【视频+代码】CellPhoneDB v5 | 下载安装、代码实操及结果解读

文摘   2024-10-18 17:57   江苏  

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合集说明

您现在看到的是单细胞转录组高级分析的部分内容(持更中)...在阅读全文之前,推荐您先掌握单细胞转录组标准分析流程。

单细胞转录组标准分析

单细胞转录组高级分析

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Cellranger上游分析(植物适用)

去批次-liger

美化-featureplot
美化-dotplot美化-featureplot
美化-降维图

数据库-植物干细胞

细胞分化-基本概念1
细胞分化-基本概念2
细胞分化-monocle1原理
细胞分化-monocle2原理
细胞分化-monocle2实战
细胞分化-velocyto.R

细胞通讯-CellPhoneDBv5简介

联合bulk-Scissor
联合单细胞atac-Liger

文献复现1-公共数据读取
文献复现2-Dotplot组图
文献复现3-GSE192742人肝细胞图谱1
文献复现4-GSE192742人肝细胞图谱2

合集完整内容查看方式:

1. 合集付费:在公众号首页找到“单细胞转录组(高级分析)”合集标签,点击进入;或在CCtalk平台搜索《单细胞转录组分析流程-高级分析》,即可找到本合集全部已更新内容。

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内容预览

本文包含以下内容(视频+文字):
1.安装及报错解决
2.下载数据库
3.测试数据下载
4.代码实操
5.结果文件说

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以下是正文部分

你好我是一只羊
个人号,内容主要涉及种质资源、分子标记开发及遗传多样性分析,表观遗传、编程语言在生物信息学中的应用、转录组、基因组、单细胞测序多组学数据分析等;其它更新平台:B站&小红书-一只羊做生信/捡羊毛的咩/生信小羊🐑
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