Protocol分享:mRNA转录模板的制备流程

健康   2024-11-16 09:30   湖北  

导读:2024年5月,西奈山伊坎医学院Nicolas Vabret团队在Cell子刊STAR Protocols分享实验方法:Protocol for the development of mRNA lipid nanoparticle vaccines and analysis of immunization efficiency in mice。文章详细描述了mRNA疫苗的制备和体内外活性评估实验步骤,包含:mRNA序列设计、体外转录(IVT)模板DNA制备、IVT mRNA制备、mRNA-LNP包封、RNA质量检测和mRNA疫苗的免疫原性评估(体外细胞和体内小鼠试验)。

上期文章菌菌以示例形式介绍了mRNA疫苗的序列设计部分(Moderna mRNA-01273和辉瑞/BioNTech BNT12b2),感兴趣的小伙伴可查看早期文章或直接联系菌菌获取:133 8033 2910。

本期文章菌菌将继续分享:mRNA转录模板的制备流程,包括两种不同类型的DNA——线性化质粒DNA和PCR扩增的线性DNA。

01

质粒DNA模板的制备

1.1 环状质粒的扩增和提取

合理设计的质粒序列通常经基因合成的方法制备。西奈山伊坎医学院Nicolas Vabret团队分享的Protocol以质粒DNA作为mRNA制备的起始原料,依次经质粒转化、菌种培养、质粒提取获得足够量的质粒DNA模板。

耀海生物提供各种预制型质粒模板(质粒+菌液)、以及IVT RNA产品(原液/冻干粉)、LNP成品,包括荧光蛋白eGFP、mCHERRY、荧光素酶Luciferase、重组酶Cre、抗原OVA等,高质量满足不同的实验或项目需求。如感兴趣可随时联系菌菌:133 8033 2910。

1.2 线性化质粒制备

这一步骤的目的是生成用于IVT反应的线性化DNA模板,避免质粒载体上额外序列的转录。具体操作包括:酶切反应、线性化质粒纯化和检测。

02

基于PCR的DNA模板制备

Nicolas Vabret的Protocol仅描述了质粒DNA模板的制备。然而除质粒DNA外,PCR产物也可作为IVT的模板。

RNA经典书籍《RNA Methods and Protocols》中描述了使用PCR制备DNA转录模板的方法。PCR产物的序列应包含启动子序列(上游)和目标mRNA编码序列(5’ UTR、CDS、3’ UTR、poly(A)尾巴),其中启动子序列的作用是结合RNA聚合酶,从而启动RNA转录本生成。

考文献 

[1] Karekar N, Reid Cahn A, Morla-Folch J, Saffon A, Ward RW, Ananthanarayanan A, Teunissen AJP, Bhardwaj N, Vabret N. Protocol for the development of mRNA lipid nanoparticle vaccines and analysis of immunization efficiency in mice. STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103087. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103087.

[2] RNA Methods and Protocols. 


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