细胞具有空间位置特性,才能行使正常的生命活动。空间转录组(ST)的出现可以获得组织形态学下的基因表达谱和空间位置分布,是目前应用最火热的空间组学技术,在CNS顶刊中备受科研人员青睐。ST各类检测技术也不断涌现,在过去5年中实现了高速发展(图1)。以肿瘤研究领域为例,发文量呈现出井喷式增长(图2),不难看出,在各大研究领域发表ST文章,是抢占先机的重要举措,更有发表高分文章的巨大潜力!随着空间技术捕获精度的进一步提升,当前以Stereo-seq和10X Visium HD为主的高精度空间转录组,更是为科研人员开启了空间细胞组学的新时代大门!相比转录组等常规组学研究,ST数据量庞大、数据分析晦涩复杂、分析思路多样化,让不少想要尝试的老师望而却步。别担心!基迪奥为大家精心准备了《空间转录组入门宝典》,从seurat脚本实操、下游数据绘图,到理论学习、实验方法介绍、高频Q&A、个性化分析详解又或是必备数据库使用,全部囊括其中,助力您由浅至深、层层递进,一站式完成从0到1的空转学习之旅!下面为大家浅浅分享下《空间转录组入门宝典》中有些什么吧!首先,为大家分享基于Seurat的空转实操R脚本,包含测试数据和完整PPT详解。
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