1635年,皇太极击败了漠南蒙古林丹汗,得到了蒙古黄金家族的传国玉玺,登上了蒙古大汗的宝座。此后,蒙古各部都宣称臣服于清朝,包括准噶尔部和和硕特部。此后,准噶尔部迅速强大起来,1675年,其首领噶尔丹击败了盟主鄂齐尔图汗,随后在1678年正式建立准噶尔汗国。
准噶尔汗国的兴起对中亚和东亚的格局产生了巨大的影响,在准噶尔的压迫下,土尔扈特部被迫西迁到了伏尔加河一带,和硕特部东迁投靠清朝。准噶尔长期和俄罗斯勾结,向西和哈萨克汗国开战,向东向清朝争夺土地。
此时的亚欧大陆正进入了跑马圈地的黄金时代。清朝和俄罗斯正在进行了人历史上最壮烈的领土扩张的竞争。在1657年,俄罗斯把疆域扩张到了太平洋沿岸,随后不断向蒙古、中亚、西域扩张,而清朝也在17世纪后期完成了对汉地的统一。此后,双方的竞争就公开了。1688年,康熙在雅克萨之战中击败了俄国人,逼迫俄国人进行了谈判,划定两国疆界。然而在谈判过程中,葛尔丹却趁机出兵占据了喀尔喀蒙古地区,使得抵抗俄国的蒙古喀尔喀蒙古军撤回,导致沙俄占据了贝加尔湖以东地区。这一个突发的局势使得清朝不得不在谈判中让步。
1689年,清朝和俄国签订了《尼布楚条约》,随后康熙得以腾出手来专门对付葛尔丹。而噶尔丹出兵喀尔喀蒙古后,其后方却发生了分裂。策妄阿拉布坦由于受到噶尔丹攻击,于是割据自立。噶尔丹无法击败策妄阿拉布坦,于是试图向东扩张。1689年,噶尔丹率领大军长驱直入,从西域不远万里来打清朝。这件事情彻底激怒了康熙,立即进行全面战争准备,并且向俄罗斯交涉,要求其不能干预。随后康熙亲率10万大军分五路进攻噶尔丹,双方大战于乌兰布通,这是东亚第一场大规模的热情兵器战争。最终,清朝的重型火炮攻陷了葛尔丹设置了“驼城”,葛尔丹失败。
乌兰布通之战,使得葛尔丹元气大伤。随后,策妄阿拉布坦也率领军队从后方进攻噶尔丹,葛尔丹两面受敌。1695年,噶尔丹再次出兵喀尔喀蒙古,康熙再次御驾亲征。这次战役,葛尔丹的3万铁骑难敌康熙的20万军队,而策妄阿拉布坦也趁机夺取哈密,切断其退路。最终,噶尔丹在1697年3月服毒自杀。葛尔丹是蒙古历史上最著名的人物之一,他的野心是建立一个统一的黄教蒙古国。可惜,他遇到了更厉害的康熙。
葛尔丹去世后,策妄阿拉布坦(简称策妄)成为了准噶尔汗国的大汗,他向康熙表示臣服,双方迎来了暂时的和平局面。此时的准噶尔汗国开始向哈萨克汗国进攻。1699年,准噶尔击败了哈萨克汗国,使其分裂为了大玉兹、中玉兹和小玉兹三个汗国,并均臣服于准噶尔。同时,策妄又出兵和俄罗斯交战,使得俄罗斯在中亚的扩张一度停滞。这时期的准格尔汗国已经进入了顶峰,可是他偏偏又惹怒了康熙。
这个得从西藏说起了。西藏是黄教的圣地,葛尔丹是经过喇嘛的册封才正式建立汗国的。1642年,青海一带的和硕特汗国攻入了西藏,统一了整个青藏高原。而和硕特汗国也属于卫拉特蒙古的一部,但是其首领却宣布臣服于清朝。1707年,策妄秘密支持西藏的桑结嘉措发动对和硕特汗国的反叛,结果遭到和硕特拉藏汗的镇压而失败。1717年,策妄派台吉大策凌敦多布率6000军军队从伊犁长驱直入攻占了拉萨,灭和硕特汗国。随即,1718年,清朝也出兵西藏,被策零顿多布击败。1720年,康熙再次派遣三路大军出发,最终将准噶尔的势力赶出了西藏。此后,康熙皇帝命令驻守喀尔喀地区的军队进攻准噶尔,一直打进了乌鲁木齐,并屯田于吐鲁番。此时,哈萨克汗国也开始进攻准噶尔,策妄面临四面楚歌,做好了最坏的打算,准备逃亡俄罗斯。
