EP:洞察中国饮用水抗性基因/耐药组动态

文摘   2025-01-15 08:33   广东  
《Insight into the dynamics of drinking water resistome in China》由 Mian Gul Hilal 等人撰写。随着抗生素滥用,耐药基因(ARGs)在环境中的传播引发关注,饮用水作为人类接触 ARGs 的重要途径,中国因抗生素生产和使用量大,面临较大风险。此研究对饮用水中 ARGs 进行多维度评估,分析其来源、影响因素、检测方法、健康风险及缓解策略,为保障饮用水安全提供依据
饮用水耐药基因(ARGs)的研究背景与来源
- 抗生素耐药现状:自 20 世纪 40 年代起,抗生素广泛使用,因滥用、分解不足和环境持久性等问题,抗生素耐药性(AR)在生态系统中发展。预计到 2050 年,AR 将导致全球 1000 万人死亡和 100 万亿美元经济损失。中国是抗生素生产和使用大国,如 2013 年中国消耗 92700 吨抗生素,46%最终排入河流,这促进了 ARGs 在环境中的传播,增加了“超级细菌”出现的风险。    
- 饮用水与 ARGs:安全充足的饮用水是人类基本需求,但中国水资源有限且水污染严重,约 2.8 亿人无法获得安全饮用水。饮用水是 ARGs 与人类接触的主要途径,其污染对人类健康构成威胁。ARGs 可在饮用水源中增殖,如河流、水库、湖泊、饮用水处理厂(DWTPs)和饮用水分配系统(DWDSs)等均检测到多种 ARGs。
图 1.中国主要饮用来源及其主要报道的抗生素概述。
不同饮用水源中的 ARGs 情况
- 河流系统:是主要水源,受人类活动污染严重,ARGs 丰富。如长江最大支流黄浦江是上海重要水源,日产 750 万加仑原水,其附近 ARGs 含量较高。钱塘江检测到氨基糖苷类、四环素类等多种 ARGs,珠江三角洲原水检测出 27 种 ARGs,城市河流检测到 258 种 ARGs,海河沉积物中以β -内酰胺类和磺胺类抗性基因居多,潮白河作为北京主要水源也存在多种 ARGs。
- 水库系统:全球大量修建水库改变了河流生态,水停留时间延长利于 ARGs 积累。如藏木坝 bacA 基因占比较大,丹江口水库是重要饮用水输送工程,其沉积物中 ARGs 多于水,且旱季 ARGs 总量高于雨季,水中 ARGs 主要来自上游沉积物。    
- 湖泊:是重要淡水来源,但城市湖泊易受污染。全球湖泊分析显示湖泊沉积物和水中检测到 57 种抗生素,推测有多种 ARGs 且可能转移至饮用水。如武汉湖泊中 sul 基因占主导,其在沉积物和地表水中浓度较高。
- DWTPs:处理工艺无法完全去除 ARGs,部分过程甚至增加其含量。某地 DWTPs 及分配网络检测到 285 种 ARGs,自来水 ARGs 含量可能比出厂水高,氯消毒会增加某些 ARGs 丰度,如 tet(A)和 tet(G),同时改变微生物群落。新加坡和中国部分城市自来水也检测到多种 ARGs,表明现有处理工艺对 ARGs 去除不足。
- DWDS:生物膜为 ARGs 提供富集环境,管道中 ARGs 随时间变化,初始减少后增加。芬兰 DWDS 对 ARGs 有富集作用,中国管道中 bla、MLSB 等为主要 ARGs,且不同管材对 ARGs 有影响。CDC 生物膜反应器模拟研究显示 ARGs 随时间增加,aphA2 和 sulII 为优势基因,ARGs 载体细菌可在生物膜中富集,威胁人类健康。
ARGs 的来源及影响因素
图 2.总结了抗生素耐药基因 (ARG) 的来源和起源及其向饮用水的传播途径
- 来源
    - 医院:中国约 50%住院患者使用抗生素,部分地区滥用严重。医院废水含丰富 ARGs,如某医院废水检测到 126 种目标 ARGs,常见有 tetO、sul1 等。虽经处理,仍可能是 ARGs 传播源,但相关研究尚需深入。    
    - 畜牧业:抗生素在畜牧业广泛使用,畜禽粪便和养殖废水是 ARGs 重要来源。如猪场废水排放影响河流中 tet 基因频率,猪场附近地下水、牛蛙养殖场沉积物、九龙河污水及中国多地养殖场沉积物中均检测到多种 ARGs,这些废弃物排放可能增强 ARGs 向人类和生态系统的传播。
    - 污水处理厂:是 ARGs 富集热点,污水中污染物形成选择压力。如对黄浦江水和青草沙水库水分析显示处理后细菌耐药性有变化,中国 17 城市污水检测到 381 种 ARGs 亚型,消毒工艺会影响 ARGs 丰度和传播。
    - 自然突变:ARGs 是细菌原始防御机制,在自然环境中普遍存在,如古老岩石中也有发现。在细菌染色体复制过程中可通过自发突变产生,其在饮用水源中的自然富集机制需进一步研究。
- 影响因素
    - 非生物因素
      - 人类活动:人类活动释放化合物影响 ARGs,在高人类活动区 ARGs 水平更高。如黄浦江高人类活动区 ARG 水平显著高于其他区域,海河接收大量污水,其沉积物中 ARGs 丰富,表明人类活动对 ARGs 产生有重要作用。
      - 抗生素:大量使用抗生素,其低浓度排放促进 ARGs 发展。如 2013 年中国抗生素排放南方和中部高于北方,低浓度抗生素可改变细菌转录,诱导微生物群落变化,促进 ARGs 富集。
      - 重金属:与 ARGs 有共同作用途径,可影响其产生和传播。如武汉湖泊研究显示 Cu、Ni、Cr 等重金属与 ARGs 呈正相关,部分重金属在低浓度下可刺激 ARGs 共轭转移,中国水体和土壤中存在共选择现象。
    - 生物因素
      - 微生物群落:微生物携带 ARGs,不同类群与 ARGs 相互作用影响其传播。如南京 DWTPs 中 Pseudomonas 是某些 ARGs 的潜在宿主,Salmonella 是 sul 基因主要宿主,微生物群落结构与 ARGs 丰度和多样性相关。    
      - 移动遗传元件(MGEs):通过水平基因转移促进 ARGs 传播,与 ARGs 高度相关。如 intI - 1 和 tnpA - 04 基因在水样中浓度高且与多种 ARGs 紧密相连,在 DWTPs 和 DWDS 中 ARGs 与 MGEs 常呈统计关联。
         

