AC.目标导航的 CBT–半胱氨酸“订书钉”结合 CRISPR/Cas12a 扩增用于光电化学核酸分析

学术   2024-10-03 15:55   中国  


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全文简介
由于其高效率和广泛的应用范围,酶在基础研究和实际应用中都得到了广泛的研究和广泛的应用。在各种生化和生物反应中,如连接、扩增、剪切、催化和水解,酶发挥着各种作用。基于核酸扩增和连接相关酶,已经开发出几种流行的分子生物学技术,包括聚合酶链反应(PCR)、环介导等温扩增(LAMP)、重组酶聚合酶扩增、滚圈扩增(RCA)、回文分子信标、和催化发夹组装。在这些技术中,DNA聚合酶、逆转录酶、RNA聚合酶、DNA内切酶、和核酸连接酶发挥着重要作用。其中,连接酶作为中间类成分占有至关重要的地位,常用的有T4 DNA连接酶、SplintR连接酶、PBCV-1 DNA连接酶、和DNA连接酶IV(即Lig4)。由于其优异的热稳定性和特异性识别能力,这些连接酶可以高效地在核酸末端产生互补碱基对。然而,酶的存在也为后续反应提出了许多限制条件,例如需要严格的温度控制、更长的孵育时间以及金属离子(例如,Mg2+)的参与。非酶连接过程可能是理论上的替代解决方案。如今,无酶连接策略的发展才刚刚展开。
生物正交点击反应是Sharpless等人提出的模块化合成方案。典型的点击反应一般是指叠氮和乙炔在催化剂作用下的加成反应。已经报道了许多点击反应,如铜催化的叠氮-炔环加成、Diels-Alder反应、涉及杂环化合物的亲核开环过程、和基于Michael加成的反应,。这些点击反应具有产率高、选择性好、效率高的特点,因此应用于许多领域。此外,点击反应由于其良好的生物相容性和便利性,可以作为连接生物分子复杂结构的“桥梁”,例如肽、蛋白质和核酸分子。
本工作开发了一种基于点击反应的方法来实现RCA的连接过程。photoelectrochemical(PEC)信号由具有典型纳米棒结构的光电活性材料Sb@Co(OH)F产生,伴随着纳米粒子的粘附。Sb掺杂到Co(OH)F后表面形成多个结合位点,提高了PEC信号的强度。我们以HAV基因为模型靶点,制作了CBT和胱氨酸修饰的挂锁。连接由靶HAV基因引发,挂锁特异性地与靶DNA结合激活RCA。借助CRISPR/Cas12a裂解和PEC信号扩增,以无酶连接灵敏检测靶基因。本工作的目的是为构建基于无酶连接的RCA开辟一条新途径。
简介


相关成果以“Target-Navigated CBT–Cys “Stapling” Coupled with CRISPR/Cas12a Amplification for the Photoelectrochemical Nucleic Acid Assay”,发表在国际学术期刊“Analytical Chemistry”上。

文献链接:点击阅读原文

https://doi.org/10.1021/acs.analchem.4c03254

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