【siRNA】终获技术突破!即将引爆新一轮临床科研,这些角度可获得突破(2024)

学术   2024-12-18 08:28   美国  
科研和SCI论文成为临床工作的副产品。

关键词:siRNA;临床科研;Healsan大数据

导言:
为辅助课题选题及国自然基金撰写,熟悉最新研究热点和进展;尤其是协助找到最新的课题,我们每年都会就最近一年的临床科研的热门靶点进行解析。
本次解读“siRNA”相关的研究大数据分析。

大幅提高乙肝表面抗原转阴率!这次由siRNA疗法完成,发表在顶刊“新英格兰医学杂志”

NEJM:siRNA疗法Plozasiran,治疗持续性乳糜微粒血症获得成功,有效降低胰腺炎风险


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小干扰RNA(siRNA)是一类具有21-23个核苷酸的双链RNA分子,通过RNA干扰(RNAi)机制特异性地降解靶mRNA,从而抑制基因表达。由于其高效的基因沉默能力,siRNA已成为精准基因调控和靶向治疗的重要工具,广泛应用于基因功能研究和疾病治疗中,尤其在癌症、病毒感染和罕见遗传病领域。


1998年,Fire和Mello发现RNA干扰(RNAi)现象,首次揭示了siRNA的基因沉默机制,并因此获得2006年诺贝尔生理学或医学奖。2001年,siRNA在哺乳动物细胞中实现基因沉默,标志着RNAi技术的转化应用起步。2004-2010年间,科学家通过化学修饰和递送系统优化,解决了siRNA在体内的稳定性和特异性靶向问题。2018年,首个siRNA药物Patisiran获FDA批准上市,用于治疗遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性病(hATTR)。2020年至2023年,siRNA在癌症、肝脏疾病和新冠病毒研究中取得显著进展,多项临床试验显示出良好的疗效。


2024年,siRNA研究的主要热点将集中于药物递送系统的优化,开发更高效的脂质纳米颗粒(LNP)肽偶联体等递送系统,以提高siRNA在肝脏、肿瘤和中枢神经系统等靶向组织的递送效率。同时,靶向癌症领域取得新突破,针对KRAS等难以成药的致癌基因,siRNA药物在多种恶性肿瘤的临床研究中展现出巨大潜力。此外,siRNA在神经退行性疾病中的应用也备受关注,通过抑制亨廷顿病、阿尔茨海默病等疾病相关基因的异常表达,为治疗提供新思路。在抗病毒治疗方面,siRNA在抑制流感病毒、乙型肝炎病毒(HBV)和新冠病毒中的应用取得积极进展。个性化siRNA疗法的开发也成为一大趋势,基于基因组学和AI技术,设计定制化的siRNA分子,为患者提供精准个体化治疗


1、美国国立卫生研究院基金资助
美国国立卫生研究院(NIH)对小干扰RNA(siRNA)研究(检索关键词:"small interfering RNA" OR "siRNA")的资助在过去20年内整体呈现先上升后回落的趋势。特别是在2010年达到峰值,当年资助项目2,313项,金额超过8.5亿美元。然而,近五年(2020-2024年)资助力度呈现逐年下降的趋势:2020年资助1,052项,此后逐年减少,2023年下降到876项,2024年进一步降至593项,资助金额也从2020年的4.38亿美元减少到2024年的2.41亿美元。这一现象可能反映出siRNA研究进入临床转化阶段,基础研究需求相对减少,同时也可能受到其他新兴技术(如CRISPR基因编辑)崛起的影响。
但整体来看,siRNA作为重要的基因调控工具,依然在生物医学研究中占据重要地位,持续获得稳定支持


(美国国立卫生研究院基金资助的时间分布和项目数量)

2、论文质量和增速

siRNA相关研究的论文数量和质量呈现出明显的趋势特征。截至2024年,累计发表论文90,379篇,其中影响因子(IF)≥20的高质量论文有2,170篇,影响因子10-20之间的论文有8,825篇,影响因子8-10的论文也达到5,325篇,表明该领域整体研究质量较高。

