【Cell】人类微生物组中的类病毒共生体

文摘   2024-11-02 08:00   中国澳门  
  • 文章亮点
Obelisks是一类系统发育上独特的微生物组相关类病毒 RNA
Obelisks在全球多种生态位中发现,也存在于人类的粪便和口腔微生物组中
人类口腔细菌链球菌(Streptococcus sanguinis SK36)携带一种独特的“obelisk-S.s”
在充足的生长条件下,obelisk-S.s 对 SK36 的生长似乎是可有可无的

  • 文章总结

文章描述了“Obelisks”,这是一个可遗传的 RNA 元素类别,具有几个特征:(1) 显示为环状的 RNA,基因组组装约为1 kb,(2) 预测的棒状全基因组二级结构,以及 (3) 编码一种新型“Oblin”蛋白超家族的开放阅读框。Obelisks的一个子集包括一种变体的自切割锤头核酶。Obelisks形成了独立的系统发育群,与已知生物因子没有可检测的相似性。通过全球调查识别出 29,959 个不同的Obelisks(以 90% 的序列相似性聚类),来自各种生态位。Obelisks在人体微生物组中广泛存在,在查询的粪便和口腔转录组中分别检测到约 7%(29/440)和约 50%(17/32)。确立了链球菌(Streptococcus sanguinis)作为特定Obelisks的细胞宿主,发现该Obelisks的维持对细菌生长并非必需。我们的观察将Obelisks识别为一类尚未确定影响的多样化 RNA,已在人体和全球微生物组中定殖并未被注意到。

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