肠道微生物是指定居于人体胃肠道的复杂微生物群落，包括细菌、病毒、真菌和古菌。它们通过调节免疫功能、代谢活动、营养吸收等，深刻影响人体健康与疾病的发展。近年来，肠道微生物被视为“第二基因组”或“肠脑轴”的核心，揭示其在代谢综合征、免疫疾病和神经精神障碍中的重要作用。
自2007年启动的人类微生物组计划（HMP），奠定了肠道微生物基因测序的基础。随后，研究揭示了肠道微生物与代谢性疾病（如肥胖和糖尿病）的密切联系。此外，粪菌移植技术在治疗艰难梭菌感染中的应用，以及肠道菌群与免疫系统相互作用机制的阐明，标志着该领域从基础研究逐步向临床转化。
2024年，肠道微生物领域的研究热点包括其与肿瘤免疫疗法敏感性之间的关系、微生物与神经炎症的交互作用，以及针对个性化饮食与疾病管理的微生物组干预技术。在重大突破方面，研究揭示了特定肠道菌群在癌症免疫治疗中的协同机制，开发出新型益生菌疗法以增强患者的治疗反应。此外，AI技术的引入显著加速了微生物组大数据的解析，为精准医学提供了更多可能。
在近5年内，肠道微生物相关研究的论文发表主要集中于中国（共计23,804篇，占总量的29.4%）和美国（共计10,908篇，占总量的24.0%），占据了全球研究的主导地位。意大利、日本和西班牙紧随其后，分别排在第三至第五位。反映出该领域的全球性发展趋势，尤其是中美两国在科研产出上的显著领先地位。
（SCI论文国家分布）
按照发表论文的总影响因子排序，肠道微生物领域全球TOP5活跃的医院依次为：浙江大学附属第一医院、华西医院、仁济医院、布莱根妇女医院、格罗宁根大学医学中心 2024年进入到全球肠道微生物领域累计影响因子TOP20的中国其他领先医院：湘雅医院、郑州大学第一附属医院和瑞金医院等均榜上有名，表明中国的多个顶尖医院在该研究中发挥了重要作用。
发表肠道微生物相关研究领域论文最多的SCI期刊依次为：
Nutrients (IF=4.8), Front Microbiol (IF=4), Int J Mol Sci (IF=4.9), Microorganisms (IF=4.1), Sci Rep (IF=3.8)等。
（研究热点基因和疾病）
Chen, Wei，山东农业大学食品科学与工程学院 Yu, Jun，香港中文大学李嘉诚健康科学研究所 Cryan, John F，科克大学解剖学和神经科学系 Ng, Siew C，香港微生物菌群創新中心（MagIC） Segal, Eran，魏茨曼科学研究所
Schmidt N, Van Den Ham K, Bower L, Li S, Lorenzi H, Doumbo S, Doumtabe D, Kayentao K, Ongoiba A, Traore B, Crompton P. Susceptibility to febrile malaria is associated with an inflammatory gut microbiome. Res Sq [Preprint]. 2024 Apr 4:rs.3.rs-3974068. doi: 10.21203/rs.3.rs-3974068/v1. Update in: Nat Commun. 2024 Nov 5;15(1):9525. doi: 10.1038/s41467-024-52953-8. PMID: 38645126; PMCID: PMC11030534. Van Den Ham KM, Bower LK, Li S, Lorenzi H, Doumbo S, Doumtabe D, Kayentao K, Ongoiba A, Traore B, Crompton PD, Schmidt NW. The gut microbiome is associated with susceptibility to febrile malaria in Malian children. Nat Commun. 2024 Nov 5;15(1):9525. doi: 10.1038/s41467-024-52953-8. PMID: 39500866; PMCID: PMC11538534. Mandal RK, Schmidt NW. Mechanistic insights into the interaction between the host gut microbiome and malaria. PLoS Pathog. 2023 Oct 12;19(10):e1011665. doi: 10.1371/journal.ppat.1011665. PMID: 37824458; PMCID: PMC10569623. Mandal RK, Denny JE, Namazzi R, Opoka RO, Datta D, John CC, Schmidt NW. Dynamic modulation of spleen germinal center reactions by gut bacteria during Plasmodium infection. Cell Rep. 2021 May 11;35(6):109094. doi: 10.1016/j.celrep.2021.109094. PMID: 33979614; PMCID: PMC8141963.
研究产出与国家分布：近五年，Medline数据库收录的肠道微生物研究论文达55,490篇，其中中国（29.4%）和美国（24.0%）贡献最大，显示该领域在全球范围内的研究热潮与中国的快速崛起。
热点基因与重点疾病：研究聚焦于调控免疫与代谢的关键基因（如TLR4、NLRP3），重点疾病涵盖溃疡性结肠炎、肥胖、糖尿病等代谢性疾病，以及结直肠癌、自闭症和抑郁症等，反映肠道微生物研究的多学科交叉特性。
高频发表期刊：肠道微生物相关研究集中发表于Nutrients、Front Microbiol、Int J Mol Sci等高质量SCI期刊，为研究者提供了投稿参考和优质研究平台。
全球活跃机构与医院：浙江大学附属第一医院、华西医院和仁济医院等中国机构在全球肠道微生物领域表现领先，布莱根妇女医院和格罗宁根大学医学中心等国际机构也具有较高影响力。
未来趋势与影响力：2024年，NIH资助金额超5.69亿美元，支持了1,187项研究，重点关注代谢、免疫和神经领域，推动精准医学与疾病管理的创新发展。