在论文增速方面,自1991年起,siRNA领域的研究经历了逐步增长,到2010年前后达到高峰,近年来发表量虽略有回落,但仍保持较高水平。2024年发表论文4,182篇,显示出siRNA研究在基因调控、精准医疗等领域的持续关注。尽管增速放缓,但高质量论文的占比稳步提升,反映出研究逐渐从数量驱动向质量导向转变,标志着该领域进入应用深化和临床转化的新阶段。


(研究发表的期刊分布及时间分布)

为了解目前在siRNA的研究进展,我们对最近5年发表的论文做了全面解读,以找到这方面的研究热点及哪些期刊喜欢siRNA研究,目前最活跃的研究机构、最有影响力研究人员、最重要的研究论文等。

检索数据库:Pubmed
分析工具:Healsan™大数据
检索时间:December 16, 2024
检索及分析机构:Healsan Consulting LLC(美国恒祥咨询)

一、siRNA研究论文大数据分析

最近5年,Medline数据库共收录22,203siRNA领域研究论文,对其进行大数据分析:


国家分布

在近5年内,siRNA相关研究的论文发表主要集中于中国(共计11,887篇,占总量的53.5%美国(共计4,128篇,占总量的18.6%,占据了全球研究的主导地位。日本、德国印度紧随其后,分列第三第五,体现了siRNA研究的国际化发展趋势。特别是中国和美国主导了全球大部分的研究,推动siRNA技术在基因治疗、癌症治疗精准医疗领域取得突破性进展。


(SCI论文国家分布)


医院排名

  • 按照发表论文的总影响因子排序siRNA领域全球TOP5活跃的医院依次为:华西医院、武汉大学人民医院、同济医学院附属同济医院、布莱根和妇女医院、青岛大学附属医院。
  • 2024年进入到全球siRNA领域累计影响因子TOP20的中国领先医院:郑州大学第一附属医院、浙江大学医学院附属第二医院、上海仁济医院等均榜上有名,表明中国的多个顶尖医院在该研究中发挥了重要作用。

(全球发表论文TOP20的医院排名)

哪些期刊喜欢siRNA研究?

发表siRNA相关研究领域论文最多的SCI期刊依次为:
  • Int J Mol Sci (IF=4.9),
  • Sci Rep (IF=3.8),
  • Cells (IF=5.1),
  • Biochem Biophys Res Commun (IF=2.5),
  • Cancers (Basel) (IF=4.5)等。
特别注意:IF = 0,意味着未被SCI收录。

(发表论文的杂志分布)

期刊的审稿时间

对于论文在这些期刊发表的篇数、该期刊影响因子、期刊分区、从投稿到接收的时间、标准差和用来统计的论文样本量做了大数据分析。
我们特别圈出来几个审稿时间快的期刊。


(杂志审稿情况)

研究热点基因和相关疾病

1. 研究热点基因:
在基因层面,NLRP3STAT3mTOR 是siRNA研究中最受关注的靶点,分别与炎症反应、细胞信号传导和自噬调控密切相关。
此外,EGFRSIRT1 等基因在肿瘤治疗和细胞代谢调控方面也占据重要位置。
其他高频基因包括 KRASFOXO1PTEN,这些基因广泛应用于癌症、免疫疾病和代谢性疾病的研究中,反映出siRNA技术在调控关键致病基因上的应用前景。

2. 研究相关疾病/表型:

在疾病领域,应激反应(Stress)乳腺癌 是siRNA研究中最主要的应用方向,显示出其在调控应激信号通路和肿瘤靶向治疗方面的突破性进展。同时,肺癌结直肠癌胃癌 等多种恶性肿瘤,以及糖尿病白血病类风湿性关节炎 等疾病,成为siRNA技术的核心研究领域。此外,SARS-CoV-2神经性疼痛等热点领域也体现出siRNA在病毒感染和慢性疾病治疗中的应用潜力。

(研究热点基因和疾病)


最活跃的学者及关系网

按照SCI论文累计影响因子排序siRNA领域TOP5活跃的研究学者如下所示
(该领域最活跃的研究者。备注:只统计第一作者和最后一位作者署名发表的论文数。如果作者的名字有不同拼写时,会被PubMed当成不同作者。如张三丰的拼写可能会有:Zhang,Sanfeng、Zhang,San-feng、或者Zhang,San Feng等不同拼写方式;部分期刊可能只会写Zhang,S,PubMed检索平台就会按照不同作者处理。)

siRNA领域的医生科学家学术圈如下,可以看到多个独立的研究项目组
(学术大咖及其关系网)

