近日,外国学者在《Gut Microbes》发表论文Effect of diet on the gut mycobiome and potential implications in inflammatory bowel disease。本综述汇编了当前关于饮食调节对真菌群影响的文献,表明饮食变化可以改变肠道的真菌结构。需要进一步的研究来理解饮食对肠道真菌的影响,包括真菌发酵中涉及的代谢途径和酶。此外,研究饮食调节肠道真菌群是否可以作为IBD的治疗方法也是必要的。肠道微生物群是一个复杂的、独特的实体,与常见胃肠疾病的预防、发病机制和进展有关。虽然主要由细菌群体主导,但先进的测序技术已经识别出共生的真菌群落,统称为真菌群。早期研究表明,肠道炎症与微生物组成改变有关,这种改变被称为肠道菌群失调。改变的微生物特征与各种病理性疾病有关,如炎症性肠病(IBD),尽管它们作为全身炎症的原因还是结果,仍然是正在进行研究的主题。饮食在预防和管理各种疾病中起着至关重要的作用,被认为是全身炎症的重要调节器。本综述汇编了当前关于饮食调节对真菌群影响的文献,表明饮食变化可以改变肠道的真菌结构。需要进一步的研究来理解饮食对肠道真菌的影响,包括真菌发酵中涉及的代谢途径和酶。此外,研究饮食调节肠道真菌群是否可以作为IBD的治疗方法也是必要的。这篇综述主要探讨了饮食调节对肠道真菌群(mycobiome)的影响,以及肠道真菌群与炎症性肠病(IBD)之间的关系。以下是综述的主要内容概述:
研究方法:独立检索了EMBASE和MEDLINE数据库,寻找了1947年至2024年间发表的关于饮食调节对真菌群影响的研究。
1 炎症性肠病(IBD):IBD包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC),这两种疾病都具有慢性、复发性的特点,给患者带来重大的疾病负担。IBD的发病机制涉及过度的T细胞介导反应、遗传倾向、环境触发因素和肠道微生物群。
2 肠道真菌群是肠道微生物群的一个组成部分,包括与肠道健康有益的和有害的真菌。研究将真菌群分为定居种和非定居种,定居种能够在肠道缺氧环境中生长,而非定居种则通常不贡献于肠道生理。
3 饮食对肠道真菌群的影响:饮食是影响肠道微生物群的重要因素,包括细菌和真菌。饮食改变可以改变肠道真菌的结构,但目前对饮食如何影响肠道真菌的了解仍然有限。
肠道真菌群在IBD中的作用:IBD患者的肠道真菌群组成与健康人群不同,这可能与疾病的炎症状态有关。例如,IBD患者肠道中的白色念珠菌(Candida albicans)数量增加,可能与炎症状态有关。
4 饮食调节和肠道真菌群:饮食中的碳水化合物、蛋白质和脂肪对肠道真菌群的影响尚不清楚。一些研究表明,碳水化合物的摄入与真菌生长有关,而蛋白质和脂肪的摄入可能通过影响肠道细菌来间接影响真菌群。
5 真菌发酵饮食成分:虽然研究表明真菌群对饮食变化有反应,但对饮食如何影响这些微生物的功能能力仍然知之甚少。真菌作为真核生物,其代谢途径与细菌等原核生物有所不同。
6 饮食模式和习惯:不同的饮食习惯和模式对肠道真菌群的组成有显著影响。例如,城市化和饮食习惯的差异可能导致不同地区人群的真菌组成不同。
7 真菌群的分析:分析肠道真菌群面临许多挑战,包括样本收集方法的选择、真菌DNA的提取、测序技术的选择等。
图 1. 示意图强调了对饮食、肠道真菌群和炎症之间相互作用肠道微生物群是一个复杂的、独特的实体,它对环境、饮食和疾病的变化做出反应。它充满了来自所有生物界的微生物,通过复杂和动态的关系进行互动。真菌在微生物群的稳态中扮演着关键角色,参与调节机会性病原体和发酵无法接触的营养物质。真菌群结构的改变与菌群失调有关,这是一种炎症免疫状态,与包括IBD在内的各种慢性病有关。根据IBD的表型和严重程度,真菌群的配置文件会有所不同,血清学标志物作为疾病进展的指标显示出潜力。饮食对肠道真菌群的影响仍然不清楚,特别是关于消化道内的真菌是否具有发酵各种饮食成分所需的代谢途径和酶。进一步的研究对于改进真菌DNA提取协议和开发特定于真菌测序的数据库至关重要。此外,还需要研究饮食在调节超出细菌的微生物群方面的作用。旨在理解真菌发酵/利用饮食成分所涉及的代谢途径和酶的机制研究也至关重要。更深入地了解饮食如何塑造肠道真菌群的组成和功能能力是必要的。 Genelle R. Lunken教授是BC儿童医院研究所的研究员,研究方向集中在利用肠道微生物组作为生物标志物来预测炎症性肠病对饮食干预的反应,探索饮食成分对肠道病毒群和真菌群的影响,以及评估富含纤维的独家肠内营养策略对儿童克罗恩病的治疗效果。