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单细胞转录组标准分析
单细胞转录组高级分析
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大多数细胞状态转换,无论是处于发育,重编程还是疾病状态,都以基因表达变化的级联为特征。“pseudotemporal ordering”生物信息技术按进程对细胞进行排序,并在它们分化或经历某种其他类型的生物学转变时重建它们的“轨迹”。在上篇文章中已经介绍了monocle2的算法原理,本篇文章为monocle2的实操部分,包括令人头疼的软件安装一并解决。包含以下内容:
软件安装 创建CDS对象 预处理 轨迹定义基因的三种方法,重点! 可视化 拟时差异基因热图 分支分析热图 实战视频 测试脚本及安装包下载