所有患者通过NGS检测到IGH-V-（D）-J重排。在变异等位基因频率（VAF）为4%的临界值下，79%（143/180）的患者携带≥1个体细胞突变，MCL Younger队列和MCL Elderly队列分别为75%（88/117）和87%（55/63），大多数为MCL的驱动突变基因，如ATM（35%）、TP53（24%）、KMT2D（22%）、SAMHD1（10%）、BIRC3和NFKBIE（5%）。在37例未检测到突变的患者中，16例（43%）肿瘤细胞浸润率低于10%。然而，当VAF范围为1.8%-4%时，在7/16的患者中检测到了TP53、ATM、KMT2D或ARID1A的突变。 117个样本（65%）有>20%的肿瘤浸润，符合拷贝数变异（CNV）分析的条件，在83%（96/117）的患者中检测到CNV。最常缺失的基因为RB1（26%）、ATM（20%）、CDKN2A/B（18%）和TP53（17%），扩增最多的基因为KLF2（24%）、CXCR4（14%）、CCND1（13%）、MAP2K1（13%）和MYC（13%）。与MCL Younger患者（60/76，79%）相比，MCL Elderly患者（36/41，88%）中可观察到更高程度的基因组不稳定性，表现为更高的基因缺失比例：RB1（34% vs 22%）、ATM（29% vs 14%）、CDKN2A/B（27% vs 16%）和TP53（22% vs 14%），以及更高的基因扩增比例：CCND1（17% vs 9%）和MAP2K1（20% vs 9%）（图4）。
图4：使用EuroClonality-NDC方法对180例MCL患者进行靶向测序
与MCL不良预后相关基因组异常的识别
TP53突变（p = 0.026）、CDKN2A/B缺失（p = 0.00017）和KLF2扩增（p = 0.0021）与较高的MIPI指数显著相关，CDKN2A/B缺失与Ki-67指数≥30%相关（p = 0.046）。总缓解率（ORR）受到TP53（突变型vs野生型：71% vs 94%，p = 0.015）和FAT1（突变型vs野生型：20% vs 91%，p = 0.02）突变的影响，但完全缓解（CR）率并未受到明显影响。 较差的无失败生存期（FFS）与TP53、FAT1和NOTCH1突变和TP53、CDKN2A/B、TRAF2缺失以及MAP2K1扩增显著相关。较差的OS与TP53、FAT1、NOTCH1、TRAF2突变和CDKN2A/B、EGR2、TRAF2缺失以及BCL2、MAP2K1扩增显著相关（图5）。
