9月11日，“2024Omics前沿大会”在深圳华大时空中心举行，华大生命科学研究院正式官宣上线新版本时空转录组——“Stereo-seq V1.3”（下文称V1.3时空转录组）。
本次升级中，时空转录组继续保持“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的优势，并优化实验平台，使V1.3版本的时空转录组捕获性能大幅提升，不仅能在相同样本上检测到更多基因表达，还使实验方案的选择更加灵活、实验结果更加清晰。
目前该产品方案适配1 cm*1 cm以及0.5 cm*0.5 cm芯片，未来将兼容多尺寸芯片、多染色及多组学应用方案，满足科研人员的多样化需求。
V1.3时空转录组具体进行了哪些方面的升级呢，我们一起来看看吧！
V1.3时空转录组通过优化时空试剂、酶选择以及探针设计，V1.3时空转录组在FF样本上的捕获效率显著提升。在同组织相邻切片、相同数据饱和度下，统计了已测试的所有组织样本，Bin20 水平捕获的Median Gene Type提升比例中位数为149%、Median MID提升比例中位数为224%。
相同数据饱和度下，Stereo-seq V1.2数据和V1.3数据捕获到的基因中位数（左图）和MID中位数（右图）的比较（Bin20）。根据研发已测试数据统计。
透化试剂升级后，可以有效提升透化荧光信号强度，更有利于选择最佳透化时间。
H&E封片剂集成进试剂盒，同一套试剂盒即可满足多样化的研究需求。研究人员可在同一张切片上灵活选择ssDNA染色/ H&E染色，开展多模态数据分析及挖掘。
RIN值的质控要求调整为≥4，允许检测更多长期保存的降解度更高的样本，有助于利用质量较低的样本进行更多的空间探索。
分析软件包括Stereo-seq分析流程软件包（Stereo-seq Analysis Workflow, SAW）和StereoMap。升级后的分析工具安装配置和操作使用更简单便捷，交互友好性更强，可视化能力更丰富，可兼容所有第三方分割算法的结果，助力研究人员轻松完成数据分析，获得独特生物见解，为解析复杂组织结构提供有价值的信息。
全新升级的时空转录组FF V1.3，将继续助力研究人员以单细胞分辨率深入研究细胞基因表达的时空规律，为解析复杂生命进程、对抗疾病提供全新的方向和视角，促进胚胎发育、免疫研究、器官再生、脑科学、肿瘤微环境等研究取得更多成果。
联川生物全生态时空原位服务体系
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单细胞和空间转录组测序作为联川重点科研服务产品，目前已经搭建完成包括10x单细胞测序（ScRNA-seq、ScRNA-seq＆VDJ及ScATAC seq），10x空间转录组测序（Visium HD、CytAssist），10x Xenium及时空组学平台。联川生物实现从μm到nm，从区域到单细胞水平的全生态单细胞空间原位检测的布局。在样本制备和生物信息学分析，以及云分析平台方面充分发挥绝对优势，联川生物致力于为客户提供优质的服务。
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