就在关键时刻,康熙去世了,随后驻守在西藏的西域的军队纷纷撤回。1722年,雍正继位,而雍正对大将军胤禵实施了终身圈禁,并进行了大规模的清洗,导致雍正前期的军事衰落。此后策妄又重振旗鼓,于1723年支持罗卜藏丹津在青海发动叛乱,但是很快也被清朝给平定。1724年,雍正在青海设置西宁办事大臣,随后又在1728年设置了拉萨办事大臣,将青藏纳入了清朝的版图。在康熙去世不久,策妄也于1727年去世,其子噶尔丹策零继位后,清朝和准噶尔的战争也从青藏高原再次向漠北转移。
从1729年到1734年,雍正和噶尔丹策零在漠北进行了4场大规模的交锋,分别是科舍图之战、和通泊之战、鄂登楚勒之战和光显寺之战。在前面几次战役中,双方互有胜负,僵持不下,而光显寺之战是双方的大决战。1732年,噶尔丹策零率兵3万绕开清军驻地,直接进攻喀尔喀蒙古。而清军得知消息后,突袭噶尔丹策零的营地,双方大战其中,最终噶尔丹策零惨败而归。此次战役后,准噶尔和清朝议和,双方在1734年签订了和平协议,规定两大帝国以漠北杭爱山为界,以东属清,以西属准噶尔。
和平协议签订后,双方在30年的和平。1745年,噶尔丹策零去世,其子策妄多济那穆扎勒即位,他是准噶尔汗国历史上第一位昏君。他在位期间,荒唐不理政务,并且引发准噶尔的内乱,这场内乱时间十分长久,使得汗国元气大伤。而此时的俄罗斯也试图消灭准噶尔,将其吞并,哈萨克也磨刀霍霍,准备分一杯羹。如果清朝再不出手,准噶尔将被俄罗斯占据。
1754年,阿睦尔撒纳率领2万余人投奔清朝,乾隆认为消灭准噶尔汗国的时机已经成熟,因此决定出兵西域。1755年,乾隆调集五万兵,分两路向准噶尔进攻。一路由乌里雅苏台出发,由于准噶尔混战已久,当地的各大部族都希望清军能够实现地区的和平,于是纷纷投降。很快,准噶尔汗国就宣告灭亡。
准噶尔汗国灭亡后,清朝最初决定在此进行分封,将准噶尔汗国分为四部分,其中投降于清朝的阿睦尔撒纳也是其中一汗。然而阿睦尔撒纳随后又试图统一准噶尔,重建准噶尔汗国。乾隆皇帝得知后,重新分封四大汗国,准备第二次远征西域。1757年,清朝军队再次进攻伊犁,阿睦尔撒纳各部纷纷叛乱,投降于清朝。于是清军轻而易举就占据了伊犁,阿睦尔撒纳逃亡俄罗斯。
准噶尔灭亡后,但是南疆地区还未纳入清朝的版图。南疆地区本来是察合台汗国的土地,后来被叶尔羌汗国取代。在叶尔羌汗国后期,国内存在着两大宗教势力,分别是黑山派和白山派,其首领叫做“和卓”。1680年,白山派在葛尔丹的支持下驱逐了黑山派,实现了对叶尔羌的宗教控制。
1692年后,叶尔羌汗国内乱不止,准噶尔汗国趁机吞并了叶尔羌汗国,将白山派的大和卓波罗尼都小和卓霍集占囚禁。清朝灭准噶尔汗国只是,大小和卓被释放,并表示臣服于清朝。然而,大小和卓在回到南疆之后,就反叛清朝。1757年,清朝军队开始进入南疆平叛,到1759年,大小和卓之乱被平定,南疆纳入清朝的版图。
平定大小和卓是清朝统一中国战争的最后一役,使天山南路复入中国版图。西域平定后,乾隆改名为“新疆”,意思为“故土新归”,1762年,清朝正式在新疆设置了伊犁将军,并进行了一定程度的改土归流。此后哈萨克、浩罕、布哈尔、安集延、巴达克山、爱乌罕(阿富汗)、博洛尔、乾竺特(坎巨提)等部落都臣属于中国。中亚被纳入了清朝的势力范围。