终于整理好了!宏基因组数据分析教程+软件+代码

学术   2024-08-18 11:37   江苏  

宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,以特定生境中的整个微生物群落为研究对象,采用高通量测序技术,获得环境微生物基因组信息总和,以研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路等。

宏基因组测序技术是进行微生物资源开发利用、加速微生态科研深度研究的重要手段。随着高通量测序技术的普及,越来越多的研究人员开始着手与宏基因组分析。为了让0基础学员也能掌握宏基因组的分析技能,暑假组学大讲堂将举办《微生物宏基因组分析实操》(南京站)线下交流会(8月22日-24日),软件、代码、资料永久免费,手把手教你宏基因组原始数据的分析。

下周一开课,扫描下方二维码即可报名:

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课程优势

优势1:内容丰富。从linux基础到测序数据处理,再到微生物宏基因组分析等主流分析内容一课尽揽。细节方面,本课程针对宿主的去除有详细的讲解。针对数据组装讲述了megahit,spades等软件。针对高级分析-分箱,我们的课程借助metawrap的优化模块,讲解了3种主流的分箱软件(metabat,maxbin,concoct),并讲解了如何通过GTDB数据库得到基因组物种注释和对应的进化树;
优势2:学习难度低。课程针对0基础学员设计,多年课程优化,尽量合并操作环节,分析代码已经封装好,整理好数据,复制粘贴即可分析自己的数据,边学边练,大大降低了学习难度;
优势3:分析不挑设备。采用先进的docker虚拟机去教学(国内首创),更换设备或者系统后分析步骤仍然基本一致,无需担心安装生信软件、配置分析环境等难题,真正的能学会,能用起来;
优势4:对个人电脑性能要求低。云服务器上教学,不用苦恼电脑配置不足、家庭版电脑系统不兼容问题,发送指令由服务器分析(非全部环节),自己电脑仍可正常办公;
优势5:长期售后无忧。建立了专门的生物信息知识问答社区,已经累计解决了上万个生信学习相关问题,结合学员QQ群持续为您学习提供技术支持;
优势6:出图颜值高。我们紧追最新宏基因组分析文献中图表呈现的新趋势,不断尝试新的绘图R包和程序,生成了更炫并且信息量更多的图表,可以直接用于文章撰写。下图为本课程实际生成图片

本期课表如下:

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常见问题解答

1. 集中3天培训是否可以学完这么多内容?

答:多年课程制作经验,尽量合并操作环节,分析代码已经封装好,整理好数据,复制粘贴即可分析自己的数据,大大降低了分析难度,3天完全可以学完以上分析内容。

2. 培训后提供回放吗?

答:线下培训结束,不是学习的结束,课后可以获得回放视频,年内不限次观看,问答社区提供永久答疑服务。分析所用软件、代码、课件、笔记均会提供,另外赠送组学大讲堂云服务器3个月的使用权限,学员课后仍可方便的进行练习。

3. 培训的时候是在云服务器上,如果换了设备,分析步骤还一样吗?

答:组学大讲堂培训采用先进的docker虚拟机,无论在什么设备上,凡是使用我们提供的镜像,均可保持一致的操作环境,真正的能学会,能用起来。

4. 能否提供发票?

答:由北京组学生物科技有限公司提供正规发票。

举办时间、费用、报名方式

1. 举办时间:2024年8月22日-8月24日(三天),每天授课7-8小时。

2. 培训地点:江苏南京线下培训。

3. 培训费用:
原价3980元/人;限时优惠3780元/人;
优惠信息:
① 团报优惠:2人及以上额外优惠200元/人;
② 赠送价值700元组学大讲堂云服务器3个月使用权;
③ 赠送价值1498元《微生物宏基因组分析实操》录播课程;
④ 已购买过对应录播课程的学员,可以按实际购买价折现予以优惠。

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组学大讲堂暑假系列培训


2024年暑假线下培训班安排如下:

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根际互作生物学研究室是沈其荣院士土壤微生物与有机肥团队下的一个关注于根际互作的研究小组。本小组由袁军教授带领,主要关注:1.植物和微生物互作在抗病过程中的作用 2 环境微生物大数据整合研究3 环境代谢组及其与微生物过程研究体系开发
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