Advanced Biotechnology 2024年Volume 2 Issue 3目录及简介 | 转载

学术   2024-10-12 18:10   上海  

以下文章来源于Adv Biotech先进生物技术 ,作者Adv Biotech先进生物技术



封面介绍

Volume 2  Issue 3


封面故事

免疫细胞改造指导

细胞改造和基因编辑方法的发展推动了医学合成生物学的重大研究进展。然而,由于错综复杂的信号通路和模块基序,细胞信号网络的设计和改造仍然充满挑战。作为宿主防御病原体的第一道防线,固有免疫通过信号基序模块,级联反应以及众多调节因子的综合作用表现出强大的功能。崔隽教授及其同事建立并发布了DSCI数据库,这是一个固有免疫合成生物元件库,它收集并提供全面的元件资源,同时给予研究者用于医学合成生物学的改造或生成策略。固有免疫就像中国传统的土楼建筑,它高耸的围墙后面藏着错综复杂的隔间存贮资源,DSCI能够从标准化的固有免疫蛋白库中精确提取用户所需的信息,提供基于固有免疫分子和网络结构的基本信息和潜在干预策略,指导和辅助免疫细胞的改造。


封面文章

DSCI: a database of synthetic biology components for innate immunity and cell engineering decision-making processes


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本期内容介绍

Volume 2  Issue 3

1

ARTICLE

微生物技术专刊


Mechanisms underlying the interactions and adaptability of nitrogen removal microorganisms in freshwater sediments

Dandan Zhang , Huang Yu, Xiaoli Yu, Yuchun Yang, Cheng Wang, Kun Wu, Mingyang Niu, Jianguo He, Zhili He and Qingyun Yan


南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)通过宏基因组、宏转录组等多组学技术,分析了从富营养化养殖池塘中采集的沉积物和通过反应器进一步富集的脱氮微生物,并研究了其互作和功能适应性,发现微生物驱动的不同氮代谢途径间的潜在竞争可影响脱氮活性;富集形成的简化的微生物群落间具有更紧密的相互作用和更强的适应性,且反硝化、厌氧氨氧化(anammox)和硝酸盐异化还原成铵(DNRA)在富集过程中的耦合脱氮代谢增强。


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引用文章:

Zhang, D., Yu, H., Yu, X. et al. Mechanisms underlying the interactions and adaptability of nitrogen removal microorganisms in freshwater sediments. Adv. Biotechnol. 2, 21 (2024).

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00028-6

2

REVIEW

中山大学生物学科创建100周年专刊


Exploring the challenges of RNAi-based strategies for crop protection

Jian‑Hua Zhao, Qing‑Yan Liu, Zong‑Ming Xie and Hui‑Shan Guo


中国科学院微生物研究所郭惠珊研究员团队结合最新的研究进展,对基于RNAi的作物病害防控技术面临的挑战进行了综述,系统地讨论了RNA高级结构对dsRNA加工、以及小RNA(small RNA,sRNA)作用效率的影响,总结了当前体外大规模生产dsRNA的技术,讨论了对RNA生物农药进行安全评价问题,总结了外源dsRNA跨代传递并诱导RNAi的证据。


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引用文章:

Zhao, JH., Liu, QY., Xie, ZM. et al. Exploring the challenges of RNAi-based strategies for crop protection. Adv. Biotechnol. 2, 23 (2024).

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00031-x

3

REVIEW

中山大学生物学科创建100周年专刊


Targeting oncogene-induced cellular plasticity for tumor therapy

Bin Li, Lingling Zheng, Jianhua Yang and Lianghu Qu


中山大学生命科学学院屈良鹄教授与杨建华教授团队发表综述文章,概述了靶向癌细胞可塑性的新一代精准医疗新策略。从癌基因同时促进增殖与抑制转移的角度,深入探讨了癌基因在肿瘤发展中的复杂作用,特别是其在调控细胞可塑性中的双重功能,为癌症治疗提供了新的思路。


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引用文章:

Li, B., Zheng, L., Yang, J. et al. Targeting oncogene-induced cellular plasticity for tumor therapy. Adv. Biotechnol. 2, 24 (2024).

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00030-y

4

ARTICLE

中医药技术专刊


Integrated transcriptomics and metabolomics provide insights into the biosynthesis of militarine in the cell suspension culture system of Bletilla striata

Qingqing Li, Mengwei Xu, Fengju Wu, Ziyi Guo, Ning Yang, Lin Li, Weie Wen and Delin Xu


遵义医科大学基础医学院徐德林教授教授团队使用代谢组学和转录组学筛选了兰科植物白及中含量最多的次生代谢物白及苷(Militarine)合成相关的基因和代谢物,揭示了白及苷生物合成的遗传调控机制。


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引用文章:

Li, Q., Xu, M., Wu, F. et al. Integrated transcriptomics and metabolomics provide insights into the biosynthesis of militarine in the cell suspension culture system of Bletilla striata. Adv. Biotechnol. 2, 25 (2024). 

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00032-w

5

REVIEW

中山大学生物学科创建100周年专刊


Mining microbial and metabolic dark matter in extreme environments: a roadmap for harnessing the power of multi-omics data

Jia‑Rui Han, Shuai Li, Wen‑Jun Li and Lei Dong


中山大学生命科学学院李文均教授/董雷副教授团队综述了极端环境微生物从发现,分离培养到其代谢暗物质高效挖掘的多组学时代理性挖掘策略,以及相应实施技术路线,提出了多组学大数据指导下的极端微生物资源高效发现,进而深入挖掘应用微生物代谢潜能的理性实施技术路径。


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引用文章:

Han, JR., Li, S., Li, WJ. et al. Mining microbial and metabolic dark matter in extreme environments: a roadmap for harnessing the power of multi-omics data. Adv. Biotechnol. 2, 26 (2024). 

