中国5种生境中土壤巨型病毒分析 | Microbiome

学术   2024-08-28 18:10   北京  



背景

土壤巨型病毒被越来越多地认为通过感染各种真核生物对生态功能产生深远影响。然而,目前对其生物地理学和生态学仍然知之甚少。


结果

本研究分析了来自中国5种生境类型(农田、森林、草地、戈壁沙漠和矿区废地)的333个土壤元基因组,并鉴定出533种隶属于九个科的不同巨型病毒类群,从而极大地扩展了土壤巨型病毒的多样性。在这九个科中,阔口罐病毒(Pithoviridae)是最为多样化的。大多数系统型在不同生境类型中呈现异质性分布,矿区废地中独特类群的比例显著较高。类群的丰度与其环境范围呈负相关。


本研究中发现的76种类群可在已发表的全球表土元基因组数据集中找到。在气候、地理、土壤和生物特征中,土壤真核生物被认为是不同栖息地类型中巨型病毒群落β多样性的重要驱动因素。此外,共现网络分析揭示了一些巨型病毒类群与真核生物(原生动物、真菌和藻类)之间的配对关系。对从我们的宏基因组中回收的44个中到高质量的巨型病毒基因组的分析不仅发现了它们高度共享的功能,还发现了与碳、硫和磷循环相关的新辅助代谢基因。


结论

这些发现扩展了我们对土壤巨型病毒的多样性、生境偏好、生态驱动因素、潜在宿主和辅助代谢的认识。




期刊简介

BMC 开放获取期刊 Microbiome 致力于为微生物生态学的研究人员提供一个良好的学术研讨平台。期刊接收范围包括微生物群在人类、动物、植物或环境中定殖的研究。


2023 IF:13.8

2023 下载量:3,219,809

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Unraveling the habitat preferences, ecological drivers, potential hosts, and auxiliary metabolism of soil giant viruses across China

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