本套课程作为微生物菌群多样性和宏基因组测序研究的入门课，可以引导科研人员快速梳理结果数据，实用性强，具有很高的含金量。
（1）选对方法选对路：如何选择合适的测序方法？典型文章的设计思路是怎样的？可以怎么整合各类数据使文章更具有科研价值？
（2）深入浅出读懂α、β多样性：理解背后原理，学会灵活使用，避免误区。
（3）异常样本的识别与处理：如何判断和找出异常样本？如何合理处理异常样本？
（4）多组学关联分析与网络分析：提炼与升华，让文章和结果数据展示出更大的价值。
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（1）微生物菌群研究能做什么？
（2）微生物菌群研究方法？
（3）扩增子测序扩增区域选择
（4）菌群研究文章案例分享
（1）生物学重复生物学重复设置的作用和推荐数量
（2）物种注释结果解读（Unassigned、norank、unclassified如何理解）
（3）16S功能预测与宏基因组的区别
（4）α多样性的作用和指数选择
（5）β多样性的作用和方法选择
（6）分析结果不符合预期的原因和补救
（1）微生物菌群研究文章设计思路
（2）微生物菌群研究样本采集
（3）微生物菌群研究数据整合和结果呈现
（1）常见α多样性指数详解
（2）α多样性指数如何使用
（3）α多样性指数计算和可视化
（1）β多样性的概念
（2）距离算法选择
（3）β多样性结果可视化
（1）哪些环节可以判断异常样本
（2）如何处理异常样本
（3）如何避免异常样本的影响
（1）菌群研究常用组学研究方法
（2）多组学研究的优势和应用
（3）案例分析 扩增子+非靶向代谢组
（4）案例分析 宏基因组+宏转录组
（1）相关性网络概述
（2）相关性网络绘制方法
（3）案例分析 微生物类群的跨界相关性网络
（4）案例分析 微生物类群和耐药基因相关性网络
（5）案例分析 模块化相关性网络
