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单细胞转录组标准分析
单细胞转录组高级分析
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本篇文章将介绍适用于单细胞的多组差异基因火山图代码，结果如下：
安装
如果要绘制环形，为了让clsuter及标注的基因也“变弯”，需要安装geomtextpath包，当前安装这个包需要将textshaping>= 0.4.0，以及ggplot2升到最新，解决完这两个包再安装geomtextpath。不过问题是，ggplot2升到最新后将会影响Seurat的一些绘图功能，谨慎操作吧。
> DimPlot(PRO,group.by = "seurat_clusters",reduction = "umap")
Error in Ops.data.frame(guide_loc, panel_loc) :
‘==’ only defined for equally-sized data frames
textshaping安装问题
如果升级textshaping遇到报错
Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) :
载入了名字空间‘textshaping’ 0.3.6，但需要的是>= 0.4.0
报错原因
<stdin>:1:10: fatal error: 'hb-ft.h' file not found
解决方法:
https://blog.csdn.net/weixin_30783611/article/details/140677544
以Mac为例：
brew install harfbuzz fribidi
重新安装，ggplot2需要升到最新
remotes::install_github("AllanCameron/geomtextpath")
多组火山图
diffData为seurat计算差异基因后的结果文件，包括上下调的结果。如果只想展示上/下调，可以换成第三种形式。先介绍第一种。
