在家禽、家畜、灵长类动物等动物研究中，结合单细胞转录组技术是提分的不二之选。2024年禽畜单细胞前沿文章分享可戳往期：本期继续为大家分享单细胞测序在禽畜动物研究中应用的高分优秀文章，以供参考学习。基迪奥生物单细胞项目经验丰富，可针对不同客户的实际需求和样本情况，定制专属的个性化分析方案和发文策略，专业技术支持服务全程跟进，欢迎有测序意向的老师与我们联系。英文题目：Stem cell transplantation extends the reproductive life span of naturally aging cynomolgus monkeys
DOI：10.1038/s41421-024-00726-4间充质干细胞（MSCs）移植已被证明可以缓解病理性卵巢衰老。然而，目前尚不清楚MSCs是否有益于自然衰老的卵巢。该研究作者首先考察了中国女性围绝经期卵巢储备的动力学。使用自然衰老的食蟹猴（Macaca fascicularis）模型，发现将人类胚胎干细胞衍生的MSC样细胞（称为M细胞）移植到衰老卵巢中，可显著减少卵巢纤维化和DNA损伤，增强性激素的分泌并提高生育能力。一只健康的小猴子在M细胞移植后出生。单细胞RNA测序分析和体外功能验证表明，M细胞移植后颗粒细胞和基质细胞的细胞凋亡、氧化损伤、炎症和纤维化得到缓解。总而言之，这些发现证明了M细胞移植对衰老卵巢的有益影响，并拓展了对卵巢衰老和干细胞缓解这一过程的分子机制的理解。Fig1 scRNA-seq揭示M细胞移植后卵巢功能恢复的潜在调节网络和机制单细胞转录组和跨种比较分析揭示了猪睾丸在青春期的不同分子变化
英文题目：Single-cell transcriptomic and cross-species comparison analyses reveal distinct molecular changes of porcine testes during puberty
DOI：10.1038/s42003-024-07163-9猪是研究人类疾病的重要模型，也是重要的家畜，但其睾丸发育尚未充分探索。该研究使用单细胞RNA测序对巴马猪胎儿期到婴儿期、青春期到成年期多个发育阶段的转录组景观进行表征，并与人类和小鼠的进行比较。作者揭示了猪的减数分裂异常早地在出生后不久开始，并鉴定了一种与人类中鉴定的转录组状态0精原干细胞相似的猪精原干细胞亚群，之前认为这是灵长类特有的。作者还发现了出生后睾丸中持续存在的肌样细胞增殖前体。此外，探讨了Leydig细胞类固醇生成和雌激素合成在支持细胞谱系中的调节作用。总而言之，这项研究为猪睾丸发育提供了宝贵的见解，为未来在生殖生物学、农业育种的进步以及转化医学中的潜在应用铺平了道路。英文题目：Single nucleus RNA sequencing reveals cellular and molecular responses to vanadium exposure in duck kidneys
DOI：10.1016/j.jhazmat.2024.136492钒（V）暴露已知会诱发肾脏毒性，但其对肾脏细胞类型和分子机制的具体影响尚未完全理解。使用snRNA-seq以细胞分辨率表征了V对鸭肾细胞的影响。44天暴露后，免疫荧光分析显示肾间质中α-SMC表达显著增加，表明纤维化反应。snRNA-seq鉴定了肾脏内的12种主要细胞类型，组织成19个簇。观察到细胞组成的显著变化。差异基因表达分析突出了不同细胞类型中与V毒性相关的通路。此外，免疫细胞显示出T细胞受体和趋化因子信号通路的变化，表明免疫反应发生了变化。总而言之，这些发现有助于更好地阐明V诱导的肾损伤的致病机制。整合空间转录组学和snRNA-seq发现TGF-β对肌肉内脂肪沉积的特异性抑制作用
英文题目：Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
DOI：10.1007/s11427-024-2696-5肌内脂肪（IMF）是骨骼肌内的一种复杂脂肪组织，其形成因素尚不明确。在糖尿病、衰老和肌肉消耗等条件下，IMF异常沉积于骨骼肌，损害肌肉正常功能。该研究采用空间转录组（ST）和单核RNA测序技术，以不同IMF含量的猪背最长肌为样本，揭示了IMF的空间异质性。研究发现，TGF-β信号通路在IMF中高度富集，且在瘦猪和肥胖猪中，IMF产生的TGF-β1和TGF-β2不同。体外实验证实，模拟高脂环境下的猪内皮细胞释放更多TGF-β1。在肥胖小鼠中，TGF-β的添加抑制了IMF产生并减缓肌肉修复，而TGF-β抑制则加速肌肉修复。这些发现表明，TGF-β通路在调节IMF沉积和肌肉修复中起特定作用，为肥胖患者肌肉萎缩的治疗和管理提供了潜在靶点。Fig4 痩猪和肥猪背最长肌的snRNA-seq分析scRNA-seq揭示了疣鼻栖鸭法氏囊对鸭DRV感染的细胞类型特异性反应
英文题目：Single-cell transcriptional profiling reveals cell type-specific responses to duck reovirus infection in the Bursa of Fabricius of Cairna moschata
DOI：10.1016/j.ijbiomac.2024.136391鸭呼肠孤病毒（DRV）对鸭产业造成重大损失，但法氏囊对DRV感染的免疫反应尚不明确。该研究构建了HN10（一种新型 DRV）感染后疣鼻栖鸭法氏囊的单细胞转录组图谱，发现法氏囊中存在高度的细胞异质性，大多数与先天和适应性免疫系统相关的基因在T细胞、B细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞（DCs）中高度表达。HN10感染后，DCs和巨噬细胞比例增加，显示其在长期抗病毒反应中的重要性。感染后24h，许多免疫基因高度表达，显示法氏囊早期即具有强大免疫功能。NOD样受体和RIG-I样受体信号通路在感染早期激活，而Toll样受体信号通路在晚期激活。这些数据为理解法氏囊对DRV感染的免疫反应提供了单细胞水平的见解。恒河猴杜氏肌营养不良症模型的肌肉发病机制与严重的细胞缺陷有关
英文题目：Profound cellular defects attribute to muscular pathogenesis in the rhesus monkey model of Duchenne muscular dystrophy
DOI：10.1016/j.cell.2024.08.041杜氏肌营养不良症（DMD）是一种由DMD基因突变引起的进行性肌肉萎缩疾病。本研究利用恒河猴模型和单细胞RNA测序，分析了DMD病理条件下的细胞和分子变化。研究发现免疫细胞景观的变化、纤维脂肪祖细胞（FAPs）谱系进展方向的逆转，以及FAPs和肌肉干细胞（MuSCs）中的TGF-β耐药性。MuSCs表现出细胞固有缺陷，导致分化缺陷。这些发现为理解DMD的发病机制提供了重要见解，并为进一步探索潜在机制和开发治疗干预措施提供了宝贵的模型和数据集。基迪奥单细胞测序技术已经在医学和农学领域、模式和非模式物种、动物和植物上得到广泛应用，从细胞悬液制备到个性化分析服务，基迪奥都已积累了丰富的项目经验，欢迎有单细胞项目意向的老师扫描下方二维码填写信息，基迪奥为您定制单细胞解决方案。医学项目：020-84889324
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