您现在看到的是单细胞转录组高级分析的部分内容(持更中)...在阅读全文之前,推荐您先掌握单细胞转录组标准分析流程。
单细胞转录组标准分析
单细胞转录组高级分析
合集完整内容查看方式:
1. 合集付费:在公众号首页找到“单细胞转录组(高级分析)”合集标签,点击进入;或在CCtalk平台搜索《单细胞转录组分析流程-高级分析》,即可找到本合集全部已更新内容。
2. 单篇付费:在公众号首页找到“单细胞测序”合集标签,点击进入,即可找到单篇阅读入口。
大多数细胞状态转换,无论是处于发育,重编程还是疾病状态,都以基因表达变化的级联为特征。“pseudotemporal ordering”生物信息技术按进程对细胞进行排序,并在它们分化或经历某种其他类型的生物学转变时重建它们的“轨迹”。在上篇文章中已经介绍了monocle2的算法原理,本篇文章为monocle2的实操部分,包括令人头疼的软件安装一并解决。包含以下内容:
软件安装 创建CDS对象 预处理 轨迹定义基因的三种方法,重点! 可视化 拟时差异基因热图