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单细胞转录组标准分析
单细胞转录组高级分析
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美化-featureplot
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美化-降维图
细胞分化-基本概念1
细胞分化-基本概念2
细胞分化-monocle1原理
细胞分化-monocle2原理
细胞分化-monocle2实战
细胞分化-velocyto.R
细胞通讯-CellPhoneDBv5简介
细胞通讯-CellPhoneDBv5安装及使用
文献复现1-公共数据读取
文献复现2-Dotplot组图
文献复现3-GSE192742人肝细胞图谱1
文献复现4-GSE192742人肝细胞图谱2
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在之前的文章介绍了CellPhoneDB v5的安装使用,接下来看如何对结果进行可视化。
本篇文章是热图部分,在ktplots函数的基础上进行改进,稍稍修改源码。原版教程:
https://zktuong.github.io/ktplots/articles/vignette.html
主要改进了显示显著性个数,显示图例,修改之后的示例结果:
本文包含以下内容(视频+文字):
1.ktplots函数安装
2.绘图函数解析
3.热图改进
4.改进后的代码使用