话廿六 |课题组来了个生物信息

学术   2024-11-07 23:58   江苏  


赛尔,你好。

这是生信家书的第二十六封。晚上的飞行,窗外的夜空明净如洗,洁白的弯月挂在深蓝色的天空上,像是蓝宝石上聚焦的光。飞机下降到云层以下,一座座城市的万家灯火,仿佛是闹脾气的天仙散落的金银珠宝,一簇簇亮晶晶的,由一条条珍珠藕连在一起。

飞机这样下降着,现实的世界也愈发清晰,公路上的汽车也能看的清了,我又回到了有烟火气的人间。出了机舱,在看看头顶的那轮弯月,已经没有那么皎洁,而是蒙上了一层朦胧的雾。

在这个过程中,我想起一本写给职场新人的书——《你的降落伞是什么颜色》。书中不乏对应届毕业生关于求职、面试的谆谆教导,这不是我们今天的话题,我们想聊的是:作为一个新人,以什么样的心态加入新的团队、如何适应新的环境、找准自己的定位、茁壮成长。

当然,我们聊的是关于生物信息的。

在我的生物信息经验中,第一份工作是带着对生物信息的憧憬去的,也是带着学生思维:抱着学习的心态去的。以至于在一开始的前几个月,自己的学生身份一直没有转换过来,就当自己是个学生,把每个项目作为一个学习的对象,去理解、去模仿、去复现。

其实,工作更多的时候需要去创造。在那之后的工作中,我常常告诫自己:百战归来再读书。工作中,要事第一,成事第二,以“事”为中心,而不是以“学”为中心。学无止境,而事可以拿出阶段性成果。

随着生命科学研究数据量的增加,特别是高通量测序技术带来的海量测序数据,开始让生命科学研究课题组建设生物信息团队。所以,一个经典的镜头出现了:

以湿实验为主的课题组,需要引进一个生物信息工作人员,来做组里的数据分析。

好了,时代背景是这样,那么具体的故事该如何展开呢?不同的课题组有着不同的故事,这个生物信息工作人员,将会为课题组带来什么样的新视角?会不会像王蒙的《组织部来了个年轻人》那样精彩?

远比这个精彩。

  • 首先,在课题组引进一个生物信息工作人员之前,一定是经历了一些事情,发现不得不自己建生物信息团队。如经历了分析外包方面的周期、质量等挑战。

  • 其次,这位生物信息工作人员,以什么身份加入这个课题组?从自己的学生队伍里培养,抑或是外面招一个?这个罗马都不是一天建成的。

  • 再者,这位生物信息工作人员如何快速以生信技术快速赋能团队的科学研究?

然后是,团队中的干湿实验人员比例达到动态平衡的结果。

让我们设身处地地想一想,课题组空降一个生信,作为生物信息的元始天尊,我们该或能如何自处?

一种是,既然课题组意识到生物信息的重要性,说明是手里已经有一批需要“好好分析”的数据。这时候的手里的牌面就非常明白了,就是处理好之前遗留的数据,直至发表(或用生物信息体现数据价值)。把之前的数据清洗整理,做一个在线的数据平台,给同课题组用,如shiny,是一个不错的选择。

另一种是,和课题组老师一起结合具体生物学问题,设计具有“生物信息学含量”的新课题。这个周期可能没有那么快了,我们不仅是把生物信息这个技术带进课题组,更是生物信息思维带进来。那,生物信息思维是什么?数据驱动发现。

作为课题组第一届生物信息人,生物信息元始天尊,大哥/姐大,我们面临的挑战很多,好几双不同期待的眼睛看着我们长大。有的眼中生物信息是绘画的,有的眼中是会计算机的,有的眼中是空手套白狼的,有的眼中是复制黏贴打工人,有的眼中是首席数据科学家。

不管如何定义,生物信息进课题组,并在课题组成长起来,是不以人的意志为转移的。生命科学或者往小了说现代遗传学,要不是孟德尔计算出来经典的3:1,把数学带进来,我们还在博物学的范畴。

飞机总会降落,我们也会走出舱门,融入这个万家灯火的世界,并在这里点亮一盏属于自己的灯。

你的运来
20241107
于南京


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