Mol Cell综述|解读RNA驱动的生物分子凝聚(相分离)新视角

文摘   2024-10-05 23:19   新加坡  

      近年来,细胞内无膜的生物分子凝聚体已逐渐成为科学研究的焦点。这些液滴状的结构虽然看似简单,但它们却是细胞中许多关键生理过程的核心。在这场由纽约州立大学水牛城分校的Priya R. Banerjee教授领衔的研究综述《RNA驱动的生物分子凝聚体的相变RNA-driven phase transitions in biomolecular condensates》一文中,研究人员聚焦于RNA在这种相分离过程中所扮演的重要角色,向我们揭示了RNA如何引发并调控生物分子凝聚体的形成与功能,以及其在疾病发生中的潜在影响。

背景:从无膜结构到相分离的新视野

       无论是在细菌、古菌还是真核生物中,细胞内的生物分子凝聚体都充当了重要角色。这些无膜结构能够为转录、翻译以及RNA的加工与降解等细胞过程提供独特的微环境。从核仁到应激颗粒(SGs),再到转录“集群”,这些结构在细胞中的功能至关重要。而当这些凝聚体的形成和功能受到破坏时,往往会导致严重的疾病,比如神经退行性疾病和癌症。

      生物分子凝聚体通过液液相分离(LLPS)或液固相分离形成,涉及到多价的RNA和蛋白质之间复杂的相互作用。然而,尽管RNA是这些凝聚体中的核心成分之一,过去的研究主要集中在蛋白质驱动的相变上。Banerjee等人则提出,RNA本身在凝聚体的形成、调控及其功能方面具有不可忽视的作用。

RNA驱动的凝聚体:更多的不仅是“旁观者”

      虽然蛋白质驱动的相分离已被深入研究,但RNA实际上也能作为驱动因子,在细胞中形成RNA蛋白质复合体(RNP)的液滴结构。这些由RNA参与驱动的凝聚体表现出丰富的材料特性,并通过调控RNA与RNA结合蛋白(RBPs)的比例来调控其形成和稳定性。例如,某些疾病如肌萎缩性侧索硬化症(ALS)中的FUS突变体,正是通过RNA和蛋白质之间的比例失衡,导致了异常的凝聚体形成。

      RNA在RNP凝聚体的形成中还发挥着架构作用。例如,非编码RNA(ncRNA)如NEAT1负责构建核斑点,而某些mRNA则通过形成复杂的蛋白质网络来支持细胞内信号传导。这表明,RNA不仅仅是这些凝聚体的“伴随者”,更是其形成和功能的重要驱动因素。

RNA驱动的相分离与疾病:细胞生物学中的“新篇章”

     Banerjee等人还讨论了RNA相分离在疾病中的作用。重复扩展序列的RNA如亨廷顿舞蹈症中的CAG重复序列,已被证明能够通过RNA驱动的相分离形成细胞内的异常聚集体。这些RNA驱动的凝聚体不仅能够引发神经退行性疾病,还与应激颗粒的形成密切相关,展示了RNA在疾病发展中的潜在机制。

      通过热力学模型,研究发现RNA的序列特异性相互作用是驱动相分离的关键。例如,某些重复序列RNA在应激条件下会表现出类似凝胶的行为,这为RNA在细胞内形成聚集体提供了新的理论基础。

RNA与基因调控:从分子到功能的多层次调控

       RNA驱动的相变不仅在疾病中发挥作用,还在基因表达和调控过程中具有重要功能。RNA能够通过相分离形成细胞核内的转录集群或超级增强子区域,这些区域富集了转录因子、增强子RNA以及RNA聚合酶II,从而增强了特定基因的转录效率。更有趣的是,RNA的局部浓度变化可以通过反馈机制调节这些凝聚体的形成和溶解,展示了RNA如何在细胞中精确控制基因表达的时空动态。

      此外,长链非编码RNA(如Xist)通过形成RNA焦点来调控染色质的三维结构,进而实现全染色体的沉默。RNA驱动的相变在调控mRNA翻译中也扮演了重要角色,研究表明,某些RNA能够通过相分离抑制或增强特定mRNA的翻译,展示了RNA在后转录调控中的独特功能。

未来展望:RNA凝聚体的医学潜力

      随着对RNA驱动的相分离和凝聚体形成的深入了解,RNA在疾病中的潜在应用也逐渐浮出水面。研究人员设想,通过调控RNA的相分离过程,能够开发出针对RNA驱动疾病的全新治疗策略。例如,设计小分子药物来干扰RNA的相互作用,或者通过改变RNA的局部浓度来恢复细胞内的正常平衡。这些策略为未来RNA为基础的治疗手段提供了新的方向,也可能为凝聚体功能紊乱所引发的“凝聚病”带来突破性的治疗方法。

结语

综上所述,RNA不仅在生物分子凝聚体的形成与调控中扮演重要角色,还与多种细胞过程和疾病紧密相连。通过深入研究RNA驱动的相分离机制,我们能够更好地理解细胞内的复杂生物学现象,并为未来RNA为基础的治疗方法奠定理论基础。这篇综述为我们揭示了RNA在生物分子凝聚体中的新角色,开启了RNA驱动细胞重生的科学新篇章。


文字写作:小x
责任编辑:er不er
文章编号:245
论文链接:https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(24)00738-X

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