拼搏一“夏” | 化身AI健儿 探索AI药物设计

学术   2024-07-29 19:31   上海  


培训专题:

分子模拟与人工智能在药物设计领域的应用



培训地点:

苏州 . 苏州园区东长路88号2.5产业园A3幢2层



培训时间:

2024年8月23-25日(周五至周日)



培训通知:

点击最下方“阅读原文”下载


自第一轮培训通知发布后,收到了很多客户的关注与积极响应,非常感谢大家对本次活动的支持!本次课程邀请到了业内知名专家授课,您将有机会参与到实践项目中,亲身体验人工智能在药物研发过程中的实际应用。不仅为您拓宽视野,提升专业技能,更为未来的药物研发工作打下坚实的基础。诚邀您的加入,与专家一起探索人工智能在新药创新中的无限可能!期待您的参与!


2024暑期AI特训 · 生命领域

培训亮点


大咖授课

本次培训由行业大咖授课,国家级一流课程负责人、慕课网金牌讲师、EBPMN联盟科学顾问、肿瘤新靶点发现专家、Nature Medicine、Nature Communication权威期刊系列成果发表。


权威期刊案例复现

培训期间将进行最全面、最先进的CADD、AIDD算法及应用案例精讲,权威期刊案例复现。案例及方法介绍覆盖大分子、小分子、药物早研及CMC等多个方向、多个阶段的研究内容。


实操结合理论

培训现场提供软件账号及计算资源,零距离体验Alphafold2、EDBO等近百种行业最领先的AI算法。


快速掌握可落地的AI技术

3天从零基础到精通,非常适合没有理论计算及AI背景但希望快速了解及掌握相关技术的药化专家。


实操结合理论

培训现场提供软件账号及计算资源,零距离体验Alphafold2、EDBO等近百种行业最领先的AI算法。


软件试用体验

可额外享受15天延长的软件试用体验。


2024暑期AI特训 · 生命领域

培训日程安排

Day1 8月23日

时间

内容

8:00

-

9:00

报到和注册

8月22日全天报到地点:苏州2.5工业园区A2栋3层,创腾科技
8月23日上午报到地点:苏州2.5工业园区A3栋2层,培训中心

9:00

-

12:00

付伟教授

药物设计学

进行药物设计学概述、药物设计基本原理以及先导化合物发现途径
药物靶点及其理论

主要涉及靶点的概念、假设、分类、要求以及经典与现代药物发现

基于结构的药物设计

· 介绍SBDD的基本理论、技术和方法;

· 介绍分子三维结构的理论计算方法;

· 介绍分子模型技术;

· 介绍直接药物设计与间接药物设计的方法。

12:00

-

14:00

午餐

14:00

-

15:00

张弛 博士

专题分享:

人工智能驱动的新生抗原发现与验证

15:00

-

16:00

戴文韬 博士

专题分享:

生物大分子药物研发的计算分析基础及应用实践

16:00

-

16:15

休息

16:15

-

17:15

圆桌讨论

嘉宾:张弛博士、戴文韬博士、冯华副总

智能药物设计前沿:从新生抗原发现到生物大分子药物创新


Day2 8月24日

时间

内容

9:00

-

10:00

MaXFlow界面和基本操作

MaXFlow背景介绍,界面介绍,入门操作、小分子结构构建、同源建模的原理、参数设置、同源模板的选取、模型的评估。

10:00

-

10:15

休息

10:15

-

12:00

AIDD方法介绍

介绍MaXFlow平台中的AIDD算法(基于配体的分子生成、基于靶点的分子生成、药靶亲和力预测、ADMET预测、QSAR模型、逆合成预测、贝叶斯优化实验设计EDBO等)的原理及应用、意义,并结合MaXFlow进行相应功能的使用、参数的调整以及结果的查看与分析。

12:00

-

14:00

午餐

14:00

-

16:00

CADD方法介绍

介绍MaXFlow中的分子对接以及分子动力学的原理和应用场景、分子力场、系综模拟、轨迹处理、性质分析(势能分析、RMSD、RMSF、回旋半径、氢键、溶剂可及表面积、蛋白质二级结构、盐桥、动态互相关矩阵、残基相互作用分析、主成分分析、自由能形貌图绘制、距离分析、π-π堆积、轨迹矫正、径向分布、蛋白质聚类、热力学性质分析)及相应的参数意义及设置;结合自由能计算方法:MMPBSA、炼金术转移法(ATM)和自由能微扰(FEP)的原理及应用。

16:00

-

16:10

休息

16:10

-

16:50

科学数据基因组SDH专题

结合SAR分析与机器学习,指导结构设计。

16:50

-

18:00

· 工作流搭建练习

· 课程讨论及答疑


Day3 8月25日

时间

内容

9:00

-

10:20

常用数据库介绍

PDB、UniProt、AlphaFold等大分子数据库;ChEMBL、PubChem、DUD-E等小分子数据库。

10:20

-

10:30

休息

10:30

-

12:00

小分子药物设计案例

结合实际案例,进行基于AI模型的虚拟筛选(QSAR模型)和基于物理模型的虚拟筛选(分子对接、分子动力学模拟、结合自由能计算)。

12:00

-

14:00

午餐

14:00

-

15:30

抗体药物设计案例

结合具体研发场景,进行抗体人源化及免疫原性预测进行,采用AI方法预测抗原、抗体结构,抗体-抗原互作模型的生成,之后进行抗体亲和力成熟,从而筛选出具有更高的亲和力和特异性的抗体。

