解锁NC，勿错过！恭喜湘雅医院团队再创佳绩！UK Biobank数据库联合孟德尔随机化，轻松登顶！速来get同款研究思路!

文摘 2024-11-12 18:03 上海

经典之法永不过时！UK Biobank数据库联合孟德尔随机化，临床医生的宝藏数据库既可以独占鳌头，也可以联合孟德尔随机化了！悄悄地看，千万不要告诉别人！！！趁别人不知道，自己偷偷发文章！

大海哥今天要分享的这篇是湘雅医院团队团队发表在NC的一篇文章，是一项涉及250341人关于衰老的全基因组关联研究（GWAS），并进行多变量孟德尔随机化（MVMR）分析，设计巧妙，思路清晰，不怪人家能拿下NC！

研究结果可靠：本研究分析了英国生物库中的325种NMR生物标志物，确定了54种与全因死亡率相关的代表性衰老相关生物标志物。使用来自95372名个体的全基因组测序（WGS）数据对这325种生物标志物进行全基因组关联研究（GWAS），并进行多变量孟德尔随机化（MVMR）分析，进一步增强研究结果的可靠性。

挖掘公共数据库：利用UK Biobank数据库发表的学术论文已经高达9,869项，不乏医学顶级期刊 NEJM，Lancet、JAMA 及其子刊。其中，中国学者参与的研究也高达2426项。可以说，这是宝藏数据库！(Ps:想学习UK Biobank数据库发文方法的同学以及需要协助选题或了解更多详情可以直接滴滴我哦，大海哥助你在学术领域脱颖而出！)

应用UK Biobank数据库我们可以很轻松的产出文章，如果联合孟德尔随机化当然会上大分！那今天介绍的这篇范文快来学习一下吧~

定制生信分析

云服务器租赁

加微信备注99领取使用

题目：来自英国生物库中的250341人的生物衰老代谢组学概况

杂志：Nature Communications

影响因子：IF =14.7

发表时间：2024年1月22日

公众号后台回复关键词“999”即可获得原文，文献编号：241112

研究背景

衰老是一个复杂的生物过程，导致生理功能受损，并可能导致虚弱。这是一个强大的风险因素，多种发病率和死亡率。因此本研究提出了一个全面的衰老相关代谢组学概况，并强调了其个性化衰老监测和早期疾病干预的潜力。

研究思路与数据来源

UK Biobank最近发布了大约275000人生成的NMR代谢组学数据。本研究目标是呈现生物衰老和衰老相关疾病的代谢组学特征。我们首先从325种NMR生物标志物中鉴定出衰老相关的生物标志物。然后，将这些与衰老相关的生物标志物与多种与衰老相关的不良健康结果联系起来。接下来，我们构建了一种新的代谢组学衰老评分，并探讨了其相对于其他衰老指标的优势及其潜在的临床应用。最后，通过对13263人的随访数据进行纵向分析，我们得出了代谢组学衰老率，这为参与者的个性化衰老状态提供了进一步的见解。

图1 研究概述

研究结果

1.54个与衰老相关的代表性代谢组学生物标志物

本研究用LASSO Cox模型鉴定了54种生物标志物的组合（28种在绝对水平上，26种在比率上），其对全因死亡率具有最佳预测性能。这54种生物标志物被选为代表性的衰老相关生物标志物。与先前报道的衰老或死亡相关的NMR生物标志物相比，本研究重复了参考文献中列出的与全因死亡相关的四种生物标志物，并具有一致的相关性。

2.衰老相关代谢组学生物标志物与虚弱之间的关联

使用来自95372个个体的子集的WGS数据对每个NMR生物标志物进行全基因组关联研究（GWAS）。在质量控制后包括具有次要等位基因频率（MAF）>0.1%的变体（方法）。基于325种核磁共振生物标志物的GWAS汇总统计，使用LDSC计算成对遗传相关性。确定了这些代谢组学生物标志物的广泛遗传相关性特征，特别是对于脂质和脂蛋白相关生物标志物。考虑到显著基因座的显著多效性和NMR生物标志物之间的相关性，我们进行了多变量孟德尔随机化（MVMR）分析，在287种NMR生物标志物和20种衰老相关疾病之间的5740种可能组合中，439对被确定为候选因果关系（由213种NMR生物标志物和所有20种疾病组成）

