可喜可贺!中医药迎来大机遇!“老药新用”发TOP!网络药理学+分子对接+实验验证!经典思路,优雅永不过时!

文摘   2024-11-04 10:00   上海  

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回归正题,中医药不仅是中华文明的宝藏,更是具有极高的医学科研价值。中医药有多成分、多靶点、多途径 的特点,在多个关键分子、信号通路进行干预,达到全面的治疗效果。
大海哥今天要给大家安利一个好用的思路——老药新用!话不多说,这就给大家分享一篇相关的文章,这篇文章挖掘中药名方:大秦艽汤,旨在挖掘其在治疗脑血管病的作用    
大海哥认为,类似的中药方成分和靶点复杂多样,替换疾病再去研究,可能有不小的收获哦~做中医药的你有没有狠狠心动?无论是创新思路还是生信分析都可以找大海哥帮忙哦!


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题目:运用网络药理学和分子对接技术探讨大芩角汤治疗脑血管病的作用机制
杂志:Phytomedicine
影响因子:IF=6.7
发表时间:20231月
研究背景
脑小血管病(CSVD)是一种常见的慢性脑血管疾病,其发病机制尚未完全阐明,目前西医治疗效果不佳且不良反应严重。大秦艽汤(DQJD)是治疗中风的经典方剂,临床上用于治疗 CSVD 有较好效果,但作用机制尚不清楚。网络药理学从整体和系统的角度揭示了 “药物 - 基因 - 靶点” 之间的相互作用,为研究中药复方的作用机制提供了新的方法。本研究利用网络药理学技术探索 DQJD 治疗 CSVD 的作用机制,通过生物信息学筛选 DQJD 的主要化学成分和潜在靶点基因,结合动物实验进行验证,为进一步开发和利用提供实验数据。    
研究思路
主要结果
1.CSVD 相关基因及 DQJD 靶点筛选结果
从 GeneCards、OMIM、PharmGkb 和 DrugBank 分别收集到 8152、55、76 和 1 个相关基因,去重后得到 8173 个 CSVD 疾病靶点;从 TCMSP 和 TCMID 收集到 246 个成分,经筛选和去重后得到 301 个 DQJD 作用疾病靶点,交叉后得到 270 个 DQJD 治疗 CSVD 的靶点数据    
图 2:展示了 DQJD 治疗 CSVD 的靶点数据以及直接活性成分 - 靶点相互作用网络
2.PPI 网络关键目标发现结果
构建了 DQJD 治疗 CSVD 的 PPI 网络,基于 CytoNCA 算法筛选得到 PTGS2、MMP9 等 40 个关键目标    
图 3:呈现了 DQJD 治疗 CSVD 的 PPI 网络以及关键目标
3.GO 和 KEGG 富集分析结果
GO 功能富集分析显示 DQJD 主要涉及对药物、氧化应激、脂多糖等的响应;KEGG 功能富集分析表明 DQJD 主要通过癌症、IL - 17 信号通路、TNF 信号通路、p53 信号通路等影响 CSVD
4.行为学实验结果    
旷场实验
与对照组和假手术组相比,模型组在旷场箱四边停留时间长等;与模型组相比,DQJD 组总移动距离显著缩短,活动次数显著增加,四边移动时间显著缩短,竖毛次数减少
Morris 水迷宫实验
与对照组相比,模型组逃避潜伏期在第 1、2 天显著延长;与模型组相比,DQJD 组逃避潜伏期在第 1、2、3 天有缩短趋势。在空间探索阶段,与模型组相比,DQJD 组在目标象限停留时间比例有上升趋势
图 6:展示了 Morris 水迷宫实验结果    
5.脑组织病理检测结果
对照组和假手术组神经细胞结构完整;模型组神经细胞稀疏、结构不完整;与模型组相比,DQJD 组海马 CA1 区细胞排列改善,细胞数量增加,结构相对完整,皮质神经元形态较好
图 7:呈现了大鼠海马 CA1 区和大脑皮质神经元的 H&E 染色结果
6.蛋白和 mRNA 表达检测结果
Western blot 分析
与对照组相比,模型组大脑皮质 Caspase3、C - FOS 和 P53 表达显著增加,JUN 显著减少;与模型组相比,DQJD 组大脑皮质 Caspase3、C - FOS 和 P53 表达显著降低,JUN 显著增加    
RT - PCR 分析
与对照组相比,模型组大脑皮质 Caspase3、JUN、P53 和 MMP9 mRNA 表达显著增加,C - FOS mRNA 表达显著降低;与模型组相比,DQJD 组大脑皮质 Caspase3、JUN、P53 和 MMP9 mRNA 表达显著降低,C - FOS mRNA 表达显著增加
   
图 8 和图 9:分别展示了蛋白和 mRNA 表达检测结果
7.分子对接验证结果
分子对接得到 19 个结合能≤ - 6 kcal/mol 的活性成分,与关键靶点有良好亲和力,选择 4 个结合能小的 “目标蛋白 - 活性分子” 绘制对接模式图    
表 1:列出了各成分与靶点的结合能等信息    
图 10:展示了对接模式图
文章小结
网络药理学+分子对接+动物实验,中医药经典思路,永不过时,换个疾病和药方,咱说不定就能实现中医药重大突破!如果你缺乏新思路或者分析受阻就来找大海哥帮你吧!


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