其与氧化应激的关联。XDH在特定条件下转化为XO产生ROS,具有多种生理病理作用,包括防止感染和缺血再灌注损伤。XOR的XDH形式具有NADH氧化酶活性,产生ROS,可能参与组织损伤。在心血管系统中,XOR参与NO产生,是有效的血管扩张剂。低氧条件下XO降低2具有组织保护作用。未清除的ROS会产生过氧亚硝酸盐(Onoo-),导致内皮功能障碍。因此,在氧化应激期间使用XOR抑制剂可能具有保护作用。但过低的血清尿酸水平与不良生物学效应相关,尿酸作为抗氧化剂和自由基清除剂对氧化应激损伤有保护作用。目前无证据表明现有XOR抑制剂会造成氧化应激损害。对XOR缺陷患者的分析有助于阐明这些机制。

6. XDH 到 XO 的转换

    XDH到XO的可逆转化涉及Cys536间形成二硫键,不可逆转换包括蛋白水解和Helix531-535的损失。这导致溶剂门开启,A环移动阻止NAD+接近,FAD周围静电环境变化增加其与氧气反应性。C末端肽参与转化,影响NAD结合和构象稳定。XO ki小鼠肿瘤生长更强,可能促进软骨细胞矿化和骨关节炎病理性钙化。

图 5.

在新选项卡中打开

参与 XDH 转化为 XO 的氨基酸簇的晶体结构。FAD 辅因子周围的活性位点结构。( A ) 人 XOR (PDB ID: 2E1Q)、( B ) 大鼠 XDH (PDB ID: 1WYG) 和 ( C ) 大鼠 XO (PDB ID: 4YTZ)的晶体结构。

7. 异或的缺陷

      XOR缺陷分为三型:I型(OMIM #278300)是孤立XOR缺陷;II型(OMIM #603592)由MOCOS缺乏引起,导致XOR和AO双酶缺乏;III型(OMIM #603707)由钼蝶呤生物合成途径酶缺乏引起,导致XOR、AO和SO三酶缺乏。MOCOS通过向Moco添加硫原子激活XOR,而SO活性在II型中不受影响。XOR和AO的硫配体需在成熟步骤中添加。

图 6.

XOR 缺陷和 Moco 的生物合成途径。Moco 和 XOR 缺陷类型的分类分别显示在左侧和右侧。参与 Moco 生物合成的酶以红色显示。导致 Moco 缺陷的突变已在 MOCS1(A 型)、MOCS2 或 MOCS3(B 型)基因中发现,但在 GPHN(C 型)中很少见。显示了SO、AO和XOR的域结构以及Moco的最终成熟度。与 Mo 配位的原子显示在紫色框中。

I型和II型黄嘌呤尿症表型相似,难以临床区分,发病率约1/69,000。III型表型不同,易区分。III型缺陷导致硫酸盐氧化异常,亚硫酸盐在体内积累,表现为尿液中亚硫酸盐增多、大脑硫酸盐积聚,引发神经系统症状、发育延迟和晶状体脱位。

8. 检测到的基因异常

XOR存在多种突变和SNP,主要在Moco结构域。表1和图7显示了氨基酸突变位点。人类XOR为1333个氨基酸,但无义突变产生截短蛋白。Arg228Ter突变患者XDH mRNA正常,无酶蛋白。错义突变导致完全折叠蛋白,但催化残基突变可能致活性丧失,即使非直接相关也可能影响构象而部分失活。

表 1.

XOR 的突变位点。

领域变体表型
铁/硫
外显子 2–4 缺失 (~11 kbp)黄嘌呤尿症,1 型
p.Cys48Leufs*12黄嘌呤尿症,1 型
p.Gln102Arg黄嘌呤尿症,1 型
p.Thr117Ser硫嘌呤不耐受
p.Arg149Cys黄嘌呤尿症,1 型
对半胱氨酸150苯丙氨酸黄嘌呤尿症,1 型

链接器
p.Gly172Arg高血压
硫嘌呤不耐受
p.Pro214Glnfs*4黄嘌呤尿症,1 型
IVS8ds + 1 G > T黄嘌呤尿症,1 型
FAD
p.Arg228*黄嘌呤尿症,1 型
p.Leu305fs*1黄嘌呤尿症,1 型
p.Trp478*黄嘌呤尿症,1 型

