文章题目：Global
Phylogeography and Genomic Epidemiology of Carbapenem-Resistant blaOXA-232-CarryingKlebsiella pneumoniae Sequence Type 15
Lineage
文章链接：doi: 10.3201/eid2911.230463
发表时间：2023.11
发表期刊：Emerg Infect Dis
IF：7.2
研究背景：中国携带blaOXA-48样基因的K. pneumoniae流行率在2018-2022年表现为上升趋势。其院内暴发，包括儿科患者，引起了人们对blaOXA-48样CRKP分离株传播潜力的关注。blaOXA-232是blaOXA-48基因的一个变体，具有有限的碳青霉烯酶水解活性，于2011年在法国被首次发现。目前大多数blaOXA-232基因存在于小而非接合性的ColKP3型质粒上。在中国，已发现携带blaOXA-232的优势分型ST15介导低水平的碳青霉烯耐药，并且许多与毒力质粒共存。本文就blaOXA-232-carring K. pneumoniae的传播史、共同祖先、进化率和种群结构展开了研究。
研究对象：blaOXA-232-carring K. pneumoniae（21个分离株+309株NCBI参考株）
研究方法：药敏检测（AST）、全基因组测序（WGS）、接合转移实验、遗传背景分析、cgMLST、SNP、系统发育分析、贝叶斯分析、clade分组、有效种群大小轨迹分析
主要研究内容及结果：
1、临床和微生物学特征
2、基因组特征和质粒鉴定
图1 blaOXA-232-carring质粒的遗传环境对比分析
图2 KP3295 blaOXA-232-carring质粒（A）和毒力质粒（B）的比较基因组圈图
3、ST15谱系的出现与分化
图3 ST15 blaOXA-232-carring K. pneumoniae的cgMLST最小生成树
图4 ST15 blaOXA-232-carring K. pneumoniae的系统发育分析（A. 基于330个菌株重组过滤核心基因组、耐药基因、毒力基因的时间校准最大clade可信度贝叶斯系统发育；B. 基于种群结构的ST15菌株有效种群大小）
4、21世纪ST15流行病谱系的跨洲传播
图4 blaOXA-232-carring K. pneumoniae的时空传播轨迹图
文章结论
1、blaOXA-232基因可以通过转座元件ISEcp1整合到IncF-、IncHI1B-和IncFII型质粒上。
2、ColKP3型微质粒可以整合在更大质粒上，表明尽管ColKP3不能自主传播，但它可能在接合质粒的帮助下被动员。
2、ST15blaOXA-232-carring K. pneumoniae在全球范围内特别是中国发生克隆传播。
3、ST15blaOXA-232-carring K. pneumoniae最早可能起源于美国。
参考文献
Wu Y, Jiang T, He X, et al. Global Phylogeography and Genomic Epidemiology of Carbapenem-Resistant blaOXA-232–CarryingKlebsiella pneumoniae Sequence Type 15 Lineage [J]. Emerging Infectious Diseases, 2023, 29(11).
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