 

ARGs 的检测方法、健康风险与缓解策略
- 检测方法
    - 传统方法:包括培养法、传统 PCR 等。培养法受限于可培养细菌数量,传统 PCR 受引物限制,难以提供全面 ARGs 信息。如培养法检测污水处理厂细菌只能培养少量细菌,PCR 检测动物农场污水可能产生假阳性结果,但传统 PCR 具有快速、低成本等优点。
    - 现代方法:如宏基因组测序、高通量定量 PCR(HT - qPCR)等。宏基因组测序可全面分析 ARGs,但存在短读长、注释困难等问题;HT - qPCR 能检测大量样本,可用于分析饮用水源 ARGs 结构。如12 城市家庭饮用水宏基因组分析检测到 265 种 ARGs,HT - qPCR 在饮用水源研究中检测到较高频率的 ARGs。
- 健康风险:ARGs 可从环境微生物转移至人体病原体,降低抗生素效力,威胁公共健康。中国多地研究显示饮用水与人体样本间 ARGs 存在较高共享度,如宁波研究发现人粪便、河水、污水等样本中 ARGs 多样性高,兰州黄河研究表明河水、自来水和人粪便样本 80% ARGs 相同,且人体肠道可能富集 ARGs,但目前对其健康风险评估尚处于起步阶段。
- 缓解策略
    - 综合管理:建立 ARGs 指数用于饮用水质量控制,加强监测,提高公众意识,完善法律法规,规范抗生素生产、使用和处方,控制 ARGs 传播。如应开展更多研究评估饮用水中 ARGs 及其宿主和水平转移情况。
    - 消毒优化:改进消毒工艺,减少对 ARGs 的不利影响。如氯消毒虽常用,但会增加 ARGs 丰度,需探索更有效消毒方法或组合工艺,同时研究其他影响 ARGs 的因素。
- 科学研究:深入研究 ARGs 传播和分解途径,利用现代功能宏基因组学和全基因组测序等技术识别新基因和宿主,为制定管控措施提供科学依据。    
Hilal, M. G., Han, B., Yu, Q., Feng, T., Su, W., Li, X.,... & Li, H. (2023). Insight into the dynamics of drinking water resistome in China. Environmental Pollution, 322, 121185. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2023.121185    
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