图2 多变量孟德尔随机化（MVMR）分析

3.NMR生物标志物与衰老相关疾病之间的候选因果关系

基于54个代表性的衰老相关的NMR生物标志物，我们开发了一种新的代谢组学衰老评分，作为这些生物标志物的线性组合，通过其全因死亡率的估计系数进行加权。与其他相比，代谢组学衰老评分在所有随访间隔的死亡风险预测中具有最高的准确性。

图3 随访间隔（从1年到15年）中全因死亡风险的不同标记指标的预测性能

4.代谢组学衰老评分在短期死亡风险预测中表现出色

继续研究这些代谢组学信号是否有助于区分加速衰老的个体。通常情况下，生物学上的老年人比同龄人更容易受到伤害，更容易患上与衰老有关的疾病。因此，研究了19种与衰老相关的疾病的平均基线在未来早发、其他发病和无疾病组之间的差异。早发组的平均基线高于其他发病组，其次是14种疾病的无病组，实际年龄作为协变量纳入分析。

图4 代谢组学衰老评分区分未来早发、其他发病和无病组19种衰老相关疾病

文章总结

本研究提出了与生物衰老相关的最广泛的代谢组学特征，并强调了本研究的代谢组学衰老评分在预测死亡率和疾病风险方面的潜力。但是设计这个评分的目的并不是推荐它作为生物衰老的单一权威度量，鉴于衰老的多面性，未来的研究应该从多个维度整合不同的衰老相关指标，例如，将蛋白质组衰老评分和表观遗传衰老评分与代谢组衰老评分相结合，以揭示更全面的衰老概况。读完此篇有没有想在你的课题研究中运用前沿的孟德尔随机化分析，却苦于找不到切入点，感觉无从下手？别急，你的科研救星来啦！我们将为你量身定制课题思路，让你的研究之路不再迷茫，让孟德尔随机化分析成为你科研路上的得力助手！别再犹豫，滴滴我们，与你一起探索科研的无限可能！

医学海公众号持续为大家带来最新科研思路，想复现这种思路或者定制更多创新性思路欢迎直接call大海哥，竭诚为您的科研助理！

最新热点思路

文献思路复现

创新思路设计

服务器租赁

超绝思路新鲜出炉！直接平地起高楼？准备好迎接国立成功大学林世杰团队“铁死亡+线粒体”把“毛坯”秒变“精装”的科研震撼吧！

震惊！只研究1种交互作用就拿到21分+？快进来学最严谨的交互作用分析方法

http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzk0NDUwOTM3Nw==&mid=2247501019&idx=1&sn=eca88d62a992b0df024bc627dc0b168c

