1973年，邓公通过多次给中央写信，获得了复出的机会。在毛主席和周总理的安排下，他开始逐步主持国务院工作，大力实行内外整顿，这其实也是一道艰巨的考验。
所幸，邓公交出了一份满意的答卷，在他的努力下，工业、商业、农业等方面有了很大的改善，中央又把整顿军队的任务交给了他。
1975年1月5日，中央发布一号文件，邓公兼任了中央军委副主席兼解放军总参谋长，他多次召开军委会议，说必须要革除军队的肿、散、骄、奢、惰等问题。
同时邓公还是很重视尖端科技，特意把开国上将张爱萍“解放”了出来，让他继续主持国防科委。
那个年代大运动是波及到了各个层面，张爱萍随后的推进工作其实很不顺利，是邓公和叶帅鼎力支持了他，直言“错了我们来负责”，这才让一些工程得以继续下去。
之所以让张爱萍来负责尖端军事科技，是因为他一直专注于这方面的，第一颗原子弹、研制导弹等，他就出力甚多，经常会到一线去查看情况。在国防建设上，还真没几个将军敢说比他更熟悉的。
只可惜在大运动开始后，张爱萍也受到了冲击，被囚禁长达六年之久，直到1973年3月，经叶帅多次跟组织申请反馈，张爱萍才重新担任国防科委主任。
虽然离开工作岗位数年，但张爱萍重新任职后还是满怀热情，他很快就召开了科委会议，直言“要尽快拿出武器装备上的‘杀手锏’来”，并制定了要在1977年搞出洲际导弹的计划。
要想实现这一目标，整个科委就必须拧成一根绳，不能再因各种运动耽误发展。
这一点其实很不容易，科委七机部核心230厂里有不少江王张姚的人，平时不事生产，只想着去抓别人的小辫子，这批人使得该厂的工作很长一段时间都陷入了停滞。
为了把这股歪风打下去，张爱萍决定亲自坐镇230厂，展开一次自上而下的全面整顿，务必要让生产秩序得到恢复。230厂“造反派”的头头叫舒龙山，他与王洪文来往密切，以往凭借这层关系，他批了很多调来的领导。
张爱萍刚到230厂时，就看到很多醒目的大标语，有些还是冲着他来的，但他没有在意，而是召集干部们开会，要求大家全速搞生产，不能随意就撂挑子。
他指出：现在的七机部是有事没人干，有人没事干，有人有事没法干！如果有人肆意妄为，那就直接搁置，别干了。
舒龙山这种靠“造反”起来的工人，当然比不上百战将军的气场，所以他不敢跟张爱萍对着来，表面上做了检讨，说自己一定改正。背地里却对张爱萍特别留意，拼命想要找点错来借题发挥。
有一次职工大会，张爱萍对于工人们生疏的手艺、整体的环境痛心疾首，说现在的情况没有以前好，建国初期大家还能朝着一个目标前进。他的这个说法是比较客观的，然而真要想挑刺，怎么都能找到角度。
舒龙山转头就开始污蔑，说张爱萍这是攻击眼下的大好形势，他多次骂人，有转“右”的倾向。对于这种说法，张爱萍只是一笑置之。
为了把事情闹大，舒龙山带着一群人开始到处张贴大字报，胡乱扣了很多帽子，最终还真的闹到上面去了。
邓公以及叶帅听闻此事后找到了张爱萍宽慰，邓公说：要勇敢大胆地去做，不要怕说错话。 说话有错误，这不要紧，错了就改了！只要你大胆工作，错了我和叶帅负责。大字报贴个一万张也别怕， 只要留在七机部，没有被撵走，就呆下去，不要怕抓小辫子。
叶帅在一旁也呼应道：我完全同意，我支持你们的工作， 军委的同志都支持你们的工作。
有两位领导支持，张爱萍就更有动力了，他带着工作组抵制派性人物，一开始是出于团结的目的，好好劝诫了舒龙山。然而对方始终我行我素，给生产增添麻烦，张爱萍便在审定调出名单时，把舒龙山也加了上去。
这个消息传出去后，王洪文找到了张爱萍说：舒龙山是我的朋友，希望你能支持他的工作， 团结他一起工作。张爱萍对此没有理会。
然而不是所有人都像张爱萍一样坚定，后来工作组的一些人就被王洪文给威慑住了。
舒龙山眼看自己要被调出去，立即写了封信给中央，说张爱萍在推行今不如昔的右倾机会主义路线。上级单位派人去与张爱萍谈话，询问他今不如昔是什么意思？
张爱萍回答：我从来没有说过“今不如昔”这个词，但是，现在七机部给我的感觉就是这个意思，你去看看，七机部现在的状态是不是比不上过去的老五院？这一点大家都可以看得到。约谈人员不置可否，只是完整地汇报了上去。
然而，后来七机部被煽动起来批张爱萍，工作组里张爱萍的搭档跳了出来配合批判，这就使得张爱萍的处境变得糟糕。
1975年底， “反右翻案风”愈演愈烈，没多久张爱萍被迫再次靠边站，眼看自己辛辛苦苦花了数月整顿出来的结果被毁于一旦，他的心情万分失落，很快就病倒住院了。
得知这个情况，邓公和叶帅都很关心，携手去医院看望他。邓公还是很重视张爱萍的，他说：你不用担心，有人贴大字报说我是你的后台，这话他们说对，我就是你的后台，我当定了。邓公的话让张爱萍的心里总算好受了一些。
张爱萍被赋闲了年余，直到1977年3月叶帅重新主持军委，才委托徐立清邀请他出山。最开始张爱萍有些心灰意冷选择了拒绝。后来是叶帅亲自来找他，开门就见山：
回科委继续主持工作吧，本来两弹结合作洲际飞行，70年代中期就该实现。75年，我们没有做成，投鼠忌器嘛，但今天我们应该是可以。能大刀阔斧打开局面的，你张爱萍可以算一个，党在目前，尤其需要你这样的干部。
见组织如此重视自己，张爱萍最终还是选择继续为国家和人民服务，在80年代，我国的国防事业按计划洲完成了际弹道导弹试射、完成了通讯卫星的发射等等，这些成果，张爱萍有很大的功劳！
