哈喽大家好,敬业的大麦又来啦!不知不觉冬季即将来临,又到了各位宝子冲击KPI的关键时刻,同时有很多的粉丝朋友也在后台向大麦咨询最新最热的“高分模板”!大麦被大家的热情所打动,因此加班加点的为大家查文献找热点~
这不,今天大麦就来与宝子们聊聊中医药方向如何省时省力发高分?相信很多宝子心中已经有答案了,对,中医药发文最快的莫属“网药分析”啦!那么网药发文最重要的因素是什么?认真听!重点就是思路!思路拿捏好,高分少不了!网络药理学可以阐明了中药治疗各种综合征和现代疾病的机制,已经有越来越多的临床科研工作者通过网络药理学+湿实验的方式用于探索传统中药治疗疾病的作用机制,并且发文分数还不低,深受审稿人喜欢!
今天大麦就推荐一篇贵州中医药大学团队发表的网药研究论文,该研究采用网络药理学、分子对接和实验验证来确定穿心莲(AP)治疗日光性皮炎(SD)的活性成分、可能的靶点和相关的生物途径。该研究思路清晰,研究内容干湿结合,且复现难度低,真可谓是中医药SCI高分模版啊!
1. 研究性价比高:本研究通过数据挖掘,整合药物成分、靶点以及疾病的靶点,并利用网络药理学与分子对接技术对成分以及靶点进行进一步分析,得到筛选枢纽基因,研究逻辑层层递进!(PS:看到了吧,中医药也能省时省力发高分,只要合理利用网药等生信手段,即可轻松拿下一区SCI,这福利你不心动嘛?)
2. 研究结果可靠:本研究同时还通过体内外多种实验进行结果验证,极大的增强了研究结果的可靠性,有助于进一步的药物开发!
PS:对网药感兴趣并想短期发表高分SCI的小伙伴们可以借鉴本文思路哦!如果你想复现此类文章,但苦于缺乏好的思路,那么快来联系大麦吧!这里有一大波可复现的创新思路,机不可失,快来领取吧~
定制生信分析
云服务器租赁
(加微信备注99领取试用)
题目:基于网络药理学、分子对接和实验验证,揭示穿心莲对抗日光性皮炎的作用机制
杂志:Phytomedicine
影响因子:IF =6.7
发表时间:2024年9月7日
研究背景
日光性皮炎(SD)是一种由紫外线照射引起的急性破坏性皮肤炎症。因此新型抗SD治疗剂的发现至关重要。穿心莲(AP)是一种药用植物,具有广泛的药理作用。越来越多的证据表明AP对SD具有潜在的治疗作用。然而AP对SD的治疗机制尚未完全阐明。
研究方法及数据来源
本研究分别从数据库中筛选出AP相关活性成分及其潜在靶点,并收集SD的潜在治疗靶点。然后建立了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、化合物-靶点-疾病(D-C-T-D),以确定AP对抗SD的主要成分和核心靶点。接下来通过AP的David数据库鉴定GO和KEGG通路在SD治疗中的作用,使用分子对接估计组分与枢纽基因之间的结合力。随后使用HaCaT角质形成细胞作为体外模型,并建立了UVB照射的ICR小鼠的背侧皮肤作为体内模型,以验证其作用机制。
研究结果
1. AP的活性化合物筛选和靶标预测
在TCMSP数据库中共检索到AP中的49种化合物,根据OB、DL初步筛选出24种生物活性化合物。鉴于这些成分主要通过调节其靶点来发挥药理作用,因此应用Swiss Target Prediction来预测24种生物活性成分的相关靶点,最终获得总共472个目标。
2. 日光性皮炎复合治疗的潜在靶点
将检索到的结果整合从Gene Cards、Drug Bank和OMIM数据库中获得SD相关靶点共403个目标。使用潜在靶点和SD相关靶点构建维恩图,得到65个常见靶点(图1)。然后使用STRING数据库和Cytoscape3.8.2获得的靶标的PPI网络。结果显示AKT1、TNF-α等因子占据PPI网络的核心位置,被认为是AP抗SD的枢纽基因。
图1. 化合物靶标、SD靶标和维恩图的重叠靶标
3. GO和KEGG通路富集分析
使用DAVID软件对AP干预SD相关靶点的活性成分进行GO和KEGG富集分析,并将结果可视化,获得了107个富集条目。选择BP、CC和MF中的前10个术语,并将其绘制在柱状图中(图2)。KEGG通路前20个潜在的信号通路以气泡图表示,结果显示PI3K-Akt信号通路中的基因最富集。
图2. AP治疗SD靶点的GO富集分析
4. 分子对接分析
本研究选定的前五个核心靶点与前五个核心组分对接,结果显示主要成分和hub基因具有良好的结合活性。WG和hub基因的结合能最低,表明WG的结合能力最强(图3)。
图3. 化学成分与目标的分子对接图
5. WG对UVB诱导的HaCat细胞的保护作用
CCK-8结果显示WG抑制HaCat细胞的增殖,并且呈浓度依赖性关系。WG在浓度高于12.5 μM时显著抑制HaCat细胞的增殖(图4A)。UVB诱导的HaCat细胞可以以剂量相关的方式受到WG的保护。此外WG-H组与MTX组没有显著差异(图4B)。UVB诱导的日光性皮炎以剂量依赖性方式受到WG的保护。
图4. WG抑制HaCat细胞的细胞增殖
6. WG给药下调SD小鼠PI3K-AKT信号通路的激活
KEGG通路显示,PI3K-AKT通路中富集的基因最多。因此假设WG治疗SD可能作用于PI3K-AKT通路。为了研究WG抑制SD的潜在机制,检测了PI3K-AKT通路中的相关蛋白和磷酸化。与UVB诱导组相比,WG有效降低了PI3K、AKT的磷酸化杠杆,表明WG通过抑制PI3K-AKT信号通路的激活对日光性皮炎发挥治疗作用(图5)。
图5. WB测定法检测蛋白表达
文章总结
本研究基于网络药理学方法,筛选出主要活性成分WG和枢纽基因,分子对接验证了主要成分与枢纽基因结合的可能性。体内外验证研究结果也进一步证实了药理学筛选结果和分子机制预测的可靠性和准确性,表明AP可能治疗SD。读完此篇,宝子们是不是又对中医药发文有了新想法啦?只要换个思路,省时省力也能轻松拿下SCI,简直太香啦!如果你也对此感兴趣,那还等什么,快来联系大麦吧,大麦定助您圆梦SCI~
推荐阅读
国产数据库强势崛起!中国人发文就要用自己的数据库!暨南大学团队:CHARLS+CFPS数据库“双剑合璧”,3图拿下1区11+!
NHANES数据库愈战越勇!Redox Biol 审稿快到飞起!恭喜广州医科大白岩森团队纯分析斩获10分+SCI,1个月就接收~
大麦有话说
大麦还提供服务器租赁、思路设计、定制生信分析、文献思路复现、临床数据库挖掘;有需要的小伙伴欢迎直接扫码咨询大麦,竭诚为您的科研助力!