在进化树美化项目中,无论是添加样本信息或基因组数据,还是更改分支形式或样本名称,都可以通过Datasets来完成,这里我们整理了进化树Datasets注释的3种不同方式。
Method 2:在Datasets面板中创建数据库并粘贴数据
* Method 1仅适合少量样本和注释信息的情况,且不能保存填写的数据;Method 2是更为常用的方法,在一定程度上可以代替Method 3-iTOL模板注释,但需要注意的是并不是所有注释都可以直接在iTOL中直接进行,某些“Type”不支持创建。
Method 3:在Datasets面板中上传注释模板
iTOL模板下载方式参见文章“iTOL模板下载及用途说明”。
iTOL模板内容讲解参见文章“iTOL模板组成结构解析”。
* Method 3适用于所有类型的数据注释,包含Method 2中的全部功能,且可以同时完成参数设置,是三种方式中最常用的类型。
多项创建或注释的界面位置
主要内容:
进化树理论知识:剖析进化树的类型、生物学意义,掌握常见算法及其结果解读。
iTOL基础操作:学习数据上传、基础设置及结果导出的完整流程。
标签与样式调整:掌握标签信息修改、样式设定、分支样式调整及clade分组的应用。
特征信息可视化:深入了解如何通过条带、符号、热图等形式展示样本背景或基因组特征信息。
统计数据可视化:实操讲解柱状图、堆叠图、饼图及关联性图表的应用,提升统计数据的表现力。