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病理科（中心）担负着对来自人体的组织、细胞、器官、体液、分泌物的诊断，甚至有条件的还要担负尸体的解剖。而这些检查诊断的实现，除了依赖于三区两通道平面布局规划的建筑物理空间，必不可少的还有相应的设备配置。
病理科（中心）设备配置应满足各功能区所需，按照工作流程配置相应的基本设备及辅助设施。设备配置前应将设备所需辅助设施及技术要求进行清单式整理，有特殊要求的设备要明确指出使用的需求。
配置信息录入系统（包括标本接受、报告发放等）、划价收费系统等相应配置，接收标本的收放、运送相应设备如密封收纳箱/盒、运送小车等。
信息录入系统（包括标本接受、报告发放等）、标本存放柜等。
根据工作需要，配置便于清洗、消毒的屋顶、室壁和地面装修、室内紫外线消毒设备。用于实施穿刺术的检查床、椅、穿刺用器械和器械柜、药物和药品和其他相关设备。
根据不同的制片技术配备以下设备：细胞离心涂片技术：离心机 、移液器、细胞离心涂片机。膜式薄层制片技术（TCT)：离心机 、移液器、 全自动液基薄层细胞制片机。沉降式薄层制片技术：离心机 、移液器 、液基制片机。细胞块制作：离心机 、 自动包埋仪、组织脱水机（选配）。细胞涂片染色机（选配）。
配备单人及多人共揽显微镜、信息化终端设备、病理切片数字化扫描设备、实验台、切片暂时存放橱柜等。
自带排风设备取材台、实验台、大体照相装置、ESD 标本自动取材台（选配）、电脑及全流程病理信息系统、包埋盒打号机、剩余标本存放标本储存柜（带有排风系统）、废液收集存放容器或处理系统等。
配置标本存放标本储存柜（带有排风系统）。标本存放室，排风装置。保障室内污染气体达标。有条件时，可直接改建成冷藏室。
配置全流程病理信息系统、实验台、自带排风设备取材台、冻切片机、 冷冻切片包埋机（选配）、包埋盒打号机、通风柜、冰冻染色机（选 配）。快速冰冻要求切特殊组织如脂肪等，可以加用冷冻切片包埋机。对组织先快速冷冻。
配置全密闭式程序控制自动组织脱水机、通风柜。脱水室也可与取材室合并使用。
全自动组织包埋机冷台一体机、全流程病理信息系统。
轮转式切片机、玻片打号机、摊片机、温箱、冰箱、冷台、实验台、全流程病理信息系统。
干燥箱、全自动组织切片染色机全自动组织切片封固机、实验台、通风柜、全流程病理信息系统。
配置移液器、 温箱、冰箱、电脑、全自动特殊染色机、湿盒、实验台、全流程病理信息系统。
配置移液器、全自动免疫组织染色仪、水浴温箱、冰箱、电脑、纯水机、实验台、全流程病理信息系统。
配置通风柜、恒温箱、移液器、水浴锅、杂交仪、荧光显微镜、电脑、高速离心机、医用冷藏冷冻冰箱、实验台、全流程病理信息系统。
应配备满足开展项目所需要的相关仪器。核酸提取：移液器、高速离心机、自动核酸提取仪、紫外分光光度 计（或 Qubit 荧光计）、医用冷藏冷冻冰箱、金属浴、生物安全柜（对 采用全自动核酸提取仪进行核酸提取操作的实验室，生物安全柜和金属浴不是必需设备）；对于样本类型涉及胸腹水等液体样本的实验室， 高速离心机需配备 15 ml/50 ml 离心转子。采用环保脱蜡液对 FFPE样本进行脱蜡处理的实验室，可不配备通风柜。ARMS-PCR 技术平台：移液器、多通道移液器、生物安全柜、 自动 核酸提取仪、紫外分光光度计（或 Qubit 荧光计）、高速离心机、掌上离心机、96 孔板离心机、涡旋振荡仪、荧光定量 PCR 仪、医用冷藏冷冻冰箱。
