细胞标志物(Marker)是我们用来对细胞定义和分选的重要标志，不同的细胞往往有不同的标志物。比如做基础试验要培养细胞，为了鉴定你培养的细胞是不是你需要的细胞就需要检测细胞标志物（Marker）；在进行单细胞转录组数据分析时，非常关键的一步是根据细胞的特征性基因和特征性生物学功能去定义每一个细胞亚群。
如何快速找到某个细胞最具代表性的标志物呢？
本篇文章给大家分享2个查询细胞标志物的工具，查找的结果可以作为参考使用。当然，最终我们也需要结合文献去验证结果。
1）CellMarker
网址：http://xteam.xbio.top/CellMarker/
哈尔滨医科大学手动收集超过100,000篇发表的论文整理而成的数据库，记录了 4,124 项包括细胞标记信息、组织类型、细胞类型、癌症信息和来源的信息。
收集并存入 CellMarker 的包括158种人类组织/亚组织(涵盖467种细胞类型)、81种小鼠组织/亚组织(涵盖389种细胞类型)。
CellMarker主要功能
🔹浏览人类和小鼠不同组织中不同细胞的细胞标记；
🔹获取人类和小鼠感兴趣的任何组织中特定细胞类型的细胞标记；
🔹通过直观的统计图表，获取每种细胞类型中细胞最具代表性的标记物；
🔹将数据提交给 CellMarker；
🔹下载人类和小鼠不同组织的多种细胞类型的细胞标记。
① Home主页-全局视图查找主要功能
home主页提供了人和鼠的全局视图，击点击细胞组织，可以快速的查找标志物。
如：组织--脑--新型胶质细胞，点击细胞类型，它将跳到Marker词云图。从词云图可以看出，新型胶质细胞最常用的标志物是GFAP，词云图中越往中心靠近的且字体越大的标志物名称，说明生物学证据越多。
右侧栏目是对应标志物生物学证据的数量，也就是它出版物、文献数量。
在词云图的下方，显示了数据的来源渠道：单细胞测序、实验、综述以及公司等。
数据的每一个来源渠道都包含以下这些信息，在每一个条目的最后有more details按钮，点开可以获得更详细的信息，所有的信息都支持通过表格的形式下载。
② Browse主页-目录查找
这个浏览页面显示了细胞和组织的层次分类，可以选择人类或者是小鼠不同组织的细胞类型来查看细胞标志物，所获得的词云图和前面介绍的一致，这里不做赘述。
③ Search主页-检索查找
Search下有Cell search和Marker search。
Cell search：类似browse，展示了特定组织、特定细胞，同时可以在下面的伸缩框中选择组织、细胞进行重新搜索。
Marker search：选择物种后，我们可以通过输入基因名称，基因ID或蛋白质名称米搜索感兴趣的基因:
结果显示一个交互式气泡图和一个表格。交互式气泡图显示了感兴趣的基因在不同组织的不同细胞中用作细胞标记的频率。
④ Download主页
CellMarker数据库提供TXT格式的下载文件。我们可以下载所有细胞标志物的数据集。
⑤ Submit主页
有新的参考文献时可以提交新数据。
⑥ Help主页
网站使用帮助。
2）R&D 细胞标记交互式工具
网址：https://www.rndsystems.com/cn/resources/cell-markers
R&D 的细胞标记交互式工具，汇总了如下类型的细胞的标志物，可以查看用于识别每种细胞类型的常用人类和小鼠标记。
🔹Immune Cells：免疫细胞；
🔹Neural Cells：神经细胞；
🔹Organelles：细胞器；
🔹Stem Cells ：干细胞；
🔹Kidney Cells：肾脏细胞。
以记忆B细胞的Marker为例，以下图展示的就是查询的结果。可以查看记忆B细胞的常用人类和小鼠标记。
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