15:30

-

15:40

休息

15:40

-

17:30

· 案例分享

· 课程讨论及答疑

17:30

-

18:00

颁发培训证书


2024暑期AI特训 · 生命领域

特邀嘉宾介绍

付伟 教授 

复旦大学

复旦大学药学院教授,博士生导师。主持7项国家自然科学基金项目、3项上海市生物医药基础重点项目、1项国际合作项目、GF重大项目子课题,973和863项目骨干。发表学术论文90篇,授权18项专利,在美国和中国获多个奖项。主编国家级十四五规划战略级教材1部,主编专著1部,国家级一流课程负责人。担任CBDD编辑,担任上海市衰老与退行性疾病协会常务理事、中国肝病联盟创始核心成员、中国药学会麻醉专委会会员、上海市女科学家协会会员。

张弛 博士 

国药中生上海生物制品研究所  

新靶点发现总监

本科毕业于中山大学药学院,硕士毕业于英国剑桥大学生物化学系,2015年博士毕业于英国伦敦大学癌症研究所肿瘤学专业,师从英国皇家科学院院士Paul Workman教授。2015-2021年历任英国伦敦大学癌症研究所博士后与研究员。2021年加入上海生物制品研究所任药物靶点研发总监。2022年入选国家高层次人才计划和上海市“浦江人才计划”,担任发展中国家生物制药联盟(EBPMN)科学顾问和上海生物工程学会理事。曾主持英国Wellcome Trust资助新药发现研究课题一项;主持英国Cancer Research UK资助的药物早期研发课题一项。作为主要完成人参与英国Cancer Research UK资助的研究课题两项。发表SCI科研论文13篇。主要科学发现在英国推动了I期临床实验一项;推动新靶点药物研发项目进入先导化合物优化阶段并获得A轮资助一项。

戴文韬 博士   

上海市生物医药技术研究院
研究员

2008年6月华东师范大学获生物技术学士学位;2014年6月中国科学院生物物理研究所获生物信息学博士学位。2014年8月至2022年8月,历任上海生物信息技术研究中心(众信生物)助理研究员,副研究员。2022年9月至2023年12月,任上海市生物医药技术研究院副研究员。2024年1月至今,任上海市生物医药技术研究院研究员。

上海市疾病与健康基因组学重点实验室联合课题组长,复旦大学药理学硕士生导师,上海理工大学生物医学工程硕士生导师。中国生物物理学会生物医学信息分会委员。曾入选上海市青年科技英才扬帆计划和上海产业技术研究院创新先锋计划,获得上海市科技系统青年五四奖章(个人)和优秀共产党员、上海科学院和上海市生物医药技术研究院优秀共产党员等荣誉。

研究方向为生物信息学,转化医学,生物药设计。发展跨尺度多层次时空组学整合挖掘和生物分子计算所需数据库与分析方法,支持基于转化医学的诊断标志物和药物研发。聚焦转录代谢调控,发展适用于空间代谢多组学整合分析的数据库和计算方法,特别关注多模态学习和脂质代谢相关细分领域;在计算结构生物学领域,发展一系列计算工具,涵盖序列比对,结构预测和分子对接等功能,重点关注蛋白类生物大分子的设计优化;利用自主研发的计算工具,参与解决一系列重要科学问题和标志物及新药研发工作,成果发表在Nature Medicine、Nature Communications、Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Artificial Intelligence in Medicine等杂志。发表SCI论文40余篇,其中第一及通讯作者17篇。作为负责人主持国家自然科学基金、上海市青年科技英才扬帆计划等项目6项。作为子项负责人或骨干参与国家重点研发计划精准医学专项、上海市科委重大项目等5项。


2024暑期AI特训 · 生命领域

培训费用

注册类型

教育/政府科研客户

企业客户

培训费

RMB 3500元/人

RMB 4500元/人

8月9日前缴费或同一单位≥2人

RMB 3000元/人

RMB 4000元/人

5人以上团购

(不限同一单位)

RMB 2800元/人

RMB 3500元/人


注意:

1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理;学员需要自带电脑;

2、由学员自行组织团购,不限同一个单位,报名时务必备注团长姓名;

3、收到您的报名费后,我们会将PDF版本基本操作教程通过邮件发给您;

4、统一开据发票内容为 “培训费”,发票将在培训期间发给学员,若您对发票内容有特殊要求请发邮件至market@neotrident.com说明。


学员福利

专属优惠!


· 微信转发立减300元

分享本篇推文至朋友圈转发到至少一个分子模拟技术相关的微信群(50人以上),报名时上传截图可再享受300元的限定优惠。


· 软件免费试用2周

免费使用分子模拟与AI自动化平台及超算10000机时。


注意:

· 微信群不能是由创腾科技建立的相关群

· 此优惠活动可以与其他优惠叠加使用,最终解释权归创腾科技所有。


2024暑期AI特训 · 生命领域

报名方式

扫码提交报名,额满为止!


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培训联系方式 :

创腾科技陈老师:13916858963

创腾科技胡老师:13918936921

邮箱:market@neotrident.com

网址:www.neotrident.com


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创腾科技专注于生命科学和材料科学领域信息化的开拓与创新。通过AI及移动互联技术为用户提供计算模拟与数据建模、科研创新及质量合规等全方位信息化解决方案,在中国已有千余家用户。公司总部位于北京,在苏州、上海、广州和成都设有研发中心和分公司。
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