二、经典论文

除了发表论文的数量和研究者论文影响力之外(数量+质量),单篇论文被引用次数是评价其学术影响力的重要指标。
所以我们通过大数据分析找到高引用论文,即领域内的经典论文。
因为时间和资源限制,只有最新的 10000 篇文献会被分析。

TOP5被引用次数的SCI论文依次为:


三、从模仿,到超越--开启属于自己的研究

在研基金
比如 Broad Institute, Inc. 的 Eric Vallabh Minikel 的研究课题,聚焦于二价siRNA朊病毒病治疗中的应用。主要包括两个方向:一是通过监管咨询推动二价siRNA疗法的开发,确保药物在临床推进中的合规性和高效性;二是利用二价siRNA技术降低致病性朊病毒蛋白的表达,探索针对朊病毒病这一罕见神经退行性疾病的有效治疗手段。这些研究显示出siRNA技术在精准靶向治疗方面的前沿应用,有望为朊病毒病提供突破性的治疗方案。

论文发表
Dr. Eric Vallabh Minikel 发表的部分SCI论文:
  1. Zhang E, Neugebauer ME, Krasnow NA, Liu DR. Phage-assisted evolution of highly active cytosine base editors with enhanced selectivity and minimal sequence context preference. Nat Commun. 2024 Feb 24;15(1):1697. doi: 10.1038/s41467-024-45969-7. PMID: 38402281; PMCID: PMC10894238.
  2. Corridon TL, O'Moore J, Lian Y, Laversenne V, Noble B, Kamath NG, Serack FE, Shaikh AB, Erickson B, Braun C, Lenz K, Howard M, Chan N, Reidenbach AG, Cabin DE, Vallabh SM, Grindeland A, Oberbeck N, Zhao HT, Minikel EV. PrP turnover in vivo and the time to effect of prion disease therapeutics. bioRxiv [Preprint]. 2024 Nov 14:2024.11.12.623215. doi: 10.1101/2024.11.12.623215. PMID: 39605733; PMCID: PMC11601496.

Hanson解读:

通过对siRNA研究领域的论文进行大数据分析,我们可以获得该领域的全面概况和关键趋势:

近年来,siRNA研究取得了快速发展,累计发表论文超过90,000篇,其中高影响因子(IF≥20)的论文达到2,170篇,显示出该领域整体研究质量的显著提升。

在热点基因方面,NLRP3STAT3mTOR 等靶点备受关注,主要涉及炎症反应、信号传导和自噬调控等重要生物学通路。

在疾病应用方面,应激反应(Stress)乳腺癌肺癌 是主要研究方向,同时在糖尿病、神经性疼痛、类风湿性关节炎等慢性疾病以及SARS-CoV-2等病毒感染领域也展现出巨大潜力。

从国家分布来看,中国和美国主导了全球siRNA研究的发表量,尤其是中国的贡献居于首位,反映出该领域的全球竞争格局。

此外,研究机构中,中国多家医院如华西医院武汉大学人民医院等,以及美国的Brigham and Women’s Hospital,在siRNA领域的科研产出和影响力名列前茅。

总体来看,siRNA技术已逐步从基础研究向临床转化迈进,未来研究将重点聚焦于药物递送系统优化、靶向癌症和炎症等重大疾病的突破,为精准医学和个性化治疗提供更广阔的应用前景。


A、本报告为PubMed检索平台仅以检索式报告的结果进行的可视化报告。
B、大数据分析无任何排名意义
C、本推文很可能存在谬误;也请各位同仁多多指正,以促进我们提供更高质量的推文。
D、本文仅为学术交流,不构成任何建议

编辑:Amber Wang,微信号:HealsanA;加好友请注明理由。
助理:ChatGPT;封面:Hanson设计、GPT 4制图
美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析、及基于大数据的Hanson临床科研支持主要为医院科研处、生物制药公司和医生科学家提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。
网址:https://healsan.com/

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▲ 每年5-6月

▲ 每年7-8月

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