“Olink云分析”是继“蛋白质组云分析”和“代谢组云分析”后,在质谱类组学云平台(玉璋)上推出的第三大核心产品。相较于传统蛋白组学在技术上的桎梏与局限,Olink 蛋白组学创新性地采用了近端延伸技术(proximity extension assay, PEA),这使其拥有高特异性、高灵敏性和高通量的独特优势,宛如为蛋白组学研究领域量身定制了一把“金铲铲”。尤其是在检测低丰度蛋白方面,Olink 表现堪称优异,能够精准捕捉那些极其微量的蛋白质,使得我们对蛋白质世界的认知向着更为深邃、精准的未知领域大步迈进。
“Olink云分析”在界面风格上,承袭了“玉璋”一贯的模块化设计理念,高度重视交互逻辑和细节体验,同时对底层算法进行深度优化和革新,旨在构建一个更加优质流畅的云平台环境,为广大客户带来更加丰富多元、精细入微的分析服务方案,让每一位科研人员都能毫无障碍地轻松驾驭,快速上手。无论您是蛋白组学领域的资深专家,还是初涉此道的新手,只需轻点鼠标,即可畅享 Olink 蛋白组学的强大功能,开启蛋白组学云分析的崭新篇章!
全新上线的 “Olink 云分析”精心布局,共涵盖 3 大分析模块:差异蛋白表达谱、富集分析和重分析。
在此模块中呈现了所有蛋白的详细信息,涵盖蛋白名称(Assay)、蛋白ID(OlinkID、Uniprot)、蛋白功能描述(description)、蛋白富集通路及结构域信息(GO、KEGG、REACTOME、DO、InterPro、subcellular)以及其在不同样本中的表达量。通过简单操作,即可获取蛋白各项关键信息。
与蛋白表达谱不同,差异蛋白表达谱不仅包含上述蛋白信息,还标注了比较组之间的差异蛋白,有助于从大量表达谱数据中快速定位关键蛋白信息,辅助下游分析工作。该模块提供7种分析工具,包括差异蛋白火山图、蛋白表达量热图、平均蛋白表达量热图、比较组蛋白相关性热图、蛋白互作网络图、随机森林图和箱线图,从不同角度解析数据。
Ø 差异蛋白火山图:
Ø 蛋白表达量热图:
Ø 平均蛋白表达量热图:
Ø 比较组蛋白相关性热图:
Ø 蛋白互作网络图:
Ø 随机森林图:
Ø 箱线图:
富集分析作为高通量组学数据挖掘的得力 “工具”,其重要性不言而喻。Olink 云平台的富集分析模块能够通过蛋白功能富集分析,迅速精准地指明候选蛋白潜在的功能特性、可能参与的生物学通路,以及其与所专注研究的生物学问题之间潜藏的紧密联系。通过基因功能富集分析可以将基因进行分类,结合富集分析结果和先验知识,可以大大缩小候选蛋白的范围。目前该模块已然涵盖了 GO 和 KEGG 这两大最常用的富集分析功能,并提供了柱状图和因子图两种展示形式。后续将会进一步拓展该模块的强大功能,陆续引入结构域富集、Reactome 富集和 DO 富集分析等更多实用且前沿的分析内容。
Ø GO富集柱状图:
Ø GO富集因子图:
Ø KEGG富集柱状图:
Ø KEGG富集因子图:
重分析模块可实现重新选择分析样本、重新设计比较组方案以及自定义统计方法和阈值,能根据用户需求灵活调整数据,使研究更贴合实际情况。
结束语:
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