Adv Sci丨华中科技大学王玉刚/郭雨松团队研究表明N6-乙酰赖氨酸在新生蛋白中的共翻译沉积有助于哺乳动物细胞的乙酰化

学术   2024-12-13 08:42   海南  


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N6-乙酰赖氨酸残基在膳食蛋白质中含量丰富,但膳食蛋白质对其的潜在影响知之甚少。

2024年12月4日,华中科技大学王玉刚,郭雨松共同通讯Advanced Science 在线发表题为Co-Translational Deposition of N6-Acetyl-L-Lysine in Nascent Proteins Contributes to the Acetylome in Mammalian Cells的研究论文。该研究阐述了Lysyl-tRNA合成酶(KARS)介导新生蛋白中膳食来源的N6-acetyl-L-lysine (AcK)的共翻译沉积,从而促进细胞乙酰化。

乙酰化膳食蛋白是AcK的直接来源,可以广泛而实质性地调节小鼠多器官的乙酰酶。通过分析AcK对哺乳动物细胞乙酰化的作用机制,发现KARS可以利用AcK作为替代底物产生N6-acetyl-L-lysyl-tRNA。在2.26 Å分辨率下,KARS与AcK配合物的晶体结构表明,由于Tyr499侧链翻转,AcK与L-赖氨酸具有相同的底物结合位。生成的N6-acetyl-L-lysyl-tRNA将AcK引入生长的新生多肽中,导致蛋白质乙酰化,包括隐藏在折叠蛋白质内部的翻译后修饰(PTM)不可及且功能重要的区域。这种未被证实的蛋白质修饰机制与PTM有本质区别,被称为共翻译修饰(coTM)。这有望扩大乙酰酶的范围,提高对细胞中蛋白质修饰机制的理解。

N6-乙酰赖氨酸残基在膳食蛋白质中含量丰富。在畜牧业中,赖氨酸乙酰化在动物和作物生长过程中自然发生。在食品工业中,赖氨酸乙酰化通过化学反应被大量添加到膳食蛋白质中,旨在改善商品蛋白质的物理化学和功能特性,如咖啡增白剂、烤肉调味剂、鱼肌原纤维蛋白和燕麦分离蛋白。

在哺乳动物中,如人类,赖氨酸乙酰化是一种频繁和重要的蛋白质翻译后修饰(PTM),调节蛋白质功能和细胞生理。例如,核心组蛋白的赖氨酸乙酰化是一类调节染色质功能的中心机制,如基因表达和DNA损伤复制。它对细胞外和细胞内的信号作出反应,并精确调节细胞过程以维持体内平衡。组蛋白乙酰化失调与癌症等人类疾病密切相关。N6-乙酰赖氨酸(AcK)在哺乳动物中被认为是一种功能鲜为人知的代谢物。

coTM-乙酰化与PTM-乙酰化相互作用的可能通路方案(图源自Advanced Science 

为了解决上述问题,研究给小鼠喂食了氘标记的乙酰化蛋白,并证实了乙酰化膳食蛋白是AcK的直接来源,可以广泛而实质性地促进小鼠器官(包括肝、脑和肺)的乙酰化。AcK在培养基中可以快速地转运到细胞中。 Lysyl-tRNA合成酶(KARS)可以交替利用AcK作为底物生成N6-acetyl-L-lysyl-tRNA, N6-acetyl-L-lysyl-tRNA参与蛋白质合成,并将AcK引入生长的新生多肽中,导致蛋白质在翻译过程中乙酰化。因此,我们将这种未记载的蛋白质修饰机制称为共翻译修饰(coTM)。coTM生成的蛋白质乙酰化与PTM机制沉积的蛋白质乙酰化在化学上相同。然而,由于coTM-乙酰化发生在多肽折叠之前,它可以导致PTM无法进入的折叠和掩埋区域的乙酰化,通过重新分析蛋白质内部残基间的相互作用来影响蛋白质的功能。


参考消息:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202403309

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