医学海

实用医学学术平台：专注分享生物医学方向最新热点研究，高分思路分享

发NC的工作量大揭秘!且看药食同源+肠道菌群，双王炸如何让重庆医科大郭风劲团队顺利登顶！发刊、申国自然的都来~

目标基因选的好，经典生信思路也能上12+！复旦团队这篇预后模型+单细胞，99%都是生信，极具性价比！

服务器独享能到实在到什么程度？谁能想得到？

堪称“天花板”期刊：不收版面费，一审仅需3天，修改后竟然1天就接收，生信友好，国人发文超7成，简直完美！

真正的上分“利器”是多组学？南方医科大学0实验Q1新作！“单细胞+空间转录组”深度剖析“免疫微环境”，思路带你起飞！

样本量爆棚？分析深度加码？选对服务器，省心科研无忧！

机器学习又闷声干大事！联合单细胞分析+分子对接，不用测序，纯生信拿下2区6分+，南通大学团队这思路和期刊选的妙！

网药新组合上分嘎嘎快！浙江中医药大学玩出新花样“谱效分析+网药”深度融合，干湿并用狂揽一区Top！

我没看错吧！南方医科大学吴娴波团队挖掘UKB数据库，仅七张图表，就这么水灵灵的发了26.7分！怎么做到的？快来取经！

我宣布！这篇AS将被我放在心尖尖上！顾建美、张徐团队“巨噬细胞+外泌体+糖酵解”王牌思路包丝滑的，简直就是我的心头好！

不到一周就见刊了？这速度堪比中东土豪购物啊！孟德尔随机化带你急速登刊，还在等什么啊，着急毕业的宝子速来！

中医药的风依旧很大！中国中医科学院团队这篇文章做的是“中药复方调节氨基酸稳态和PI3K/AKT/mtor通路”，值得学习~

曹雪涛院士3天连发3篇高水平文章（1篇29+），真的牛！“单细胞+空间转录组”上大分！这把真是高端局，这“泼天的富贵思路”接起来

二区跃一区！发文量破万，还在逐年攀升！孟德尔随机化高光依旧，收拾收拾文章准备升咖啦！

IF 45.5，不愧是顶刊Cell!樊荣教授团队开发新技术，结合单细胞测序，这篇简直是空间转录组天花板！

Aging被踢又如何？这本1区6+Top神刊，清华大学都在投！谁投了谁知道好！

狂中国自然706项的热点！中国农大“巨噬细胞”与肠道菌群、色氨酸代谢梦幻联动，大有反超“免疫”之势，不容错过！

IF 27.7！TCGA+GTEx老树开花，纯生信轻松卷上Mol Cancer！不是实验做不起，而是纯生信更有性价比！

中医药人又幸福了！网络药理学+分子对接+多组学的绝佳组合，上中医团队2个月拿下药学TOP刊！码住收藏！

2个月登顶药学神刊！中医药发文“套路”算是让浙大团队玩明白了！就看“虚拟筛选+化学蛋白组学+代谢组学”如何在一区大放异彩!

