最近在查看后台小伙伴们的反馈时发现，想让老方重点出一期实验成本低，期刊接收快的“高分思路”！老方也深有感触，一年一度的年底考核又快到来啦，早早拿到文章确实可减少很多烦恼！诶你别说，老方这里还真有点眉目！目前单细胞挖掘就可为大家提供新的策略研究，并且再搭乘国自然热点“巨噬细胞”的顺风车，不仅深受顶刊“爱戴”，还能有助于各位宝子更加深刻的了解疾病机制！（巨噬细胞可是连续多年霸榜国自然，发文量也榜上有名，最重要的是它还适用于临床各领域研究！蹭着这波热点再结合自身研究，拿捏SCI当然不成问题啦~）言归正传，为了让宝子们能更加深入了解，老方特地找了一篇新疆医科大学团队发表的研究论文,该研究0实验发文不仅热度高，还仅用时30天就被接受录用啦！这么爽模板，快一起来站在“大佬”的肩膀上，找找思路与灵感吧~1. 研究方法创新：单细胞数据挖掘+巨噬细胞算是当下火热的技术手段，该研究只借助公共数据库，就阐明了不同心脏病的复杂机制，并为潜在的治疗策略提供了新见解，这极大的节省了实验成本与时间，普通科研团队也能玩得起噢~2. 研究结果可靠：本研究检查并整理了来自扩张型心肌病（DCM）、缺血性心肌病（ICM）、心肌梗死（MI）和心力衰竭（HF）的现有单细胞数据，样本量大。利用整合的单细胞转录组学和大量RNA-seq分析进一步揭示了对心脏病的分子机制的全面理解。PS：单细胞挖掘+巨噬细胞，简直是0实验的发文“黑科技”！如果你也想省时省力就发表高分SCI，那么选择老方准没错滴！老方在文章选题、数据分析以及实验设计等方面都拥有丰富的经验，我们能为您提供专业的建议与指导，助您早日圆满SCI！等你来噢~题目：基于组学整合的不同心脏病纤维化中巨噬细胞驱动基因的鉴定心肌纤维化是心脏病的标志，与巨噬细胞密切相关，但遗传病理生理学仍不完全清楚。因此本研究旨在利用整合的单细胞转录组学和大量RNA-seq分析来研究巨噬细胞与心肌纤维化在组学整合之间的关系。本研究从GEO数据库中检索了7个单细胞转录组数据集，包括DCM、ICM和HF，并使用细胞通讯、转录因子鉴定、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）和功能富集分析了整合数据，以阐明巨噬细胞极化和巨噬细胞到肌成纤维细胞转变（MMT）的驱动因素。此外从驱动因素、细胞分型、左心室辅助装置（LVAD）的抗纤维化性能的角度评估了单细胞数据的准确性，最后使用L1000FWD筛选候选药物。1. 不同疾病中成纤维细胞和巨噬细胞的表型及巨噬细胞促进纤维化的机制结果显示，与正常组相比，DCM、ICM、HF和MI患者的ECM受体相互作用和成纤维细胞的ECM显著激活。关于巨噬细胞，DCM和ICM患者的IFN-γ信号、脂多糖反应和细胞因子信号显著激活。细胞间通讯分析显示，在DCM中8个巨噬细胞簇向21个成纤维细胞簇释放FN1信号，而4个巨噬细胞簇通过SPP1信号参与与22个成纤维细胞簇的相互作用。研究结果显示，在DCM中接收促纤维化信号的成纤维细胞参与心肌纤维化的发生，而发送促纤维化信号的巨噬细胞显示出Toll样受体、TNF和ERK信号通路的广泛激活。hdWGCNA鉴定的基因被认为是驱动巨噬细胞表型转化的关键簇。基因共表达网络和富集分析表明，高表达枢纽基因位于内质网中，并与mRNA分解代谢、rRNA代谢和泛素化相关。鉴于巨噬细胞到肌成纤维细胞的转化（MMT）可以直接导致MF，因此观察到促纤维化巨噬细胞中的肌成纤维细胞标志物显著上调，而M1巨噬细胞标志物显著过表达。 在HF患者中，成纤维细胞表现出明显增加的整合素介导的细胞粘附、细胞-基质粘附和ECM相互作用（图3A）。增殖性巨噬细胞表现出PPAR信号、ECM和干扰素-γ信号的激活（图3B）。FOXO1和KLF6在坏死性巨噬细胞中表达增加（图3C）。基因表达分析表明，在坏死的巨噬细胞中，TLR4和RUNX1的表达量减少，而其他基因的表达量增加，这些基因参与了Toll样受体信号通路、单核细胞增殖和I型干扰素（图4F）。此外肌成纤维细胞标记物CD44也高度表达（图3G）。在MI患者接受促纤维化信号的成纤维细胞也表现出纤维化。HIF-1通路的激活也与纤维化的促进有关。巨噬细胞集群释放的致组织坏死分子可能与转录因子的高表达有关（图4）。由hdWGCNA确定的模块6是关键基因簇，使用四种算法确定了16个中枢基因。基因表达分析表明，所有枢纽基因在凋亡性巨噬细胞中均高表达，参与内质网应激和转录调控过程。此外肌成纤维细胞标志物和损伤性巨噬细胞的M1型标志物均在损伤性巨噬细胞中高表达。采用“sva”算法整合了六个数据集，在三个数据集中，DCM和ICM患者表现出上皮-间质转化（EMT）的激活以及IL-6-JAK-STAT3和TNF-α信号转导的抑制。与正常人相比，ATF3和CEBPD在DCM和ICM中均显著下调，而EGR1和 FOSB则在ICM中显著上调（图5）。对接受LVAD治疗的HF患者的单细胞数据进行了分析，共获得185,881个细胞，代表15种细胞类型（图6）。细胞比例显示，心肌细胞和单核细胞的比例下降，而T细胞和巨噬细胞的比例上升。LVAD治疗逆转了HF患者巨噬细胞的极化状态和MMT，为HF治疗提供了理论依据。根据驱动基因的表达模式，确定了五种药物。分子对接分析表明，五种药物以氢键形式与驱动基因结合。分子动力学模拟表明，四种药物与EEF1A1、RPS2和RPL7的结合稳定（图7），三种药物与RPS9的结合稳定，其中cinobufagin与所有蛋白的结合都很稳定。总之本研究提供了对心肌病、缺血性心脏病和HF的分子机制的全面理解，通过阐明病理生理过程和治疗干预，它为诊断生物标志物和靶向治疗的开发开辟了新的途径，最终改善了HF管理的患者预后。读完此篇，这思路是不是很赞啊？如果你也想0实验发表高分文章，但苦于找不到合适的研究思路，那么就快后台滴滴老方吧！相信老方定会让你的科研事业焕发新光彩，早日圆满SCI~老方会持续为大家带来最新生信思路，并提供免费思路评估、付费方案设计、生信分析、实验项目实施等服务，感兴趣的朋友可以扫码咨询！
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2、高分莫愁，多热点集结速上分！中南大学湘雅医院8分+SCI：孟德尔随机化+机器学习+单细胞，机制层层深扒！这个思路值得学习！
3、机器学习又整活儿了！中国医学科学院北京协和医学院9分+SCI：多组学+机器学习+泛癌，预后模型这么做，应用可真够广的！
