赛尔，你好。
这是生信家书的第二十一封。时值国庆假期，在朋友圈领略祖国大好河山。当然也有不少朋友选择回趟老家，看看家里一直未变过的两亩三分地，走走儿时上学的路。有些东西似乎从来不变，如地里的庄稼，春种夏长秋收冬藏，玉米小麦大豆芝麻，每年都会这样轮回。而有些看似不会变化的东西却经不起这四季的更迭，如建筑、路面、街道以及父母的双鬓。
这真真是：
回乡偶书
贺知章· 唐
少小离家老大回，乡音无改鬓毛衰。
儿童相见不相识，笑问客从何处来。
离别家乡岁月多，近来人事半消磨。
惟有门前镜湖水，春风不改旧时波。
在这第二十一封信里，就着这回到乡村又走出乡村的沿途风景，刚好谈谈生物信息的“农转非”，字面意义上：从用生物信息分析农口（动植物）问题转向分析医学问题。
你可能要问了：生物信息为什么会分为农口和非农口（医口）呢？
其实，作为一个学科，生物信息学本身并在农口非农口这方面有什么区分，就算作为一个生命科学工具箱也没这个区分，具体到基因组、转录组、表观组等多组学的分析流程上，这个区分也不大。就像数学作为一门学科，不因面对不同领域而有所不同一样。
还真不一样，在学物理的和学植物学的课程表中，对数学的要求是不一样的。农学生和医学生，在学高等数学的时候，用的教材是不是一样的呢？有不一样的，也有一样的：生化农医类。
之所以生物信息在应用领域中被大致分为农口和医口，主要原因是研究对象、目标和应用场景有所不同。
农口生物信息主要是分析动植物微生物，它的研究样本、实验设计、基因组多样性、基因组注释水平等都与医口有着很大的差异。农口生物信息主要通过分析作物和动物的基因组数据，可以识别与产量、品质、抗病性等相关的基因，进而通过遗传改良来培育新的品种或改善生态环境。农口在面对的样本类型和生物学现象上，要比医口多的多。
医口生物信息主要研究样本类型为人源样本，在发育生物学研究上还能参考农口中的动植物研究，但是肿瘤研究往往为医口所独有。尽管做动植物的目的还是为了做人，医口生物信息主要通过分析人类的基因组数据，可以识别与疾病发生、发展相关的基因变异，进而开发新的诊断方法和治疗药物，实现个性化医疗。从学业上来讲，医学生的课程更为紧张。
另一个重要而明显的区别是，农口与医口所能申请的项目经费和数量。
在这一差异上，有不少做农口生物信息研究同仁，特别是学术生涯的早期，有可能转向医口，实现农转非。
同一门生物信息学，在农口和医口中的不同应用，语境也有所差别。农口与医口的生物信息往往相互启承。基因编辑技术往往先应用于动植物研究、单细胞测序却是从解释人类发育研究中拓展到不同物种、医学中经常用的生存分析，农口中很少用、一些多倍体比对的工具，在人鼠样本分析中很难用到。工具在不同场景下会演化成不同的样子。
不管是农口还是医口，生物信息工具都有一条通向生物信息学的路：做软件开发、做算法开发、做知识发现、做传道授业。
不知道你的生物信息是哪一个呢？
你的运来
20241003
于南京
