网络药理学难上5分+?那可不见得,有了机器学习和干湿结合,拿下11分+也未尝不可!2个多月发文,太惊艳了!

文摘   2024-11-20 19:00   上海  


大麦前面分享了一些比较简单的网络药理学思路,然后就有粉丝私信我:网药是难上5分+了吗?

首先澄清一下:不是的,要看你的思路和工作量!

网药已经火了很多年了,经久不衰,但大家去翻一翻最新的网药文章,不可能跟网药刚火的时候做的质量和工作量一样,所以说,如果你还用老套路,尤其是很简单的老套路去发文,那不是难上5分+,是难发出来;反之,如果你有创新思路,或者常规套路加一些实验,那很有机会发5分+的;再进一层,如果你既有创新思路,又有实验充实工作量,那还有机会冲击8分+甚至10分+!(Ps:网药老套路难发,新思路难设计,咋办?别担心,大麦来解救你,个性化思路设计不在话下!有了新思路但自己实现不了?还是联系大麦,定制化分析适合你,专业生信团队十年经验,竭力为您服务~

今天大麦就分享几个冲出5分+的思路,要么思路新,要么工作量大,想发高分求突破就快学起来吧网药思路变化多,到底该选哪一个?不知怎么选就找大麦!可评估思路、可个性化思路设计、可定制生信分析,硕博团队,你需要的我都有,大麦随时等待你的召唤~

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1. IF=11.4分,网药+机器学习+体内外实验(探索机制)    

题目红景天苷通过SCD1介导的脂肪生成和NCOA4介导的铁蛋白吞噬增加三阴性乳腺癌对铁死亡的敏感性

研究思路:首先通过网络药理学、生信分析和机器学习算法来筛选靶点,然后利用体外细胞实验和体内动物实验证明Sal的抗TNBC作用。接下来,研究Sal通过诱导铁死亡来抑制TNBC的机制。

2. IF=8.5,网药+代谢组学+分子对接    

题目:代谢组学和网络药理学揭示蓖麻蜜抗化脓性链球菌的机

研究思路:本研究首先对比多种蜂蜜对链球菌的抗菌能力,选中锥属蜜深入研究。通过代谢组学分析其抗菌代谢物,结合网络药理学预测靶点,再经分子对接验证,最终揭示其通过影响特定代谢途径和酶活性抑制细菌的机制。

 

3. IF=7.7,网药+药物递送    

题目:囊泡红棕榈蜡凝胶包封生姜(Zingiber officinale Roscoe)的综合研究:网络药理学、分子对接、体外研究和1期临床试验

研究思路:该研究首先收集与肌肉骨骼疼痛、炎症相关的靶点,生姜、红棕榈蜡和红棕榈油的活性成分和靶点,将靶点取交集,建立成分-目标-途径-疾病网络和PPI网络。此外,还利用KEGG和GO数据库进行了富集分析,通过分子对接模拟进一步证实了假定的生物活性成分和主要靶标的结合。在阐明了红棕榈油和生姜共同的炎症抑制机制后,作者配制了一种负载包封生姜提取物囊泡的红棕榈蜡凝胶,利用 Box- behnken 设计法,对所开发的囊泡凝胶配方进行了优化。随后,对配制物质的物理性质进行了评估。使用 Raw 264.7 细胞试验评估了优化后凝胶配方的抗炎活性。此外,还按照 ISO10993 标准检测了优化后的药膜凝胶配方的生物相容性。    

4. IF=6.9,网药+分子对接+分子动力学模拟+GMFA分析+实验

题目:新的系统生物学实验模式揭示了罗汉松树脂酚在前列腺癌中的抗转移潜力:网络药理学、生物信息学和实验验证的综合方法

研究思路:该研究首先通过GeneCards和DisGeNet数据库收集mPC相关靶点,通过Swiss Target Prediction、Superpred和Pharmapper数据库识别MAT药物靶标,取交集获得MAT抗mPC潜在靶点。进而构建PPI网络识别中枢靶标,进行和GO、KEGG功能富集分析,然后建立“化合物-靶点-途径(C-T-P)”网络。针对中枢靶标,在UALCAN数据库中进行表达验证,并分析其与生存预后的关系。通过分子对接探索了MAT与中枢靶点的相互作用,并分子动力学模拟研究其结合的稳定性。通过GMFA方法为每个枢纽基因发现10个额外的基因,建立了一个基于GMFA的MAT抗mPC扩展数据库(GMFA-ED)。最后通过体外细胞实验验证MAT的抗mPC转移潜能。    

5. IF=6.7,网药反向筛选+分子对接+体内外实验验证

题目:抗焦虑和抗抑郁药物-食品类似物的网络药理学筛选和体内外评价

研究思路:首先从Drugbank、TTD、GeneCards数据库中获取焦虑和抑郁相关靶点,利用PPI网络确定核心靶点,在TCMSP数据库中查询核心靶蛋白以检索相关活性成分,然后在 HERB 和 TCMSP 数据库中进一步探索这些活性成分以确定相关的草药,构建“焦虑和抑郁靶标-活性成分-草药”网络。基于以上网络药理学结果和分子对接,确定具有抗焦虑和抗抑郁潜力的前十种草药。进一步筛选具有细胞保护作用和无毒特性的草药以配制草药混合物。随后,在小鼠中建立了 PC12 细胞损伤模型和慢性不可预测的轻度应激 (CUMS) 模型,以评估草药制剂的效果。    

写在最后

网药创新思路还是很多的,想突破5分+也不是不可企及的事情。想要在中医药领域追求创新思路的朋友,建议紧跟大麦脚步,生信热点日更不停!想做个性化生信分析?欢迎随时联系大麦!专业团队为你保驾护航,1V1定制创新思路!

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