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00034-8

6

REVIEW

农业与生物技术专刊


Abscission in plants: from mechanism to applications

Jiahuizi Li and Shihao Su


中山大学农业与生物技术学院苏诗豪团队对植物脱落的机制与应用进行了综述,从发育生物学和分子生物学的角度综述了近年来植物脱落的研究进展,内容全面而广泛;重点讨论了植物脱落在未来农业中的潜在应用,对未来可持续农业的发展具有重要指导意义。


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引用文章:

Li, J., Su, S. Abscission in plants: from mechanism to applications. Adv. Biotechnol. 2, 27 (2024). 

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00033-9

7

EDITORIAL

农业与生物技术专刊


Advancing chromosomal-scale, haplotype-resolved genome assembly: beading with Hi-C data

Kesen Zhu, Qingyun Li, Qianqian Kong and Junpeng Shi


中山大学农业与生物技术学院史俊鹏课题组发表Editorial论文,对单倍型基因组组装策略和方法进行了评述。并重点介绍了近期在 Nature Plants 上发表的无需参考基因组进行等位基因感知的scaffolds搭建工具HapHiC;讨论了单倍型基因组组装方法的优势与不足、及未来单倍型基因组组装技术的发展方向。


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引用文章:

Zhu, K., Li, Q., Kong, Q. et al. Advancing chromosomal-scale, haplotype-resolved genome assembly: beading with Hi-C data. Adv. Biotechnol. 2, 28 (2024). 

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00035-7

8

ARTICLE

中山大学生物学科创建100周年专刊


DSCI: a database of synthetic biology components for innate immunity and cell engineering decision-making processes

Chenqiu Zhang, Tianjian Chen, Zhiyu Li, Qing Lu, Xiaotong Luo, Sihui Cai, Jie Zhou, Jian Ren and Jun Cui


中山大学生命科学学院崔隽教授/任间教授联合团队合作发布了首个固有免疫合成生物元件的可视化数据库——DSCI (https://dsci.renlab.cn),全面收集了固有免疫调控蛋白的相关文献和公开数据集,分类记录分子间调控关系与生化反应进程,构建出适用于合成生物学的标准化元件网络,对固有免疫信号网络的蛋白质组成数据进行整合并指导细胞工程编辑(封面文章)。


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引用文章:

Zhang, C., Chen, T., Li, Z. et al. DSCI: a database of synthetic biology components for innate immunity and cell engineering decision-making processes. Adv. Biotechnol. 2, 29 (2024). 

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00036-6

9

ARTICLE

农业与生物技术专刊


Winter forage crops influence soil properties through establishing different arbuscular mycorrhizal fungi communities in paddy field

Mengyan Cao, Yao Xiang, Lingyue Huang, Menghao Li, Cheng Jin, Chuntao He and Guorong Xin


中山大学农业与生物技术学院辛国荣教授团队通过对常见冬种饲草作物土壤AMF群落结构特征进行描画,筛选了适用于南方稻田冬季种植的饲草类型,综合评价了不同饲草的生产效能、土壤改良效果和AMF优势种群,为我国南方稻田的可持续发展提供有效方案。


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引用文章:

Cao, M., Xiang, Y., Huang, L. et al. Winter forage crops influence soil properties through establishing different arbuscular mycorrhizal fungi communities in paddy field. Adv. Biotechnol. 2, 30 (2024). 

https://doi.org/10.1007/s44307-024-00037-5


期刊简介

Advanced Biotechnology 是由中山大学主办,中山大学生命科学学院、水产动物疫病防控与健康养殖全国重点实验室、中国-东盟海水养殖技术“一带一路”联合实验室承办,全球知名出版商Springer Nature合作出版的高起点国际期刊。

Advanced Biotechnology采取同行评议、开放获取的方式出版发行,致力于发表生物技术领域的高水平前沿研究,包括生物、农业和医学技术领域的原创发现、新方法和重大技术创新成果。期刊旨在传播突破性的生物技术和方法,引领生物技术领域的国际前沿。

欢迎投稿的主题包括但不限于:多组学技术、医学生物技术、农业生物技术、生物信息学、生命科学中的人工智能、化学生物技术、生物医学工程、计算生物医学、分子与细胞工程、合成生物学、系统生物学、疫苗、转化医学技术、遗传和基因组技术等。

期刊亮点

编委团队由来自中国、美国、英国、法国、加拿大、新加坡、韩国、波兰等国家和地区 50 多名前沿领域科学家组成。

同行评议、开放获取、快速出版(14 天内完成第一轮评审),为高水平论文开设“绿色通道”快速发表;2023-2026 年所有论文免收出版费。

2023年5月中山大学与Springer Nature正式签署合作协议,6月 ABT期刊编委会成立,7月 ABT期刊网站上线,7月20日投稿系统启用,首期创刊号于2023年10月正式出版。

发展目标:5年内进入国际top期刊行列,打造中国本土前沿生物技术期刊旗舰品牌。

专刊征稿

Advanced Biotechnology 拟于2024年下半年出版“藻类生物技术”、“微生物生物技术”、“自噬调控”、“农业与生物技术”专刊,拟于2025年出版“中医药”、“中山大学生物学科创建100周年”专刊,拟于2026年出版“呼吸道病原体”专刊,诚邀原创研究文章及综述论文投稿。

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期刊联系方式

   期刊邮箱:advbiotech@mail.sysu.edu.cn


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