机会来了，获得生信大神同款必备生信服务器，不要错过

研究靶点如何丝滑切入？暨南大学查振刚团队这篇文章单细胞测序入手，结合“国自然王炸”糖酵解+巨噬细胞，4个月登上AS！

档次层层加码！XX疾病细胞异质性+单细胞分析，揭示XX机制，可别小瞧这个思路，保你一做一个不吱声！

如何看待Science Advances影响因子疯狂下跌？复旦大学硕士共一打的巨噬细胞+代谢重编程组合拳，化身科研界的变形金刚！

绝了！和 “潘展乐” 速度有的一拼！20天飞速接收，孟德尔随机化这篇5分+文章，绝对是生信小白的神助攻！上分没跑了~

齐鲁大地，人才辈出！齐鲁口腔医学院靠“单细胞+免疫抑制”思路，干湿结合拿下12分+，这是要技术有样貌啊！

样本量爆棚？分析深度加码？选对服务器，省心科研无忧！

远离F刊，孟德尔随机化依旧嘎嘎发文！药靶MR联合多组学，天作之合拿下一区Top 8分+，抓紧复现！

妥妥友刊向你招手，快来投稿！不愧是华西医学院，MR搭配单细胞测序带你弯道超车，思路超绝，想毕业的来！

火爆全领域的孟德尔随机化又杀疯了！代码公开！IF 20+的Nature子刊直接拿下，你信不信，这还不是MR的上限！

年轻有为！88年的他，优青、杰青、副院长！2024年更是势如破竹，目前已发表9篇SCI，累计影响因子达200+！

绝了绝了！中医药又发纯生信，机器学习成关键加分点！暨南大学凭药理学分析+分子对接轻松斩获一区SCI！

IF 31.7/ 子刊，饮食习惯并不是造成痛风的主要原因！青岛大学团队权威研究：遗传才是痛风的罪魁祸首！

中医药这泼天的富贵被山东中医药大学接住了！中药成分如何利用经典思路同时获得国家、省、市级自然科学基金支持？

cell顶刊：全球首个不同RNA种类的全貌空间分析！樊荣团队玩转全转录组，结合单细胞测序，天花板级别思路直接呈现！

IF 27.7！TCGA+GTEx老树开花，纯生信轻松卷上Mol Cancer！不是实验做不起，而是纯生信更有性价比！

IF：11.4！双1区顶刊中的“水刊”，巨好投！青岛农大张西峰团队：铁元素切入，多组学加持，4个月拿下！这波操作赢麻了！

IF 12.4/Q1！三校联手共同打造数据整合利器！scRNA-seq+转录组+机器学习，用这个思路上分，体验“飞”一般感觉！

热度不减的cGAS-STING信号通路？结合线粒体自噬登上“巨型顶刊”Nat Commun！绝佳思路上发大分！

出息了，我的宝！硕士共一勇夺27.7分Cell大子刊，西南医科大学“乳酸化+线粒体转运”的课题思路一骑绝尘！乳酸化修饰真的全面！

这本期刊IF连年上涨，速来取经！成都医学院团队：单细胞测序+一丢丢实验，斩获一区TOP，思路这么绝还不快来学！

每个生信人都需要一台服务器

5+超级“水刊”从预警到Top，成功逆袭！天津医科大学团队瞅准时机，多组学+PCR两个月轻松拿捏！临床快速发文捷径在此！

解锁NC，勿错过！恭喜湘雅医院团队再创佳绩！UK Biobank数据库联合孟德尔随机化，轻松登顶！速来get同款研究思路!

6分+纯生信！单细胞竟如此吃香！海南大学团队又一佳作，升级版思路基础和临床都适用！快看过来啦~

Nat Commun到底有谁在啊，单细胞文章全过去了！中国医学科学院团队：scRNA-seq联合单细胞T细胞受体测序再创佳绩！

中医药人的理想型文章！西北大学朱忠良团队完美融合“网络药理学+代谢组学+肠道菌群+动物模型”，天花板级别的科研思路，还不赶紧领走

师弟逆袭记：如何通过租服务器，从实验室新手到生信专家的华丽转身

这把MVP跑不了了！哈尔滨医科大学张学院士团队:孟德尔随机化与单细胞强强联手，大招一出，所向披靡！

分类

时事

民生

政务

教育

文化

科技

财富

体娱

健康

情感

旅行

百科

职场

楼市

企业

乐活

学术

汽车

时尚

创业

美食

幽默

美体

文摘

原创标签

时事社会财经军事教育体育科技汽车科学房产搞笑综艺明星音乐动漫游戏时尚健康旅游美食生活摄影宠物职场育儿情感小说曲艺文化历史三农文学娱乐电影视频图片新闻宗教电视剧纪录片广告创意壁纸头像心灵鸡汤星座命理教育培训艺术文化金融财经健康医疗美妆时尚餐饮美食母婴育儿社会新闻工业农业时事政治星座占卜幽默笑话独立短篇连载作品文化历史科技互联网

发布位置

广东北京山东江苏河南浙江山西福建河北上海四川陕西湖南安徽湖北内蒙古江西云南广西甘肃辽宁黑龙江贵州新疆重庆吉林天津海南青海宁夏西藏香港澳门台湾美国加拿大澳大利亚日本新加坡英国西班牙新西兰韩国泰国法国德国意大利缅甸菲律宾马来西亚越南荷兰柬埔寨俄罗斯巴西智利卢森堡芬兰瑞典比利时瑞士土耳其斐济挪威朝鲜尼日利亚阿根廷匈牙利爱尔兰印度老挝葡萄牙乌克兰印度尼西亚哈萨克斯坦塔吉克斯坦希腊南非蒙古奥地利肯尼亚加纳丹麦津巴布韦埃及坦桑尼亚捷克阿联酋安哥拉