Sanger 测序技术平台：移液器、多通道移液器、生物安全柜、自 动核酸提取仪、紫外分光光度计（或 Qubit 荧光计）、高速离心机、 掌上离心机、96 孔板离心机、涡旋振荡仪、台式 PCR 仪、一代测序仪、DNA/RNA 自动分析仪（QIAxcel Advanced）、超净工作台（对于面积有限的实验室，可酌情使用 UVP PCR 工作台代替超净工作台。）、医用冷藏冷冻冰箱。
数字PCR 技术平台：移液器、多通道移液器、高速离心机、全自 动核酸提取仪、紫外分光光度计（或 Qubit 荧光计）、数字 PCR 系统或数字 PCR 分析仪、医用冷藏冷冻冰箱。
NGS 技术平台：移液器、多通道移液器、高速离心机、全自动核酸提取仪、Qubit 荧光计、DNA 超声波破碎仪、台式 PCR 仪、96孔板磁力架、真空干燥机、高通量测序仪、生信分析设备（服务器）、核酸质量生物分析仪、医用冷藏冷冻冰箱、焦磷酸序列分析仪、生物安全柜、超净工作台。
病理诊断室，单人及多人共揽显微镜、信息化终端设备、病理切片数字化扫描设备、切片暂时存放橱柜等。
病理会诊室，单人及多人共揽显微镜、信息化终端设备、切片暂时存放橱柜等。
图文报告室，信息化终端设备、报告打印设备、切片暂时存放橱柜等。
病理档案室，长期存放的切片、蜡块、申请单及报告单，需要密集式存放柜，病理切片数字化扫描设备、资料柜、电脑、切片柜和蜡块柜、档案自动化信息管理系统（选配）。
常规物品储存室应设置货架，通风设备。
会议桌椅、电子放映设备（包括显微镜影像设备）
医技休息室，应设置相应桌椅、饮水机、冰箱、微波炉等。
数字切片扫描与服务器室（可选）应设置信息化终端设备、病理切片数字化扫描设备、切片暂时存放橱柜等。
流式细胞室（可选），设置离心机，流式细胞仪。
超微电镜室，应设置电子显微镜、超薄切片机、自动组织处理机、自动染色机、多功能修块机、玻璃制刀机等（对于不同级别的医院可根据具体的情况对相关区域进行合并或更精细功能分区）。
组织脱水机、废液更换及存放宜配备通风排毒柜减少液体挥发对房间的污染。包埋机在通风柜中，减少石蜡烟排放至房间内。产生噪声的社保，在流程允许范围内宜集中放置，并采用降噪设施进行消音。
对不间断电源设备有要求的，要要用整体配置的不间断电源供应。
对采用全自动核酸提取仪进行核酸提取操作的实验室，可适度减少移液器，生物安全柜和金属浴不是必需设备；对于样本类型涉及胸腹水等液体样本的实验室，高速离心机需配备15 ml/50ml离心转子。
对于配备有自动核酸加样功能模块全自动核酸提取仪的实验室，可适度减少移液器、多通道移液器、和生物安全柜等的需求。
开展基因甲基化水平检测项目的实验室需配备焦磷酸测序仪或其他适用于甲基化水平测定的设备。
通量测序技术，可根据拟选用文库构建方法的不同选择相应的配套设备，如杂交捕获方法构建文库需要配备 DNA 超声破碎仪，而多重PCR 法构建文库或转座子法构建文库的话不需要配备DNA 超声破碎仪。
高通量测序技术平台需配备服务器用于数据的分析和存储，服务器容量大小根据实际情况选择。
采用环保脱蜡液对 FFPE 样本进行脱蜡处理的实验室，可不配备通风厨。
对于面积有限的实验室，可酌情使用 UVP PCR 工作台代替超净工作台。
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