链接器
p.Pro555Ser活动减少
p.Ala556农奴*15黄嘌呤尿症,1 型
Moco
p.Arg607Gln活动减少
p.Thr623Ile活动减少
p.Ser624*黄嘌呤尿症,1 型
p.Ile703Val活动增加
硫嘌呤不耐受
p.Lys722*黄嘌呤尿症,1 型
p.Arg825*黄嘌呤尿症,1 型
p.Arg830Cys黄嘌呤尿症,1 型
p.Thr856Lysfs*73黄嘌呤尿症,1 型
p.Arg881*黄嘌呤尿症,1 型
p.Asn909Lys活动减少
p.Thr910LysXDH缺乏症
p.Thr910Met黄嘌呤尿症,1 型
p.Arg913Trp黄嘌呤尿症,1 型
p.Arg913Gln硫嘌呤不耐受
p.Ala932Thr高血压
p.His1044fs*12黄嘌呤尿症,1 型
p.Asn1109Thr高血压
p.Pro1150Arg活动减少
p.Ile1179Thr黄嘌呤尿症,1 型
p.His1221Arg活动增加
p.Arg1283Ter黄嘌呤尿症,1 型
p.Arg1296Trp活动减少
C端p.Cys1318Tyr活动减少


图 7.

XOR的突变位点。人XOR的Fe/S域(A),FAD结构域(B)和Moco结构域(C)显示为色带模型。Fe/S结构域与FAD结构域之间的接头显示在浅蓝色(a)中,FAD结构域和Moco结构域之间的接头显示在橙色(B)中,C-末端肽以黄色显示(c)。蓝色表示对酶功能很重要的氨基酸残基。突变位点以红色显示。绿色表示由GLN423-LYS433组成的A环。

      Fe/S结构域的错义突变影响Fe/S簇形成,可能导致电子转移异常。Arg149Cys突变(图7A)关联1型黄嘌呤尿症]。Cys残基突变导致活性丧失、单体不稳定及Moco缺乏,对蛋白质折叠、二聚体形成和Moco插入至关重要。Gln102Arg突变改变静电环境,可能破坏Fe/S簇结构,导致错误折叠。XOR参与硫嘌呤药物代谢,如6-MP,突变和抑制剂可能增加血药浓度和毒性。四个基因突变(Thr117Ser,Gly172Arg,Ile703Val,ARG913GLN)与硫嘌呤不耐受相关。Kudo等比较了XO突变体对黄嘌呤和6-TX的氧化活性,发现Arg149 Cys突变体对两者均无活性。Thr117Ser和Arg913Gln突变体可能影响活性降低,而Ile703Val突变体在黄嘌呤底物时Vmax高2倍,但在6-TX时低69.4%。His1221Arg和Ile703Val突变与活性增加相关,可能影响尿酸释放速率。哺乳动物和细菌XOR晶体结构相似,但抑制剂非布索坦的结合强度有差异。MD模拟显示细菌酶无法维持与抑制剂的结合。Gly172arg位于Fe/S结构域与FAD结构域连接处,与高血压相关。

     XOR涉及硫嘌呤药代谢,突变或抑制剂可增毒性。特定基因突变关联硫嘌呤不耐受。Kudo研究显示某些XO突变体影响黄嘌呤和6-TX氧化活性。特定突变可能降低活性或增尿酸释放速率。哺乳动物与细菌XOR结构相似,但抑制剂结合有差异。Gly172arg位点与高血压相关。进一步简化:XOR影响硫嘌呤药代谢,某些基因突变增毒性。Kudo发现特定XO突变体改变氧化活性。哺乳动物与细菌XOR结构相似但抑制剂作用不同。Gly172arg位点关联高血压。


9. 结论

    XOR是一种复杂的酶,含有辅助因子,参与尿酸和活性氧(ROS)的生成。晶体结构分析揭示了其结构与功能。黄嘌呤脱氢酶(XDH)转化的XO与高血压相关,黄嘌呤脑病是研究XOR抑制剂及其与结构功能关系的理想模型。目前用于治疗高尿酸血症和痛风的三种XOR抑制剂可能抑制ROS,NO产生,有望扩展至缺血-再灌注损伤和动脉粥样硬化等疾病。XOR抑制剂的组织保护机制需进一步探讨。


Sekine M, Okamoto K, Ichida K. Association of Mutations Identified in Xanthinuria with the Function and Inhibition Mechanism of Xanthine Oxidoreductase. Biomedicines. 2021 Nov 20;9(11):1723. doi: 10.3390/biomedicines9111723. PMID: 34829959; PMCID: PMC8615798.


医学镜界
金陵医学前沿动态
 最新文章