构建合成细胞是 21 世纪最大的科学和技术挑战之一。在荷兰大型国家计划 (EVOLF，https://www.evolf.life ) 和欧洲博士网络 (ComeInCell，https://www.comeincell.org ) 的框架内，我们在荷兰格罗宁根大学的格罗宁根生物分子科学与生物技术研究所 ( https://www.rug.nl/research/gbb )为生物物理学家、生物工程师、生物化学家和分子生物学家提供 12 个博士/博士后职位。
这些职位分为五个不同的研究小组，用于计算研究或实验研究：（i）通过实验重建代谢能量和细胞构件合成的反应网络；（ii）构建用于自主操作和生长的合成细胞状系统；或（iii）开发不同复杂程度的计算模型来生成合成细胞的设计。
职位
普尔曼小组( https://membraneenzymology.com )
职位 1：反应网络的设计和构建。我们将在细菌大小的囊泡中整合生命所必需的代谢模块。进一步阅读：doi：10.1038/s41467-024-52085-z
位置 2：合成细胞中的膜扩张。我们将通过将脂质运输与脂质合成和体积调节相结合来扩张类细胞系统的膜。进一步阅读：doi：10.1021/acssynbio.4c00073
职位 3：代谢模块的进化和整合。我们将通过基因组设计、选择、性能筛选和 AI 来进化和耦合反应网络。进一步阅读：doi.org/10.21203/rs.3.rs-3990950/v1
职位 4： 合成细胞中反应网络的区室化和空间分布。我们将利用生物分子凝聚物的特性来提高燃料供应和结构单元合成反应网络的效率。进一步阅读：doi：10.1038/s42003-024-06216-3
位置 5：膜扩张与凝聚物。我们将结合主动膜扩张与合成 RNA 凝聚物的表达，以设计复杂的重构事件，例如吞噬、胞吐、膜破裂和/或裂变。进一步阅读： doi：10.1126/sciadv.abd7697
海涅曼集团（ www.heinemannlab.eu）
职位 6：为了给合成细胞配备 ATP、NADH 和氨基酸，我们将在囊泡中建立合成的、自下而上的糖酵解。我们将在体外逐步组装功能性糖酵解途径并对其进行优化。为此，我们将使用高端质谱分析以及该小组先前开发的糖酵解数学模型。
位置 7：为了使合成细胞具备 ATP、NADH 和氨基酸，我们将在囊泡中建立合成的、自下而上的糖酵解。我们将为该途径设计一个合成操纵子，并通过体内进化对其进行优化。我们将分步在质粒上构建这种合成操纵子，并删除大肠杆菌染色体上的相应基因。我们将使用进化和靶向基因突变策略来优化质粒表达的途径。
Slotboom 小组(https://membraneenzymology.com)
位置 8：为了使合成细胞具备多种代谢途径，需要创新的重建和组织方法。我们将探索蛋白质支架、膜结合和无膜隔室、合理和基于 AI 的工程，以在同一合成细胞中通过多种途径获得有效的通量。https://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00062
位置 9：为了使合成细胞具备膜相关过程（例如溶质运输），需要膜蛋白插入机制。我们将使用生化和生物物理分析确定最小插入机制并对其进行优化，以便有效插入功能性转运蛋白。doi：10.1093/synbio/ysae007
卡门茨集团（kamenzlab.com）
位置 10：要使合成细胞不断分裂，细胞生长和细胞分裂必须受到严格调控并在时间上分开。我们将结合蛋白质生物化学、定向进化和数学建模来开发合成振荡器和必要的控制模块，以驱动细胞生长和分裂的周期性循环。进一步阅读：https ://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2796343/
Marrink 集团 (cgmartini.nl)
位置 11：细胞分裂的多尺度建模，探索脂质和蛋白质之间的相互作用，以合理设计人工细胞的有效分裂。进一步阅读： https
位置 12：最小细胞的分子动力学模拟，重点关注细胞包膜的特性和组织。进一步阅读：https ://doi.org/10.3389/fchem.2023.1106495
要求
• 热情、卓越、致力于研究和团队精神是我们的主要选择标准。
• 教育背景最好是生物化学、生物工程、生物物理学、分子生物学或类似领域。
• 申请攻读博士学位的候选人需要已获得硕士学位（或同等学历）。博士后候选人需要已获得博士学位。
• 出色的英语水平。
状况
每个职位可以由博士生（四年合同）或博士后（三年合同）担任。工资将与经验相称，并包括丰厚的附加福利待遇。入职日期灵活。但首选入职日期为 2025 年前六个月。
如何申请
要申请一个（或多个）职位，请通过电子邮件将简历（包括您的动机、研究兴趣和成就的简要描述）发送至EVOLF@RUG.NL ，并附上两封来自前任顾问/教授的推荐信。推荐信也可以由您的前任顾问直接发送。请注明您申请哪个职位。申请截止日期：2024 年 12 月 1 日。
https://www.nature.com/naturecareers/job/12830433/12-phd-post-doc-positions-for-the-design-and-engineering-of-synthetic-cells-/#application-form
