接下来是两项研究工具的重磅更新。其中,中国科学院动物研究所赵方庆研究员团队解决了空间蛋白质组学分析的一大挑战。长期以来,在整个组织范围内进行高分辨率蛋白质组学研究面临着巨大挑战,这也限制了对大量生物过程的理解。本文提出了一种名为PLATO(Parallel-flow projection and transfer learning across omics data)的集成技术框架,将微流控技术与深度学习结合,成功实现对组织切片中数千种蛋白质的高分辨率空间分析。在验证了PLATO的可行性后,研究团队将其应用于人类乳腺癌组织样本,结果PLATO鉴定出了两种不同的肿瘤亚型,发现了关键的蛋白失调,并深入解析了复杂的肿瘤微环境。论文指出,PLATO的出现为探索空间蛋白质组调控,及其与遗传和环境因素的相互作用提供了创新平台,有望在疾病诊断与治疗等领域发挥作用。DOI: 10.1016/j.cell.2024.12.023