发文暴涨5倍，IF仍稳定14+！Advanced Science在割韭菜吗？湘雅医院团队：单细胞测序+肿瘤免疫细胞，顺利上分！

文摘 2024-11-05 10:00 上海

哈喽，亲爱的朋友们~好久没聊期刊了，这不，大海哥最近发现一本发文量猛涨的期刊——《Advanced Science》（中科院一区TOP，IF=14.3），

作为OA期刊中的战斗鸡，AS近几年发展势头还是比较凶猛的，短短五年，该刊的发文量几乎翻了5倍，目前已经突破2000篇/年（国人发文占比65%），甚至这几年IF一直高于Science子刊《Science Advanced》，颇具“黑马态势”！但是费用高达44482元软妹币。那么，照这样下去，AS会成为下一本高分水刊吗？你还会投吗？（PS：拿不准自己文章该投哪本期刊的朋友，可以滴滴大海哥，大海哥为您排忧解难~）PS：如果一个期刊，短时间内发文量暴增，那就得注意了，可能是“提桶跑路”式“割韭菜”，特别是还有较高“版面费”的那种，欢迎评论区留下你的观点~

虽然Advanced Science看似存在“割韭菜”的嫌疑，但其在2024年的JCR排名仍然保持在高位，反映出其在全球科研界的广泛认可和重要性。下面，大海哥分享一篇今年9月发表在该刊的单细胞测序文章，看下这个期刊的文章质量如何，供大家实际参考。

一直以来，肿瘤微环境都是生信研究的一个重量级热点，因此相应的在这一领域的研究也越来越卷，高分期刊也越来越难发。这篇中南大学湘雅医院研究团队最新发表的SCI为解决这一难题提供了新的思路，作者通过单细胞RNA测序等多种方法，深入探究肿瘤细胞的异质性及转移相关免疫细胞亚群的作用，揭示了SPP1 + TAM对口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移的调控作用及其机制。话不多说，接下来咱们就开始进入今天的主题，一起来研读这篇文章吧~

（Ps：单细胞测序可深入探究肿瘤免疫微环境中细胞的异质性，揭示细胞间的相互作用，挖掘潜在的生物标志物和治疗靶点，作为后续研究的“支点”。目前冲击高分甚至顶刊，少不了生信分析，有生信需求的朋友可以找大海哥聊聊~）

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l题目：SPP1+TAM通过重塑淋巴结微环境调控CXCR4转移相关肿瘤细胞的转移定植

l杂志：Advanced Science

l影响因子：IF=14.3

l发表时间：2024年9月

该研究旨在探究口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移的机制，通过对OSCC患者样本进行单细胞RNA测序分析，揭示了肿瘤细胞的异质性及转移相关免疫细胞亚群的作用，为理解肿瘤转移微环境机制及开发个性化治疗提供了基础。

该研究先对OSCC患者样本进行单细胞RNA测序，分析细胞组成和比例；再探究上皮细胞异质性、T细胞和B细胞功能变化、SPP1+ TAM的作用；最后分析SPP1+ TAM重塑淋巴结微环境的机制，还探讨了不同癌症中巨噬细胞的异质性。

1、OSCC转移微环境概况

对 6 名 OSCC 患者的样本进行单细胞 RNA 测序，共获得 56383 个细胞，分为 6 种细胞类型。与非转移淋巴结相比，转移淋巴结中髓样细胞和 B 细胞比例增加，T 细胞比例减少（图1）。

图1 OSCC患者淋巴结转移的单细胞景观，包括样本来源、细胞类型及分布等

2、CXCR4 + 恶性上皮细胞与淋巴结转移的关系

上皮细胞可分为 7 个簇，其中 CXCR4 + 上皮细胞在淋巴结转移中比例增加，其表达与肿瘤干细胞和转移相关。通过分析染色体拷贝数变异和基因表达，发现 CXCR4 + 恶性上皮细胞是淋巴结转移的特定亚群（图2）。

通过伪时间轨迹分析，发现恶性上皮细胞在 OSCC 中存在两种不同的进化过程，涉及雌激素受体驱动的肿瘤细胞进化和 KRAS 信号通路（图2）。

图2 上皮细胞的聚类分析、比例变化、信号通路富集以及基因表达情况等

3、T 细胞亚群在 MLN 和 NLN 中的转录谱变化

T 细胞可分为 9 个亚群，CD8 + T 细胞在 MLN 中可能处于激活和衰竭的过渡状态，CD4 + T 细胞在 MLN 中免疫调节功能可能受损（图3）。

图3 T 细胞亚群的聚类分析、基因表达以及相关功能评分等

4、SPP1 + TAM 在 OSCC 淋巴结转移中的积累

髓样细胞可分为 13 个亚群，其中 TAM1_SPP1 在转移性淋巴结中富集，具有高代谢水平，与肿瘤细胞的淋巴结转移相关（图4）。

图4 TAMs 的聚类分析、基因表达以及相关信号通路富集等

5、SPP1 + TAMs 重塑淋巴结微环境的机制

免疫组化和细胞通讯分析结果显示，SPP1 + TAMs 通过 CD155 - CD226 和 SPP1 - CD44 等配体-受体相互作用重塑淋巴结微环境，促进 CXCR4 + 恶性上皮细胞的趋化定植和存活（图5）。

图5 免疫组化和细胞通讯分析展示了 SPP1 + TAMs 对淋巴结微环境的影响

6、不同癌症中巨噬细胞在各种转移部位的异质性

整合肺癌和乳腺癌的转移数据，发现 TAM1_SPP1 在不同癌症的转移微环境中存在，但在肺癌和乳腺癌转移微环境中不是主要亚群，不同癌症中巨噬细胞具有功能多样性（图6）。

图6 不同癌症中巨噬细胞的分布和基因表达情况

不管Advanced Science是不是在“割韭菜”，咱们普通人能在AS这种级别的期刊发表论文都是值得骄傲的事情！正如这篇研究，作者基于单细胞RNA测序，以及简单实验验证，揭示了SPP1 + TAM对口腔鳞状细胞癌淋巴结转移的调控作用及其重塑淋巴结微环境的机制。这样一篇高性价比、又创新性满满的文章，怪不得发表在AS这样的顶刊上！目前冲击高分甚至顶刊，少不了生信分析，有生信需求的朋友可以找大海哥聊聊，为您提供更多新思路！

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